RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491917.1

PIEZO1-210, Transcript of piezo type mechanosensitive ion channel component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PIEZO1, Length 406 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIEZO1-210ENST00000491917 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.48■■■■■ 6.63
PIEZO1-210ENST00000491917 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.62■■■■■ 5.69
PIEZO1-210ENST00000491917 ABCC9O60706 1549 aa50.41■■■■■ 5.66
PIEZO1-210ENST00000491917 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.04■■■■■ 5.28
PIEZO1-210ENST00000491917 NACADO15069 1562 aa47.75■■■■■ 5.24
PIEZO1-210ENST00000491917 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.52■■■■■ 5.2
PIEZO1-210ENST00000491917 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.14■■■■■ 5.14
PIEZO1-210ENST00000491917 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.06■■■■■ 5.12
PIEZO1-210ENST00000491917 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.05■■■■■ 5.12
PIEZO1-210ENST00000491917 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.93■■■■■ 5.1
PIEZO1-210ENST00000491917 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.89■■■■■ 5.1
PIEZO1-210ENST00000491917 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.69■■■■■ 5.07
PIEZO1-210ENST00000491917 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.64■■■■■ 5.06
PIEZO1-210ENST00000491917 SCRIBQ14160 1630 aa46.17■■■■■ 4.98
PIEZO1-210ENST00000491917 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46■■■■■ 4.95
PIEZO1-210ENST00000491917 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.55■■■■■ 4.88
PIEZO1-210ENST00000491917 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.5■■■■■ 4.87
PIEZO1-210ENST00000491917 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.36■■■■■ 4.85
PIEZO1-210ENST00000491917 NCAPD3P42695 1498 aa44.07■■■■■ 4.65
PIEZO1-210ENST00000491917 SMARCA4P51532 1647 aa44.05■■■■■ 4.64
PIEZO1-210ENST00000491917 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44■■■■■ 4.63
PIEZO1-210ENST00000491917 SMARCA2P51531 1590 aa43.88■■■■■ 4.61
PIEZO1-210ENST00000491917 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.82■■■■■ 4.61
PIEZO1-210ENST00000491917 HMGXB3Q12766 1538 aa43.8■■■■■ 4.6
PIEZO1-210ENST00000491917 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.59■■■■■ 4.57
PIEZO1-210ENST00000491917 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
PIEZO1-210ENST00000491917 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.55■■■■■ 4.56
PIEZO1-210ENST00000491917 ERCC6Q03468 1493 aa43.47■■■■■ 4.55
PIEZO1-210ENST00000491917 NESP48681 1621 aa43.38■■■■■ 4.54
PIEZO1-210ENST00000491917 CUX2O14529 1486 aa43.29■■■■■ 4.52
PIEZO1-210ENST00000491917 WIZO95785 1651 aa43.07■■■■■ 4.49
PIEZO1-210ENST00000491917 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.07■■■■■ 4.48
PIEZO1-210ENST00000491917 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.98■■■■■ 4.47
PIEZO1-210ENST00000491917 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
PIEZO1-210ENST00000491917 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.86■■■■■ 4.45
PIEZO1-210ENST00000491917 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.77■■■■■ 4.44
PIEZO1-210ENST00000491917 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.73■■■■■ 4.43
PIEZO1-210ENST00000491917 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
PIEZO1-210ENST00000491917 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.39
PIEZO1-210ENST00000491917 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.44■■■■■ 4.38
PIEZO1-210ENST00000491917 WDR62O43379 1518 aa42.35■■■■■ 4.37
PIEZO1-210ENST00000491917 CFTRP13569 1480 aa42.32■■■■■ 4.37
PIEZO1-210ENST00000491917 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.31■■■■■ 4.36
PIEZO1-210ENST00000491917 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.29■■■■■ 4.36
PIEZO1-210ENST00000491917 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.01■■■■■ 4.32
PIEZO1-210ENST00000491917 PRDM2Q13029 1718 aa41.99■■■■■ 4.31
PIEZO1-210ENST00000491917 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
PIEZO1-210ENST00000491917 TOPBP1Q92547 1522 aa41.53■■■■■ 4.24
PIEZO1-210ENST00000491917 IFT140Q96RY7 1462 aa41.43■■■■■ 4.22
PIEZO1-210ENST00000491917 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
PIEZO1-210ENST00000491917 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.4■■■■■ 4.22
PIEZO1-210ENST00000491917 ABCC8Q09428 1581 aa41.37■■■■■ 4.21
PIEZO1-210ENST00000491917 OSCARQ8IYS5 282 aa41.3■■■■■ 4.2
PIEZO1-210ENST00000491917 TRIM41Q8WV44 630 aa41.24■■■■■ 4.19
PIEZO1-210ENST00000491917 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
PIEZO1-210ENST00000491917 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
PIEZO1-210ENST00000491917 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
PIEZO1-210ENST00000491917 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.03■■■■■ 4.163e-8■■□□□ 13.2
PIEZO1-210ENST00000491917 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.97■■■■■ 4.15
PIEZO1-210ENST00000491917 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
PIEZO1-210ENST00000491917 CUX1P39880 1505 aa40.92■■■■■ 4.14
PIEZO1-210ENST00000491917 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.9■■■■■ 4.14
PIEZO1-210ENST00000491917 SOGA1O94964 1423 aa40.89■■■■■ 4.14
PIEZO1-210ENST00000491917 CHD1O14646 1710 aa40.87■■■■■ 4.13
PIEZO1-210ENST00000491917 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.86■■■■■ 4.13
PIEZO1-210ENST00000491917 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.86■■■■■ 4.13
PIEZO1-210ENST00000491917 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.86■■■■■ 4.13
PIEZO1-210ENST00000491917 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
PIEZO1-210ENST00000491917 ARHGEF11O15085 1522 aa40.74■■■■■ 4.11
PIEZO1-210ENST00000491917 WDR97A6NE52 1622 aa40.71■■■■■ 4.11
PIEZO1-210ENST00000491917 FBLN2P98095 1184 aa40.67■■■■■ 4.1
PIEZO1-210ENST00000491917 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.64■■■■■ 4.1
PIEZO1-210ENST00000491917 GRIN2BQ13224 1484 aa40.52■■■■■ 4.08
PIEZO1-210ENST00000491917 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.07
PIEZO1-210ENST00000491917 PBRM1Q86U86 1689 aa40.46■■■■■ 4.07
PIEZO1-210ENST00000491917 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.42■■■■■ 4.06
PIEZO1-210ENST00000491917 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.42■■■■■ 4.06
PIEZO1-210ENST00000491917 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.39■■■■■ 4.06
PIEZO1-210ENST00000491917 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
PIEZO1-210ENST00000491917 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.38■■■■■ 4.06
PIEZO1-210ENST00000491917 SYNJ2O15056 1496 aa40.38■■■■■ 4.05
PIEZO1-210ENST00000491917 ARAP1Q96P48 1450 aa40.37■■■■■ 4.05
PIEZO1-210ENST00000491917 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.36■■■■■ 4.05
PIEZO1-210ENST00000491917 SYNJ1O43426 1573 aa40.34■■■■■ 4.05
PIEZO1-210ENST00000491917 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.32■■■■■ 4.05
PIEZO1-210ENST00000491917 TOP2BQ02880 1626 aa40.31■■■■■ 4.04
PIEZO1-210ENST00000491917 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.28■■■■■ 4.04
PIEZO1-210ENST00000491917 ADAMTS12P58397 1594 aa40.08■■■■■ 4.01
PIEZO1-210ENST00000491917 GRIN2AQ12879 1464 aa40.03■■■■■ 4
PIEZO1-210ENST00000491917 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.91■■■■□ 3.98
PIEZO1-210ENST00000491917 CEP170Q5SW79 1584 aa39.91■■■■□ 3.98
PIEZO1-210ENST00000491917 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.9■■■■□ 3.98
PIEZO1-210ENST00000491917 NUP160Q12769 1436 aa39.88■■■■□ 3.97
PIEZO1-210ENST00000491917 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
PIEZO1-210ENST00000491917 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.8■■■■□ 3.96
PIEZO1-210ENST00000491917 SHROOM2Q13796 1616 aa39.71■■■■□ 3.95
PIEZO1-210ENST00000491917 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.51■■■■□ 3.92
PIEZO1-210ENST00000491917 KIF27Q86VH2 1401 aa39.48■■■■□ 3.91
PIEZO1-210ENST00000491917 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
PIEZO1-210ENST00000491917 IGF1RP08069 1367 aa39.44■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms