RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491293.1

C1orf35-206, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf35, Length 854 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-206ENST00000491293 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.8■■■■■ 7.16
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C1orf35-206ENST00000491293 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.04■■■■■ 5.6
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C1orf35-206ENST00000491293 SCRIBQ14160 1630 aa48.54■■■■■ 5.36
C1orf35-206ENST00000491293 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.82■■■■■ 5.25
C1orf35-206ENST00000491293 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.46■■■■■ 5.19
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C1orf35-206ENST00000491293 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.33■■■■■ 5.17
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C1orf35-206ENST00000491293 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.18■■■■■ 4.98
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C1orf35-206ENST00000491293 SMARCA2P51531 1590 aa45.98■■■■■ 4.95
C1orf35-206ENST00000491293 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.84■■■■■ 4.93
C1orf35-206ENST00000491293 HMGXB3Q12766 1538 aa45.78■■■■■ 4.92
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C1orf35-206ENST00000491293 NESP48681 1621 aa45.24■■■■■ 4.83
C1orf35-206ENST00000491293 CUX2O14529 1486 aa45.15■■■■■ 4.82
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C1orf35-206ENST00000491293 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.83■■■■■ 4.77
C1orf35-206ENST00000491293 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.8■■■■■ 4.76
C1orf35-206ENST00000491293 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.66■■■■■ 4.74
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C1orf35-206ENST00000491293 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
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C1orf35-206ENST00000491293 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.59■■■■■ 4.73
C1orf35-206ENST00000491293 CFTRP13569 1480 aa44.51■■■■■ 4.72
C1orf35-206ENST00000491293 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.27■■■■■ 4.68
C1orf35-206ENST00000491293 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.22■■■■■ 4.67
C1orf35-206ENST00000491293 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.16■■■■■ 4.66
C1orf35-206ENST00000491293 WDR62O43379 1518 aa44.07■■■■■ 4.65
C1orf35-206ENST00000491293 PRDM2Q13029 1718 aa43.94■■■■■ 4.62
C1orf35-206ENST00000491293 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
C1orf35-206ENST00000491293 TOPBP1Q92547 1522 aa43.57■■■■■ 4.56
C1orf35-206ENST00000491293 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.44■■■■■ 4.54
C1orf35-206ENST00000491293 ABCC8Q09428 1581 aa43.41■■■■■ 4.54
C1orf35-206ENST00000491293 CUX1P39880 1505 aa43.29■■■■■ 4.52
C1orf35-206ENST00000491293 TRIM41Q8WV44 630 aa43.26■■■■■ 4.52
C1orf35-206ENST00000491293 OSCARQ8IYS5 282 aa43.25■■■■■ 4.51
C1orf35-206ENST00000491293 IFT140Q96RY7 1462 aa43.23■■■■■ 4.51
C1orf35-206ENST00000491293 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.2■■■■■ 4.51
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C1orf35-206ENST00000491293 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.13■■■■■ 4.49
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C1orf35-206ENST00000491293 SOGA1O94964 1423 aa43.06■■■■■ 4.48
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C1orf35-206ENST00000491293 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.78■■■■■ 4.44
C1orf35-206ENST00000491293 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.64■■■■■ 4.42
C1orf35-206ENST00000491293 WDR97A6NE52 1622 aa42.64■■■■■ 4.42
C1orf35-206ENST00000491293 FBLN2P98095 1184 aa42.6■■■■■ 4.41
C1orf35-206ENST00000491293 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.59■■■■■ 4.41
C1orf35-206ENST00000491293 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.59■■■■■ 4.41
C1orf35-206ENST00000491293 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.59■■■■■ 4.41
C1orf35-206ENST00000491293 CHD1O14646 1710 aa42.53■■■■■ 4.4
C1orf35-206ENST00000491293 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.52■■■■■ 4.4
C1orf35-206ENST00000491293 ARHGEF11O15085 1522 aa42.48■■■■■ 4.39
C1orf35-206ENST00000491293 GRIN2BQ13224 1484 aa42.48■■■■■ 4.39
C1orf35-206ENST00000491293 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.48■■■■■ 4.39
C1orf35-206ENST00000491293 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.44■■■■■ 4.38
C1orf35-206ENST00000491293 PBRM1Q86U86 1689 aa42.32■■■■■ 4.37
C1orf35-206ENST00000491293 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
C1orf35-206ENST00000491293 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.29■■■■■ 4.36
C1orf35-206ENST00000491293 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
C1orf35-206ENST00000491293 SYNJ2O15056 1496 aa42.19■■■■■ 4.34
C1orf35-206ENST00000491293 ARAP1Q96P48 1450 aa42.08■■■■■ 4.33
C1orf35-206ENST00000491293 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.08■■■■■ 4.33
C1orf35-206ENST00000491293 KIF27Q86VH2 1401 aa42.05■■■■■ 4.32
C1orf35-206ENST00000491293 ADAMTS12P58397 1594 aa42.05■■■■■ 4.32
C1orf35-206ENST00000491293 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.01■■■■■ 4.32
C1orf35-206ENST00000491293 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.01■■■■■ 4.32
C1orf35-206ENST00000491293 IGF1RP08069 1367 aa42■■■■■ 4.31
C1orf35-206ENST00000491293 GRIN2AQ12879 1464 aa41.95■■■■■ 4.31
C1orf35-206ENST00000491293 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.89■■■■■ 4.3
C1orf35-206ENST00000491293 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
C1orf35-206ENST00000491293 NUP160Q12769 1436 aa41.78■■■■■ 4.28
C1orf35-206ENST00000491293 CEP170Q5SW79 1584 aa41.77■■■■■ 4.28
C1orf35-206ENST00000491293 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.71■■■■■ 4.27
C1orf35-206ENST00000491293 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.66■■■■■ 4.26
C1orf35-206ENST00000491293 CUL7Q14999 1698 aa41.64■■■■■ 4.26
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