RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491053.5

USP20-206, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 5

Gene USP20, Length 590 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-206ENST00000491053 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.91■■■■□ 3.98
USP20-206ENST00000491053 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.54■■■■□ 3.28
USP20-206ENST00000491053 ABCC9O60706 1549 aa34.5■■■■□ 3.11
USP20-206ENST00000491053 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.35■■■□□ 2.93
USP20-206ENST00000491053 NACADO15069 1562 aa33.34■■■□□ 2.93
USP20-206ENST00000491053 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
USP20-206ENST00000491053 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.22■■■□□ 2.91
USP20-206ENST00000491053 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.14■■■□□ 2.9
USP20-206ENST00000491053 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.1■■■□□ 2.89
USP20-206ENST00000491053 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.63■■■□□ 2.81
USP20-206ENST00000491053 SCRIBQ14160 1630 aa32.31■■■□□ 2.76
USP20-206ENST00000491053 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.29■■■□□ 2.76
USP20-206ENST00000491053 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.19■■■□□ 2.74
USP20-206ENST00000491053 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.08■■■□□ 2.73
USP20-206ENST00000491053 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.5■■■□□ 2.63
USP20-206ENST00000491053 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
USP20-206ENST00000491053 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.29■■■□□ 2.6
USP20-206ENST00000491053 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.02■■■□□ 2.56
USP20-206ENST00000491053 SMARCA4P51532 1647 aa30.97■■■□□ 2.55
USP20-206ENST00000491053 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
USP20-206ENST00000491053 SMARCA2P51531 1590 aa30.77■■■□□ 2.52
USP20-206ENST00000491053 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.73■■■□□ 2.51
USP20-206ENST00000491053 NCAPD3P42695 1498 aa30.72■■■□□ 2.51
USP20-206ENST00000491053 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.71■■■□□ 2.51
USP20-206ENST00000491053 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.71■■■□□ 2.51
USP20-206ENST00000491053 HMGXB3Q12766 1538 aa30.63■■■□□ 2.49
USP20-206ENST00000491053 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
USP20-206ENST00000491053 WIZO95785 1651 aa30.42■■■□□ 2.46
USP20-206ENST00000491053 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
USP20-206ENST00000491053 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
USP20-206ENST00000491053 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.94■■■□□ 2.38
USP20-206ENST00000491053 NESP48681 1621 aa29.88■■■□□ 2.37
USP20-206ENST00000491053 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.8■■■□□ 2.36
USP20-206ENST00000491053 ERCC6Q03468 1493 aa29.77■■■□□ 2.36
USP20-206ENST00000491053 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.72■■■□□ 2.35
USP20-206ENST00000491053 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.7■■■□□ 2.34
USP20-206ENST00000491053 CFTRP13569 1480 aa29.68■■■□□ 2.34
USP20-206ENST00000491053 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.63■■■□□ 2.33
USP20-206ENST00000491053 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
USP20-206ENST00000491053 PRDM2Q13029 1718 aa29.6■■■□□ 2.33
USP20-206ENST00000491053 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
USP20-206ENST00000491053 CUX2O14529 1486 aa29.48■■■□□ 2.31
USP20-206ENST00000491053 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.47■■■□□ 2.31
USP20-206ENST00000491053 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.45■■■□□ 2.31
USP20-206ENST00000491053 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.38■■■□□ 2.29
USP20-206ENST00000491053 WDR62O43379 1518 aa29.3■■■□□ 2.28
USP20-206ENST00000491053 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
USP20-206ENST00000491053 ABCC8Q09428 1581 aa29.09■■■□□ 2.25
USP20-206ENST00000491053 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.03■■■□□ 2.24
USP20-206ENST00000491053 TOPBP1Q92547 1522 aa29.02■■■□□ 2.24
USP20-206ENST00000491053 IFT140Q96RY7 1462 aa28.83■■■□□ 2.21
USP20-206ENST00000491053 CUX1P39880 1505 aa28.82■■■□□ 2.2
USP20-206ENST00000491053 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
USP20-206ENST00000491053 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
USP20-206ENST00000491053 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.71■■■□□ 2.19
USP20-206ENST00000491053 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.68■■■□□ 2.18
USP20-206ENST00000491053 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
USP20-206ENST00000491053 TOP2BQ02880 1626 aa28.65■■■□□ 2.18
USP20-206ENST00000491053 SOGA1O94964 1423 aa28.63■■■□□ 2.17
USP20-206ENST00000491053 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
USP20-206ENST00000491053 SYNJ1O43426 1573 aa28.6■■■□□ 2.17
USP20-206ENST00000491053 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.59■■■□□ 2.17
USP20-206ENST00000491053 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
USP20-206ENST00000491053 WDR97A6NE52 1622 aa28.59■■■□□ 2.17
USP20-206ENST00000491053 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.48■■■□□ 2.15
USP20-206ENST00000491053 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.46■■■□□ 2.15
USP20-206ENST00000491053 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
USP20-206ENST00000491053 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.38■■■□□ 2.13
USP20-206ENST00000491053 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.37■■■□□ 2.13
USP20-206ENST00000491053 PBRM1Q86U86 1689 aa28.34■■■□□ 2.13
USP20-206ENST00000491053 GRIN2BQ13224 1484 aa28.33■■■□□ 2.13
USP20-206ENST00000491053 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.33■■■□□ 2.13
USP20-206ENST00000491053 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
USP20-206ENST00000491053 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.25■■■□□ 2.11
USP20-206ENST00000491053 CHD1O14646 1710 aa28.23■■■□□ 2.11
USP20-206ENST00000491053 OSCARQ8IYS5 282 aa28.2■■■□□ 2.1
USP20-206ENST00000491053 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.16■■■□□ 2.1
USP20-206ENST00000491053 SYNJ2O15056 1496 aa28.14■■■□□ 2.09
USP20-206ENST00000491053 ADAMTS12P58397 1594 aa28.09■■■□□ 2.09
USP20-206ENST00000491053 KIF27Q86VH2 1401 aa28.09■■■□□ 2.09
USP20-206ENST00000491053 FBLN2P98095 1184 aa28.07■■■□□ 2.08
USP20-206ENST00000491053 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
USP20-206ENST00000491053 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.01■■■□□ 2.08
USP20-206ENST00000491053 TRIM41Q8WV44 630 aa28.01■■■□□ 2.07
USP20-206ENST00000491053 CUL7Q14999 1698 aa27.96■■■□□ 2.07
USP20-206ENST00000491053 GRIN2AQ12879 1464 aa27.95■■■□□ 2.07
USP20-206ENST00000491053 IGF1RP08069 1367 aa27.91■■■□□ 2.06
USP20-206ENST00000491053 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.91■■■□□ 2.06
USP20-206ENST00000491053 NUP160Q12769 1436 aa27.84■■■□□ 2.05
USP20-206ENST00000491053 CEP170Q5SW79 1584 aa27.82■■■□□ 2.04
USP20-206ENST00000491053 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.78■■■□□ 2.04
USP20-206ENST00000491053 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.78■■■□□ 2.04
USP20-206ENST00000491053 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.78■■■□□ 2.04
USP20-206ENST00000491053 ARHGEF11O15085 1522 aa27.78■■■□□ 2.04
USP20-206ENST00000491053 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.77■■■□□ 2.04
USP20-206ENST00000491053 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.76■■■□□ 2.03
USP20-206ENST00000491053 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.72■■■□□ 2.03
USP20-206ENST00000491053 SHROOM2Q13796 1616 aa27.66■■■□□ 2.02
USP20-206ENST00000491053 EEA1Q15075 1411 aa27.66■■■□□ 2.02
USP20-206ENST00000491053 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.64■■■□□ 2.02
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