RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489157.5

TAPBP-241, Transcript of TAP binding protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TAPBP, Length 1,299 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBP-241ENST00000489157 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.34■■■■□ 3.25
TAPBP-241ENST00000489157 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.69■■■□□ 2.66
TAPBP-241ENST00000489157 ABCC9O60706 1549 aa31.58■■■□□ 2.65
TAPBP-241ENST00000489157 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.07■■■□□ 2.4
TAPBP-241ENST00000489157 NACADO15069 1562 aa29.87■■■□□ 2.37
TAPBP-241ENST00000489157 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.79■■■□□ 2.36
TAPBP-241ENST00000489157 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.58■■■□□ 2.33
TAPBP-241ENST00000489157 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.51■■■□□ 2.31
TAPBP-241ENST00000489157 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.45■■■□□ 2.3
TAPBP-241ENST00000489157 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.41■■■□□ 2.3
TAPBP-241ENST00000489157 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
TAPBP-241ENST00000489157 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.26■■■□□ 2.27
TAPBP-241ENST00000489157 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.15■■■□□ 2.26
TAPBP-241ENST00000489157 SCRIBQ14160 1630 aa28.94■■■□□ 2.22
TAPBP-241ENST00000489157 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.72■■■□□ 2.19
TAPBP-241ENST00000489157 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.55■■■□□ 2.16
TAPBP-241ENST00000489157 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
TAPBP-241ENST00000489157 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.4■■■□□ 2.14
TAPBP-241ENST00000489157 SMARCA4P51532 1647 aa27.59■■■□□ 2.01
TAPBP-241ENST00000489157 NCAPD3P42695 1498 aa27.55■■■□□ 2
TAPBP-241ENST00000489157 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.53■■■□□ 2
TAPBP-241ENST00000489157 SMARCA2P51531 1590 aa27.44■■□□□ 1.98
TAPBP-241ENST00000489157 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
TAPBP-241ENST00000489157 HMGXB3Q12766 1538 aa27.39■■□□□ 1.98
TAPBP-241ENST00000489157 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.28■■□□□ 1.96
TAPBP-241ENST00000489157 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
TAPBP-241ENST00000489157 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.26■■□□□ 1.96
TAPBP-241ENST00000489157 ERCC6Q03468 1493 aa27.21■■□□□ 1.95
TAPBP-241ENST00000489157 NESP48681 1621 aa27.19■■□□□ 1.94
TAPBP-241ENST00000489157 CUX2O14529 1486 aa27.07■■□□□ 1.92
TAPBP-241ENST00000489157 WIZO95785 1651 aa27.01■■□□□ 1.92
TAPBP-241ENST00000489157 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.95■■□□□ 1.9
TAPBP-241ENST00000489157 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.91■■□□□ 1.9
TAPBP-241ENST00000489157 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.91■■□□□ 1.9
TAPBP-241ENST00000489157 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
TAPBP-241ENST00000489157 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.73■■□□□ 1.87
TAPBP-241ENST00000489157 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.72■■□□□ 1.87
TAPBP-241ENST00000489157 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
TAPBP-241ENST00000489157 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
TAPBP-241ENST00000489157 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.55■■□□□ 1.84
TAPBP-241ENST00000489157 WDR62O43379 1518 aa26.49■■□□□ 1.83
TAPBP-241ENST00000489157 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.47■■□□□ 1.83
TAPBP-241ENST00000489157 CFTRP13569 1480 aa26.46■■□□□ 1.83
TAPBP-241ENST00000489157 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.46■■□□□ 1.83
TAPBP-241ENST00000489157 PRDM2Q13029 1718 aa26.36■■□□□ 1.81
TAPBP-241ENST00000489157 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.3■■□□□ 1.8
TAPBP-241ENST00000489157 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
TAPBP-241ENST00000489157 TOPBP1Q92547 1522 aa25.99■■□□□ 1.75
TAPBP-241ENST00000489157 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TAPBP-241ENST00000489157 IFT140Q96RY7 1462 aa25.91■■□□□ 1.74
TAPBP-241ENST00000489157 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.91■■□□□ 1.74
TAPBP-241ENST00000489157 TRIM41Q8WV44 630 aa25.86■■□□□ 1.73
TAPBP-241ENST00000489157 ABCC8Q09428 1581 aa25.86■■□□□ 1.73
TAPBP-241ENST00000489157 OSCARQ8IYS5 282 aa25.85■■□□□ 1.73
TAPBP-241ENST00000489157 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
TAPBP-241ENST00000489157 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
TAPBP-241ENST00000489157 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
TAPBP-241ENST00000489157 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.717e-7■■■■□ 20
TAPBP-241ENST00000489157 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.67■■□□□ 1.7
TAPBP-241ENST00000489157 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
TAPBP-241ENST00000489157 CHD1O14646 1710 aa25.67■■□□□ 1.7
TAPBP-241ENST00000489157 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.63■■□□□ 1.69
TAPBP-241ENST00000489157 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.63■■□□□ 1.69
TAPBP-241ENST00000489157 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.63■■□□□ 1.69
TAPBP-241ENST00000489157 CUX1P39880 1505 aa25.62■■□□□ 1.69
TAPBP-241ENST00000489157 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.6■■□□□ 1.69
TAPBP-241ENST00000489157 SOGA1O94964 1423 aa25.59■■□□□ 1.69
TAPBP-241ENST00000489157 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
TAPBP-241ENST00000489157 ARHGEF11O15085 1522 aa25.51■■□□□ 1.67
TAPBP-241ENST00000489157 FBLN2P98095 1184 aa25.49■■□□□ 1.67
TAPBP-241ENST00000489157 WDR97A6NE52 1622 aa25.48■■□□□ 1.67
TAPBP-241ENST00000489157 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.44■■□□□ 1.66
TAPBP-241ENST00000489157 PBRM1Q86U86 1689 aa25.39■■□□□ 1.66
TAPBP-241ENST00000489157 GRIN2BQ13224 1484 aa25.34■■□□□ 1.65
TAPBP-241ENST00000489157 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
TAPBP-241ENST00000489157 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.3■■□□□ 1.64
TAPBP-241ENST00000489157 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.29■■□□□ 1.64
TAPBP-241ENST00000489157 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.29■■□□□ 1.64
TAPBP-241ENST00000489157 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.28■■□□□ 1.64
TAPBP-241ENST00000489157 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.28■■□□□ 1.64
TAPBP-241ENST00000489157 ARAP1Q96P48 1450 aa25.28■■□□□ 1.64
TAPBP-241ENST00000489157 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TAPBP-241ENST00000489157 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.26■■□□□ 1.63
TAPBP-241ENST00000489157 SYNJ2O15056 1496 aa25.25■■□□□ 1.63
TAPBP-241ENST00000489157 SYNJ1O43426 1573 aa25.25■■□□□ 1.63
TAPBP-241ENST00000489157 TOP2BQ02880 1626 aa25.23■■□□□ 1.63
TAPBP-241ENST00000489157 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
TAPBP-241ENST00000489157 ADAMTS12P58397 1594 aa25.1■■□□□ 1.61
TAPBP-241ENST00000489157 GRIN2AQ12879 1464 aa25.04■■□□□ 1.6
TAPBP-241ENST00000489157 CEP170Q5SW79 1584 aa25.01■■□□□ 1.59
TAPBP-241ENST00000489157 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.97■■□□□ 1.59
TAPBP-241ENST00000489157 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.96■■□□□ 1.59
TAPBP-241ENST00000489157 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
TAPBP-241ENST00000489157 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.95■■□□□ 1.58
TAPBP-241ENST00000489157 NUP160Q12769 1436 aa24.93■■□□□ 1.58
TAPBP-241ENST00000489157 SHROOM2Q13796 1616 aa24.87■■□□□ 1.57
TAPBP-241ENST00000489157 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.74■■□□□ 1.55
TAPBP-241ENST00000489157 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
TAPBP-241ENST00000489157 KIF27Q86VH2 1401 aa24.68■■□□□ 1.54
TAPBP-241ENST00000489157 CUL7Q14999 1698 aa24.67■■□□□ 1.54
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