RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487468.5

TTLL11-206, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL11, Length 1,038 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11-206ENST00000487468 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.78■■■■■ 5.88
TTLL11-206ENST00000487468 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.32■■■■■ 5.01
TTLL11-206ENST00000487468 ABCC9O60706 1549 aa45.98■■■■■ 4.95
TTLL11-206ENST00000487468 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.88■■■■■ 4.61
TTLL11-206ENST00000487468 NACADO15069 1562 aa43.67■■■■■ 4.58
TTLL11-206ENST00000487468 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.42■■■■■ 4.54
TTLL11-206ENST00000487468 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.2■■■■■ 4.51
TTLL11-206ENST00000487468 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.06■■■■■ 4.48
TTLL11-206ENST00000487468 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
TTLL11-206ENST00000487468 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.9■■■■■ 4.46
TTLL11-206ENST00000487468 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.84■■■■■ 4.45
TTLL11-206ENST00000487468 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.78■■■■■ 4.44
TTLL11-206ENST00000487468 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.71■■■■■ 4.43
TTLL11-206ENST00000487468 SCRIBQ14160 1630 aa42.23■■■■■ 4.35
TTLL11-206ENST00000487468 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.04■■■■■ 4.32
TTLL11-206ENST00000487468 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.58■■■■■ 4.25
TTLL11-206ENST00000487468 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
TTLL11-206ENST00000487468 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.35■■■■■ 4.21
TTLL11-206ENST00000487468 SMARCA4P51532 1647 aa40.34■■■■■ 4.05
TTLL11-206ENST00000487468 NCAPD3P42695 1498 aa40.33■■■■■ 4.05
TTLL11-206ENST00000487468 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.27■■■■■ 4.04
TTLL11-206ENST00000487468 SMARCA2P51531 1590 aa40.13■■■■■ 4.01
TTLL11-206ENST00000487468 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
TTLL11-206ENST00000487468 HMGXB3Q12766 1538 aa40.07■■■■■ 4.01
TTLL11-206ENST00000487468 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.96■■■■□ 3.99
TTLL11-206ENST00000487468 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.93■■■■□ 3.98
TTLL11-206ENST00000487468 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
TTLL11-206ENST00000487468 NESP48681 1621 aa39.64■■■■□ 3.94
TTLL11-206ENST00000487468 ERCC6Q03468 1493 aa39.58■■■■□ 3.93
TTLL11-206ENST00000487468 WIZO95785 1651 aa39.48■■■■□ 3.91
TTLL11-206ENST00000487468 CUX2O14529 1486 aa39.44■■■■□ 3.9
TTLL11-206ENST00000487468 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.36■■■■□ 3.89
TTLL11-206ENST00000487468 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
TTLL11-206ENST00000487468 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
TTLL11-206ENST00000487468 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.16■■■■□ 3.86
TTLL11-206ENST00000487468 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.09■■■■□ 3.85
TTLL11-206ENST00000487468 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.06■■■■□ 3.84
TTLL11-206ENST00000487468 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.05■■■■□ 3.84
TTLL11-206ENST00000487468 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
TTLL11-206ENST00000487468 CFTRP13569 1480 aa38.75■■■■□ 3.79
TTLL11-206ENST00000487468 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.75■■■■□ 3.79
TTLL11-206ENST00000487468 WDR62O43379 1518 aa38.69■■■■□ 3.78
TTLL11-206ENST00000487468 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.66■■■■□ 3.78
TTLL11-206ENST00000487468 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.65■■■■□ 3.78
TTLL11-206ENST00000487468 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.53■■■■□ 3.76
TTLL11-206ENST00000487468 PRDM2Q13029 1718 aa38.46■■■■□ 3.75
TTLL11-206ENST00000487468 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.38■■■■□ 3.73
TTLL11-206ENST00000487468 TOPBP1Q92547 1522 aa37.99■■■■□ 3.67
TTLL11-206ENST00000487468 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.88■■■■□ 3.65
TTLL11-206ENST00000487468 IFT140Q96RY7 1462 aa37.86■■■■□ 3.65
TTLL11-206ENST00000487468 ABCC8Q09428 1581 aa37.85■■■■□ 3.65
TTLL11-206ENST00000487468 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
TTLL11-206ENST00000487468 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
TTLL11-206ENST00000487468 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
TTLL11-206ENST00000487468 OSCARQ8IYS5 282 aa37.65■■■■□ 3.62
TTLL11-206ENST00000487468 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
TTLL11-206ENST00000487468 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
TTLL11-206ENST00000487468 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.52■■■■□ 3.6
TTLL11-206ENST00000487468 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.5■■■■□ 3.59
TTLL11-206ENST00000487468 CUX1P39880 1505 aa37.49■■■■□ 3.59
TTLL11-206ENST00000487468 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.44■■■■□ 3.58
TTLL11-206ENST00000487468 TRIM41Q8WV44 630 aa37.43■■■■□ 3.58
TTLL11-206ENST00000487468 SOGA1O94964 1423 aa37.41■■■■□ 3.58
TTLL11-206ENST00000487468 CHD1O14646 1710 aa37.33■■■■□ 3.57
TTLL11-206ENST00000487468 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
TTLL11-206ENST00000487468 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.25■■■■□ 3.55
TTLL11-206ENST00000487468 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.25■■■■□ 3.55
TTLL11-206ENST00000487468 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.25■■■■□ 3.55
TTLL11-206ENST00000487468 WDR97A6NE52 1622 aa37.24■■■■□ 3.55
TTLL11-206ENST00000487468 ARHGEF11O15085 1522 aa37.14■■■■□ 3.54
TTLL11-206ENST00000487468 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.13■■■■□ 3.54
TTLL11-206ENST00000487468 FBLN2P98095 1184 aa37.09■■■■□ 3.53
TTLL11-206ENST00000487468 GRIN2BQ13224 1484 aa37.05■■■■□ 3.52
TTLL11-206ENST00000487468 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.03■■■■□ 3.52
TTLL11-206ENST00000487468 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
TTLL11-206ENST00000487468 PBRM1Q86U86 1689 aa37.02■■■■□ 3.52
TTLL11-206ENST00000487468 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.99■■■■□ 3.51
TTLL11-206ENST00000487468 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.99■■■■□ 3.51
TTLL11-206ENST00000487468 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.98■■■■□ 3.51
TTLL11-206ENST00000487468 TOP2BQ02880 1626 aa36.96■■■■□ 3.51
TTLL11-206ENST00000487468 SYNJ1O43426 1573 aa36.96■■■■□ 3.51
TTLL11-206ENST00000487468 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.93■■■■□ 3.5
TTLL11-206ENST00000487468 SYNJ2O15056 1496 aa36.9■■■■□ 3.5
TTLL11-206ENST00000487468 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.9■■■■□ 3.5
TTLL11-206ENST00000487468 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
TTLL11-206ENST00000487468 ARAP1Q96P48 1450 aa36.82■■■■□ 3.48
TTLL11-206ENST00000487468 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.78■■■■□ 3.48
TTLL11-206ENST00000487468 ADAMTS12P58397 1594 aa36.66■■■■□ 3.46
TTLL11-206ENST00000487468 GRIN2AQ12879 1464 aa36.61■■■■□ 3.45
TTLL11-206ENST00000487468 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.55■■■■□ 3.44
TTLL11-206ENST00000487468 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.51■■■■□ 3.44
TTLL11-206ENST00000487468 CEP170Q5SW79 1584 aa36.51■■■■□ 3.44
TTLL11-206ENST00000487468 NUP160Q12769 1436 aa36.5■■■■□ 3.43
TTLL11-206ENST00000487468 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.39■■■■□ 3.42
TTLL11-206ENST00000487468 SHROOM2Q13796 1616 aa36.33■■■■□ 3.41
TTLL11-206ENST00000487468 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
TTLL11-206ENST00000487468 IGF1RP08069 1367 aa36.18■■■■□ 3.38
TTLL11-206ENST00000487468 KIF27Q86VH2 1401 aa36.17■■■■□ 3.38
TTLL11-206ENST00000487468 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.14■■■■□ 3.38
TTLL11-206ENST00000487468 CUL7Q14999 1698 aa36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.3 ms