RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486299.5

USP21-207, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

TSL 2

Gene USP21, Length 598 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP21-207ENST00000486299 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
USP21-207ENST00000486299 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.03■■□□□ 1.76
USP21-207ENST00000486299 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.66■■□□□ 1.7
USP21-207ENST00000486299 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.65■■□□□ 1.7
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USP21-207ENST00000486299 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.34■■□□□ 1.65
USP21-207ENST00000486299 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.32■■□□□ 1.64
USP21-207ENST00000486299 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.23■■□□□ 1.63
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USP21-207ENST00000486299 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
USP21-207ENST00000486299 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
USP21-207ENST00000486299 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.05■■□□□ 1.6
USP21-207ENST00000486299 SCRIBQ14160 1630 aa24.97■■□□□ 1.59
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USP21-207ENST00000486299 ERCC6Q03468 1493 aa24.25■■□□□ 1.47
USP21-207ENST00000486299 NCAPD3P42695 1498 aa24.22■■□□□ 1.47
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USP21-207ENST00000486299 SMARCA2P51531 1590 aa23.9■■□□□ 1.42
USP21-207ENST00000486299 HMGXB3Q12766 1538 aa23.89■■□□□ 1.42
USP21-207ENST00000486299 SMARCA4P51532 1647 aa23.78■■□□□ 1.4
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USP21-207ENST00000486299 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
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USP21-207ENST00000486299 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.64■■□□□ 1.37
USP21-207ENST00000486299 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.59■■□□□ 1.37
USP21-207ENST00000486299 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.49■■□□□ 1.35
USP21-207ENST00000486299 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.44■■□□□ 1.34
USP21-207ENST00000486299 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.43■■□□□ 1.34
USP21-207ENST00000486299 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.4■■□□□ 1.34
USP21-207ENST00000486299 WDR62O43379 1518 aa23.33■■□□□ 1.32
USP21-207ENST00000486299 OSCARQ8IYS5 282 aa23.3■■□□□ 1.32
USP21-207ENST00000486299 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.2■■□□□ 1.3
USP21-207ENST00000486299 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.15■■□□□ 1.3
USP21-207ENST00000486299 CFTRP13569 1480 aa23.07■■□□□ 1.28
USP21-207ENST00000486299 WIZO95785 1651 aa23.04■■□□□ 1.28
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USP21-207ENST00000486299 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.83■■□□□ 1.25
USP21-207ENST00000486299 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.83■■□□□ 1.25
USP21-207ENST00000486299 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.83■■□□□ 1.25
USP21-207ENST00000486299 ARHGEF11O15085 1522 aa22.79■■□□□ 1.24
USP21-207ENST00000486299 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
USP21-207ENST00000486299 IFT140Q96RY7 1462 aa22.79■■□□□ 1.24
USP21-207ENST00000486299 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
USP21-207ENST00000486299 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.77■■□□□ 1.24
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USP21-207ENST00000486299 TOPBP1Q92547 1522 aa22.63■■□□□ 1.21
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USP21-207ENST00000486299 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 30.8
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USP21-207ENST00000486299 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
USP21-207ENST00000486299 PRDM2Q13029 1718 aa22.48■■□□□ 1.19
USP21-207ENST00000486299 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.46■■□□□ 1.19
USP21-207ENST00000486299 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
USP21-207ENST00000486299 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
USP21-207ENST00000486299 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
USP21-207ENST00000486299 CHD1O14646 1710 aa22.37■■□□□ 1.17
USP21-207ENST00000486299 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
USP21-207ENST00000486299 SOGA1O94964 1423 aa22.32■■□□□ 1.16
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USP21-207ENST00000486299 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.32■■□□□ 1.16
USP21-207ENST00000486299 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.26■■□□□ 1.15
USP21-207ENST00000486299 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.24■■□□□ 1.15
USP21-207ENST00000486299 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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USP21-207ENST00000486299 GRIN2BQ13224 1484 aa22.16■■□□□ 1.14
USP21-207ENST00000486299 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.15■■□□□ 1.14
USP21-207ENST00000486299 WDR97A6NE52 1622 aa22.15■■□□□ 1.14
USP21-207ENST00000486299 SYNJ2O15056 1496 aa22.13■■□□□ 1.13
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USP21-207ENST00000486299 CUX1P39880 1505 aa22.05■■□□□ 1.12
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USP21-207ENST00000486299 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.85■■□□□ 1.09
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USP21-207ENST00000486299 NUP160Q12769 1436 aa21.83■■□□□ 1.09
USP21-207ENST00000486299 PBRM1Q86U86 1689 aa21.82■■□□□ 1.08
USP21-207ENST00000486299 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.8■■□□□ 1.08
USP21-207ENST00000486299 CEP170Q5SW79 1584 aa21.78■■□□□ 1.08
USP21-207ENST00000486299 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
USP21-207ENST00000486299 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.73■■□□□ 1.07
USP21-207ENST00000486299 ADAMTS12P58397 1594 aa21.7■■□□□ 1.06
USP21-207ENST00000486299 JPH4Q96JJ6 628 aa21.69■■□□□ 1.06
USP21-207ENST00000486299 SHROOM2Q13796 1616 aa21.67■■□□□ 1.06
USP21-207ENST00000486299 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
USP21-207ENST00000486299 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.67■■□□□ 1.06
USP21-207ENST00000486299 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
USP21-207ENST00000486299 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.6■■□□□ 1.05
USP21-207ENST00000486299 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.59■■□□□ 1.05
USP21-207ENST00000486299 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.56■■□□□ 1.04
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