RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485004.5

CSAD-215, Transcript of cysteine sulfinic acid decarboxylase, humanhuman

TSL 3

Gene CSAD, Length 751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAD-215ENST00000485004 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.63■■■□□ 2.49
CSAD-215ENST00000485004 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.56■■■□□ 2
CSAD-215ENST00000485004 ABCC9O60706 1549 aa27.21■■□□□ 1.95
CSAD-215ENST00000485004 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.12■■□□□ 1.77
CSAD-215ENST00000485004 NACADO15069 1562 aa25.99■■□□□ 1.75
CSAD-215ENST00000485004 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.74■■□□□ 1.71
CSAD-215ENST00000485004 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.61■■□□□ 1.69
CSAD-215ENST00000485004 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.46■■□□□ 1.67
CSAD-215ENST00000485004 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.42■■□□□ 1.66
CSAD-215ENST00000485004 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CSAD-215ENST00000485004 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.3■■□□□ 1.64
CSAD-215ENST00000485004 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
CSAD-215ENST00000485004 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.25■■□□□ 1.63
CSAD-215ENST00000485004 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.17■■□□□ 1.62
CSAD-215ENST00000485004 SCRIBQ14160 1630 aa24.94■■□□□ 1.58
CSAD-215ENST00000485004 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CSAD-215ENST00000485004 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.66■■□□□ 1.54
CSAD-215ENST00000485004 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.57■■□□□ 1.52
CSAD-215ENST00000485004 NCAPD3P42695 1498 aa23.94■■□□□ 1.42
CSAD-215ENST00000485004 SMARCA4P51532 1647 aa23.88■■□□□ 1.41
CSAD-215ENST00000485004 SMARCA2P51531 1590 aa23.87■■□□□ 1.41
CSAD-215ENST00000485004 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.84■■□□□ 1.41
CSAD-215ENST00000485004 HMGXB3Q12766 1538 aa23.83■■□□□ 1.41
CSAD-215ENST00000485004 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
CSAD-215ENST00000485004 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.71■■□□□ 1.39
CSAD-215ENST00000485004 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CSAD-215ENST00000485004 ERCC6Q03468 1493 aa23.58■■□□□ 1.37
CSAD-215ENST00000485004 CUX2O14529 1486 aa23.57■■□□□ 1.36
CSAD-215ENST00000485004 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.52■■□□□ 1.36
CSAD-215ENST00000485004 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.44■■□□□ 1.34
CSAD-215ENST00000485004 NESP48681 1621 aa23.38■■□□□ 1.33
CSAD-215ENST00000485004 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.29■■□□□ 1.32
CSAD-215ENST00000485004 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.27■■□□□ 1.32
CSAD-215ENST00000485004 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CSAD-215ENST00000485004 WIZO95785 1651 aa23.25■■□□□ 1.31
CSAD-215ENST00000485004 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.19■■□□□ 1.3
CSAD-215ENST00000485004 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.17■■□□□ 1.3
CSAD-215ENST00000485004 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CSAD-215ENST00000485004 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CSAD-215ENST00000485004 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.04■■□□□ 1.28
CSAD-215ENST00000485004 WDR62O43379 1518 aa22.98■■□□□ 1.27
CSAD-215ENST00000485004 CFTRP13569 1480 aa22.97■■□□□ 1.27
CSAD-215ENST00000485004 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.97■■□□□ 1.27
CSAD-215ENST00000485004 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.92■■□□□ 1.26
CSAD-215ENST00000485004 PRDM2Q13029 1718 aa22.84■■□□□ 1.25
CSAD-215ENST00000485004 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.72■■□□□ 1.23
CSAD-215ENST00000485004 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CSAD-215ENST00000485004 ABCC8Q09428 1581 aa22.58■■□□□ 1.2
CSAD-215ENST00000485004 IFT140Q96RY7 1462 aa22.53■■□□□ 1.2
CSAD-215ENST00000485004 TOPBP1Q92547 1522 aa22.5■■□□□ 1.19
CSAD-215ENST00000485004 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.47■■□□□ 1.19
CSAD-215ENST00000485004 OSCARQ8IYS5 282 aa22.42■■□□□ 1.18
CSAD-215ENST00000485004 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CSAD-215ENST00000485004 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CSAD-215ENST00000485004 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CSAD-215ENST00000485004 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CSAD-215ENST00000485004 WDR97A6NE52 1622 aa22.25■■□□□ 1.15
CSAD-215ENST00000485004 TRIM41Q8WV44 630 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAD-215ENST00000485004 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.144e-33■■■■■ 46.8
CSAD-215ENST00000485004 SOGA1O94964 1423 aa22.15■■□□□ 1.14
CSAD-215ENST00000485004 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.14■■□□□ 1.13
CSAD-215ENST00000485004 CHD1O14646 1710 aa22.11■■□□□ 1.13
CSAD-215ENST00000485004 CUX1P39880 1505 aa22.11■■□□□ 1.13
CSAD-215ENST00000485004 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.11■■□□□ 1.13
CSAD-215ENST00000485004 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.11■■□□□ 1.13
CSAD-215ENST00000485004 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.11■■□□□ 1.13
CSAD-215ENST00000485004 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.1■■□□□ 1.13
CSAD-215ENST00000485004 ARHGEF11O15085 1522 aa22.06■■□□□ 1.12
CSAD-215ENST00000485004 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CSAD-215ENST00000485004 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CSAD-215ENST00000485004 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CSAD-215ENST00000485004 GRIN2BQ13224 1484 aa22.01■■□□□ 1.11
CSAD-215ENST00000485004 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.99■■□□□ 1.11
CSAD-215ENST00000485004 FBLN2P98095 1184 aa21.97■■□□□ 1.11
CSAD-215ENST00000485004 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.95■■□□□ 1.1
CSAD-215ENST00000485004 SYNJ1O43426 1573 aa21.94■■□□□ 1.1
CSAD-215ENST00000485004 SYNJ2O15056 1496 aa21.93■■□□□ 1.1
CSAD-215ENST00000485004 PBRM1Q86U86 1689 aa21.92■■□□□ 1.1
CSAD-215ENST00000485004 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.91■■□□□ 1.1
CSAD-215ENST00000485004 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.91■■□□□ 1.1
CSAD-215ENST00000485004 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CSAD-215ENST00000485004 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.9■■□□□ 1.1
CSAD-215ENST00000485004 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
CSAD-215ENST00000485004 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.88■■□□□ 1.09
CSAD-215ENST00000485004 TOP2BQ02880 1626 aa21.88■■□□□ 1.09
CSAD-215ENST00000485004 ARAP1Q96P48 1450 aa21.83■■□□□ 1.08
CSAD-215ENST00000485004 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.8■■□□□ 1.08
CSAD-215ENST00000485004 ADAMTS12P58397 1594 aa21.73■■□□□ 1.07
CSAD-215ENST00000485004 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.71■■□□□ 1.07
CSAD-215ENST00000485004 GRIN2AQ12879 1464 aa21.71■■□□□ 1.07
CSAD-215ENST00000485004 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.67■■□□□ 1.06
CSAD-215ENST00000485004 NUP160Q12769 1436 aa21.63■■□□□ 1.05
CSAD-215ENST00000485004 CEP170Q5SW79 1584 aa21.59■■□□□ 1.05
CSAD-215ENST00000485004 SHROOM2Q13796 1616 aa21.55■■□□□ 1.04
CSAD-215ENST00000485004 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CSAD-215ENST00000485004 CUL7Q14999 1698 aa21.45■■□□□ 1.02
CSAD-215ENST00000485004 KIF27Q86VH2 1401 aa21.45■■□□□ 1.02
CSAD-215ENST00000485004 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.43■■□□□ 1.02
CSAD-215ENST00000485004 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.42■■□□□ 1.02
CSAD-215ENST00000485004 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130.7 ms