RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484971.1

GTPBP1-210, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 582 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-210ENST00000484971 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.25■■■■□ 3.39
GTPBP1-210ENST00000484971 ABCC9O60706 1549 aa33.31■■■□□ 2.92
GTPBP1-210ENST00000484971 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.8■■■□□ 2.84
GTPBP1-210ENST00000484971 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.8■■■□□ 2.68
GTPBP1-210ENST00000484971 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.43■■■□□ 2.62
GTPBP1-210ENST00000484971 NACADO15069 1562 aa31.09■■■□□ 2.57
GTPBP1-210ENST00000484971 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.91■■■□□ 2.54
GTPBP1-210ENST00000484971 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.89■■■□□ 2.54
GTPBP1-210ENST00000484971 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.7■■■□□ 2.51
GTPBP1-210ENST00000484971 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.66■■■□□ 2.5
GTPBP1-210ENST00000484971 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.48■■■□□ 2.47
GTPBP1-210ENST00000484971 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.1■■■□□ 2.41
GTPBP1-210ENST00000484971 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.05■■■□□ 2.4
GTPBP1-210ENST00000484971 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.04■■■□□ 2.4
GTPBP1-210ENST00000484971 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
GTPBP1-210ENST00000484971 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.9■■■□□ 2.38
GTPBP1-210ENST00000484971 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
GTPBP1-210ENST00000484971 SCRIBQ14160 1630 aa29.85■■■□□ 2.37
GTPBP1-210ENST00000484971 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.52■■■□□ 2.32
GTPBP1-210ENST00000484971 CUX2O14529 1486 aa28.9■■■□□ 2.22
GTPBP1-210ENST00000484971 ERCC6Q03468 1493 aa28.72■■■□□ 2.19
GTPBP1-210ENST00000484971 NCAPD3P42695 1498 aa28.72■■■□□ 2.19
GTPBP1-210ENST00000484971 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.56■■■□□ 2.16
GTPBP1-210ENST00000484971 NESP48681 1621 aa28.51■■■□□ 2.15
GTPBP1-210ENST00000484971 HMGXB3Q12766 1538 aa28.47■■■□□ 2.15
GTPBP1-210ENST00000484971 SMARCA4P51532 1647 aa28.43■■■□□ 2.14
GTPBP1-210ENST00000484971 SMARCA2P51531 1590 aa28.41■■■□□ 2.14
GTPBP1-210ENST00000484971 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
GTPBP1-210ENST00000484971 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
GTPBP1-210ENST00000484971 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.16■■■□□ 2.1
GTPBP1-210ENST00000484971 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.16■■■□□ 2.1
GTPBP1-210ENST00000484971 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.16■■■□□ 2.1
GTPBP1-210ENST00000484971 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
GTPBP1-210ENST00000484971 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.96■■■□□ 2.07
GTPBP1-210ENST00000484971 TRIM41Q8WV44 630 aa27.95■■■□□ 2.06
GTPBP1-210ENST00000484971 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.94■■■□□ 2.06
GTPBP1-210ENST00000484971 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.79■■■□□ 2.04
GTPBP1-210ENST00000484971 WDR62O43379 1518 aa27.78■■■□□ 2.04
GTPBP1-210ENST00000484971 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.78■■■□□ 2.04
GTPBP1-210ENST00000484971 WIZO95785 1651 aa27.62■■■□□ 2.01
GTPBP1-210ENST00000484971 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.56■■■□□ 2
GTPBP1-210ENST00000484971 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.49■■□□□ 1.99
GTPBP1-210ENST00000484971 OSCARQ8IYS5 282 aa27.42■■□□□ 1.98
GTPBP1-210ENST00000484971 CFTRP13569 1480 aa27.38■■□□□ 1.97
GTPBP1-210ENST00000484971 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
GTPBP1-210ENST00000484971 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.27■■□□□ 1.96
GTPBP1-210ENST00000484971 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.27■■□□□ 1.96
GTPBP1-210ENST00000484971 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.27■■□□□ 1.96
GTPBP1-210ENST00000484971 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
GTPBP1-210ENST00000484971 PRDM2Q13029 1718 aa27.16■■□□□ 1.94
GTPBP1-210ENST00000484971 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
GTPBP1-210ENST00000484971 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
GTPBP1-210ENST00000484971 ARHGEF11O15085 1522 aa27.1■■□□□ 1.93
GTPBP1-210ENST00000484971 IFT140Q96RY7 1462 aa27.02■■□□□ 1.92
GTPBP1-210ENST00000484971 TOPBP1Q92547 1522 aa26.94■■□□□ 1.9
GTPBP1-210ENST00000484971 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
GTPBP1-210ENST00000484971 CHD1O14646 1710 aa26.89■■□□□ 1.9
GTPBP1-210ENST00000484971 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.87■■□□□ 1.89
GTPBP1-210ENST00000484971 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.85■■□□□ 1.89
GTPBP1-210ENST00000484971 ARAP1Q96P48 1450 aa26.81■■□□□ 1.88
GTPBP1-210ENST00000484971 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
GTPBP1-210ENST00000484971 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.78■■□□□ 1.88
GTPBP1-210ENST00000484971 ABCC8Q09428 1581 aa26.75■■□□□ 1.87
GTPBP1-210ENST00000484971 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
GTPBP1-210ENST00000484971 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
GTPBP1-210ENST00000484971 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
GTPBP1-210ENST00000484971 FBLN2P98095 1184 aa26.59■■□□□ 1.85
GTPBP1-210ENST00000484971 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.55■■□□□ 1.84
GTPBP1-210ENST00000484971 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.53■■□□□ 1.84
GTPBP1-210ENST00000484971 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
GTPBP1-210ENST00000484971 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.46■■□□□ 1.83
GTPBP1-210ENST00000484971 SOGA1O94964 1423 aa26.44■■□□□ 1.82
GTPBP1-210ENST00000484971 WDR97A6NE52 1622 aa26.39■■□□□ 1.82
GTPBP1-210ENST00000484971 SYNJ1O43426 1573 aa26.38■■□□□ 1.81
GTPBP1-210ENST00000484971 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.37■■□□□ 1.81
GTPBP1-210ENST00000484971 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
GTPBP1-210ENST00000484971 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
GTPBP1-210ENST00000484971 CUX1P39880 1505 aa26.29■■□□□ 1.8
GTPBP1-210ENST00000484971 GRIN2BQ13224 1484 aa26.28■■□□□ 1.8
GTPBP1-210ENST00000484971 SYNJ2O15056 1496 aa26.27■■□□□ 1.8
GTPBP1-210ENST00000484971 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
GTPBP1-210ENST00000484971 PBRM1Q86U86 1689 aa26.24■■□□□ 1.79
GTPBP1-210ENST00000484971 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.22■■□□□ 1.79
GTPBP1-210ENST00000484971 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.12■■□□□ 1.77
GTPBP1-210ENST00000484971 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.1■■□□□ 1.77
GTPBP1-210ENST00000484971 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.04■■□□□ 1.76
GTPBP1-210ENST00000484971 GRIN2AQ12879 1464 aa25.98■■□□□ 1.75
GTPBP1-210ENST00000484971 CEP170Q5SW79 1584 aa25.97■■□□□ 1.75
GTPBP1-210ENST00000484971 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.95■■□□□ 1.74
GTPBP1-210ENST00000484971 ADAMTS12P58397 1594 aa25.93■■□□□ 1.74
GTPBP1-210ENST00000484971 SHROOM2Q13796 1616 aa25.92■■□□□ 1.74
GTPBP1-210ENST00000484971 NUP160Q12769 1436 aa25.92■■□□□ 1.74
GTPBP1-210ENST00000484971 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
GTPBP1-210ENST00000484971 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.75■■□□□ 1.71
GTPBP1-210ENST00000484971 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.74■■□□□ 1.71
GTPBP1-210ENST00000484971 TOP2BQ02880 1626 aa25.71■■□□□ 1.71
GTPBP1-210ENST00000484971 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.68■■□□□ 1.7
GTPBP1-210ENST00000484971 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
GTPBP1-210ENST00000484971 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.61■■□□□ 1.69
GTPBP1-210ENST00000484971 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.58■■□□□ 1.69
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