RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484846.1

EHD1-209, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene EHD1, Length 3,469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-209ENST00000484846 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27■■□□□ 1.91
EHD1-209ENST00000484846 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.36■■□□□ 1.33
EHD1-209ENST00000484846 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.33■■□□□ 1.33
EHD1-209ENST00000484846 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.18■■□□□ 1.3
EHD1-209ENST00000484846 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
EHD1-209ENST00000484846 ABCC9O60706 1549 aa22.87■■□□□ 1.25
EHD1-209ENST00000484846 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
EHD1-209ENST00000484846 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.04■■□□□ 1.12
EHD1-209ENST00000484846 NACADO15069 1562 aa21.96■■□□□ 1.11
EHD1-209ENST00000484846 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.9■■□□□ 1.1
EHD1-209ENST00000484846 SCRIBQ14160 1630 aa21.88■■□□□ 1.09
EHD1-209ENST00000484846 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.85■■□□□ 1.09
EHD1-209ENST00000484846 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.83■■□□□ 1.09
EHD1-209ENST00000484846 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.79■■□□□ 1.08
EHD1-209ENST00000484846 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
EHD1-209ENST00000484846 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.59■■□□□ 1.05
EHD1-209ENST00000484846 HRCP23327 699 aa21.56■■□□□ 1.04
EHD1-209ENST00000484846 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
EHD1-209ENST00000484846 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.51■■□□□ 1.03
EHD1-209ENST00000484846 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
EHD1-209ENST00000484846 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.22■□□□□ 0.99
EHD1-209ENST00000484846 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.17■□□□□ 0.98
EHD1-209ENST00000484846 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.09■□□□□ 0.97
EHD1-209ENST00000484846 TRIM41Q8WV44 630 aa21.03■□□□□ 0.96
EHD1-209ENST00000484846 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
EHD1-209ENST00000484846 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
EHD1-209ENST00000484846 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.94■□□□□ 0.94
EHD1-209ENST00000484846 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
EHD1-209ENST00000484846 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
EHD1-209ENST00000484846 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
EHD1-209ENST00000484846 SMARCA4P51532 1647 aa20.74■□□□□ 0.91
EHD1-209ENST00000484846 WIZO95785 1651 aa20.74■□□□□ 0.91
EHD1-209ENST00000484846 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
EHD1-209ENST00000484846 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.56■□□□□ 0.88
EHD1-209ENST00000484846 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
EHD1-209ENST00000484846 SMARCA2P51531 1590 aa20.49■□□□□ 0.87
EHD1-209ENST00000484846 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
EHD1-209ENST00000484846 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
EHD1-209ENST00000484846 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
EHD1-209ENST00000484846 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
EHD1-209ENST00000484846 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.4■□□□□ 0.86
EHD1-209ENST00000484846 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.37■□□□□ 0.85
EHD1-209ENST00000484846 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.34■□□□□ 0.85
EHD1-209ENST00000484846 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
EHD1-209ENST00000484846 NCAPD3P42695 1498 aa20.33■□□□□ 0.84
EHD1-209ENST00000484846 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.27■□□□□ 0.84
EHD1-209ENST00000484846 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
EHD1-209ENST00000484846 HMGXB3Q12766 1538 aa20.16■□□□□ 0.82
EHD1-209ENST00000484846 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
EHD1-209ENST00000484846 MYT1Q01538 1121 aa20.15■□□□□ 0.82
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EHD1-209ENST00000484846 ABCC8Q09428 1581 aa19.97■□□□□ 0.79
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EHD1-209ENST00000484846 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.83■□□□□ 0.76
EHD1-209ENST00000484846 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
EHD1-209ENST00000484846 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
EHD1-209ENST00000484846 CEP162Q5TB80 1403 aa19.78■□□□□ 0.76
EHD1-209ENST00000484846 APLP2Q06481 763 aa19.77■□□□□ 0.76
EHD1-209ENST00000484846 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.76■□□□□ 0.75
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EHD1-209ENST00000484846 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.72■□□□□ 0.75
EHD1-209ENST00000484846 ERCC6Q03468 1493 aa19.7■□□□□ 0.74
EHD1-209ENST00000484846 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.65■□□□□ 0.74
EHD1-209ENST00000484846 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.62■□□□□ 0.73
EHD1-209ENST00000484846 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
EHD1-209ENST00000484846 SYNJ1O43426 1573 aa19.62■□□□□ 0.73
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EHD1-209ENST00000484846 MIER1Q8N108 512 aa19.53■□□□□ 0.72
EHD1-209ENST00000484846 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
EHD1-209ENST00000484846 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.48■□□□□ 0.71
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EHD1-209ENST00000484846 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.44■□□□□ 0.7
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EHD1-209ENST00000484846 KIF27Q86VH2 1401 aa19.42■□□□□ 0.7
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EHD1-209ENST00000484846 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
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EHD1-209ENST00000484846 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.38■□□□□ 0.69
EHD1-209ENST00000484846 EEA1Q15075 1411 aa19.38■□□□□ 0.69
EHD1-209ENST00000484846 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.37■□□□□ 0.69
EHD1-209ENST00000484846 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
EHD1-209ENST00000484846 FBLN2P98095 1184 aa19.34■□□□□ 0.69
EHD1-209ENST00000484846 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.34■□□□□ 0.69
EHD1-209ENST00000484846 P3H3Q8IVL6 736 aa19.3■□□□□ 0.68
EHD1-209ENST00000484846 BCL11AQ9H165 835 aa19.26■□□□□ 0.67
EHD1-209ENST00000484846 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.25■□□□□ 0.67
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