RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484118.1

TTLL12-202, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 12, humanhuman

TSL 3

Gene TTLL12, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL12-202ENST00000484118 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.31■■■□□ 2.76
TTLL12-202ENST00000484118 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
TTLL12-202ENST00000484118 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.67■■■□□ 2.34
TTLL12-202ENST00000484118 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.54■■■□□ 2.16
TTLL12-202ENST00000484118 ABCC9O60706 1549 aa27.74■■■□□ 2.03
TTLL12-202ENST00000484118 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.95■■□□□ 1.9
TTLL12-202ENST00000484118 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TTLL12-202ENST00000484118 NACADO15069 1562 aa26.83■■□□□ 1.89
TTLL12-202ENST00000484118 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.78■■□□□ 1.88
TTLL12-202ENST00000484118 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.75■■□□□ 1.87
TTLL12-202ENST00000484118 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.74■■□□□ 1.87
TTLL12-202ENST00000484118 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.13■■□□□ 1.77
TTLL12-202ENST00000484118 SCRIBQ14160 1630 aa26.07■■□□□ 1.76
TTLL12-202ENST00000484118 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
TTLL12-202ENST00000484118 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
TTLL12-202ENST00000484118 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.96■■□□□ 1.75
TTLL12-202ENST00000484118 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
TTLL12-202ENST00000484118 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.7■■□□□ 1.7
TTLL12-202ENST00000484118 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.29■■□□□ 1.64
TTLL12-202ENST00000484118 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TTLL12-202ENST00000484118 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.15■■□□□ 1.62
TTLL12-202ENST00000484118 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.08■■□□□ 1.61
TTLL12-202ENST00000484118 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
TTLL12-202ENST00000484118 SMARCA4P51532 1647 aa24.97■■□□□ 1.59
TTLL12-202ENST00000484118 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.9■■□□□ 1.58
TTLL12-202ENST00000484118 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.82■■□□□ 1.56
TTLL12-202ENST00000484118 NCAPD3P42695 1498 aa24.78■■□□□ 1.56
TTLL12-202ENST00000484118 SMARCA2P51531 1590 aa24.78■■□□□ 1.56
TTLL12-202ENST00000484118 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.74■■□□□ 1.55
TTLL12-202ENST00000484118 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TTLL12-202ENST00000484118 WIZO95785 1651 aa24.62■■□□□ 1.53
TTLL12-202ENST00000484118 HMGXB3Q12766 1538 aa24.62■■□□□ 1.53
TTLL12-202ENST00000484118 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TTLL12-202ENST00000484118 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TTLL12-202ENST00000484118 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
TTLL12-202ENST00000484118 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.19■■□□□ 1.46
TTLL12-202ENST00000484118 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.13■■□□□ 1.45
TTLL12-202ENST00000484118 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.08■■□□□ 1.45
TTLL12-202ENST00000484118 NESP48681 1621 aa24.07■■□□□ 1.44
TTLL12-202ENST00000484118 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.04■■□□□ 1.44
TTLL12-202ENST00000484118 CFTRP13569 1480 aa23.97■■□□□ 1.43
TTLL12-202ENST00000484118 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.91■■□□□ 1.42
TTLL12-202ENST00000484118 ERCC6Q03468 1493 aa23.87■■□□□ 1.41
TTLL12-202ENST00000484118 FOXD1Q16676 465 aa23.86■■□□□ 1.41
TTLL12-202ENST00000484118 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.77■■□□□ 1.4
TTLL12-202ENST00000484118 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.75■■□□□ 1.39
TTLL12-202ENST00000484118 PRDM2Q13029 1718 aa23.72■■□□□ 1.39
TTLL12-202ENST00000484118 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.7■■□□□ 1.38
TTLL12-202ENST00000484118 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.62■■□□□ 1.37
TTLL12-202ENST00000484118 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TTLL12-202ENST00000484118 CUX2O14529 1486 aa23.53■■□□□ 1.36
TTLL12-202ENST00000484118 WDR62O43379 1518 aa23.52■■□□□ 1.36
TTLL12-202ENST00000484118 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TTLL12-202ENST00000484118 ABCC8Q09428 1581 aa23.46■■□□□ 1.35
TTLL12-202ENST00000484118 TOPBP1Q92547 1522 aa23.42■■□□□ 1.34
TTLL12-202ENST00000484118 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL12-202ENST00000484118 CUX1P39880 1505 aa23.33■■□□□ 1.33
TTLL12-202ENST00000484118 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
TTLL12-202ENST00000484118 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TTLL12-202ENST00000484118 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.21■■□□□ 1.31
TTLL12-202ENST00000484118 IFT140Q96RY7 1462 aa23.21■■□□□ 1.31
TTLL12-202ENST00000484118 TOP2BQ02880 1626 aa23.19■■□□□ 1.3
TTLL12-202ENST00000484118 SYNJ1O43426 1573 aa23.18■■□□□ 1.3
TTLL12-202ENST00000484118 SOGA1O94964 1423 aa23.18■■□□□ 1.3
TTLL12-202ENST00000484118 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.17■■□□□ 1.3
TTLL12-202ENST00000484118 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.15■■□□□ 1.3
TTLL12-202ENST00000484118 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
TTLL12-202ENST00000484118 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
TTLL12-202ENST00000484118 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TTLL12-202ENST00000484118 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.01■■□□□ 1.27
TTLL12-202ENST00000484118 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
TTLL12-202ENST00000484118 TRIM41Q8WV44 630 aa22.98■■□□□ 1.27
TTLL12-202ENST00000484118 WDR97A6NE52 1622 aa22.96■■□□□ 1.27
TTLL12-202ENST00000484118 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TTLL12-202ENST00000484118 ADRA2BP18089 450 aa22.94■■□□□ 1.26
TTLL12-202ENST00000484118 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.91■■□□□ 1.26
TTLL12-202ENST00000484118 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.9■■□□□ 1.26
TTLL12-202ENST00000484118 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.86■■□□□ 1.25
TTLL12-202ENST00000484118 GRIN2BQ13224 1484 aa22.85■■□□□ 1.25
TTLL12-202ENST00000484118 KIF27Q86VH2 1401 aa22.8■■□□□ 1.24
TTLL12-202ENST00000484118 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.77■■□□□ 1.24
TTLL12-202ENST00000484118 PBRM1Q86U86 1689 aa22.76■■□□□ 1.23
TTLL12-202ENST00000484118 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TTLL12-202ENST00000484118 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.73■■□□□ 1.23
TTLL12-202ENST00000484118 IGF1RP08069 1367 aa22.71■■□□□ 1.23
TTLL12-202ENST00000484118 FBLN2P98095 1184 aa22.7■■□□□ 1.22
TTLL12-202ENST00000484118 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TTLL12-202ENST00000484118 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.68■■□□□ 1.22
TTLL12-202ENST00000484118 OSCARQ8IYS5 282 aa22.68■■□□□ 1.22
TTLL12-202ENST00000484118 SYNJ2O15056 1496 aa22.66■■□□□ 1.22
TTLL12-202ENST00000484118 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.65■■□□□ 1.22
TTLL12-202ENST00000484118 ADAMTS12P58397 1594 aa22.62■■□□□ 1.21
TTLL12-202ENST00000484118 CHD1O14646 1710 aa22.61■■□□□ 1.21
TTLL12-202ENST00000484118 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TTLL12-202ENST00000484118 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.58■■□□□ 1.21
TTLL12-202ENST00000484118 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.57■■□□□ 1.2
TTLL12-202ENST00000484118 CUL7Q14999 1698 aa22.55■■□□□ 1.2
TTLL12-202ENST00000484118 GRIN2AQ12879 1464 aa22.54■■□□□ 1.2
TTLL12-202ENST00000484118 EEA1Q15075 1411 aa22.54■■□□□ 1.2
TTLL12-202ENST00000484118 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms