RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484104.5

TSPAN32-211, Transcript of tetraspanin 32, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN32, Length 725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN32-211ENST00000484104 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.6■■■■■ 5.53
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TSPAN32-211ENST00000484104 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.56■■■■■ 4.24
TSPAN32-211ENST00000484104 NACADO15069 1562 aa41.51■■■■■ 4.24
TSPAN32-211ENST00000484104 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
TSPAN32-211ENST00000484104 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.29■■■■■ 4.2
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TSPAN32-211ENST00000484104 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.12■■■■■ 4.17
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TSPAN32-211ENST00000484104 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.25■■■■■ 4.03
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TSPAN32-211ENST00000484104 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.72■■■■□ 3.79
TSPAN32-211ENST00000484104 SMARCA4P51532 1647 aa38.56■■■■□ 3.76
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TSPAN32-211ENST00000484104 SMARCA2P51531 1590 aa38.3■■■■□ 3.72
TSPAN32-211ENST00000484104 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.24■■■■□ 3.71
TSPAN32-211ENST00000484104 NCAPD3P42695 1498 aa38.22■■■■□ 3.71
TSPAN32-211ENST00000484104 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.19■■■■□ 3.7
TSPAN32-211ENST00000484104 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.19■■■■□ 3.7
TSPAN32-211ENST00000484104 HMGXB3Q12766 1538 aa38.15■■■■□ 3.7
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TSPAN32-211ENST00000484104 ERCC6Q03468 1493 aa37.17■■■■□ 3.54
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TSPAN32-211ENST00000484104 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.97■■■■□ 3.51
TSPAN32-211ENST00000484104 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.97■■■■□ 3.51
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TSPAN32-211ENST00000484104 CFTRP13569 1480 aa36.91■■■■□ 3.5
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TSPAN32-211ENST00000484104 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.69■■■■□ 3.46
TSPAN32-211ENST00000484104 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.69■■■■□ 3.46
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TSPAN32-211ENST00000484104 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.63■■■■□ 3.45
TSPAN32-211ENST00000484104 WDR62O43379 1518 aa36.54■■■■□ 3.44
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TSPAN32-211ENST00000484104 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.15■■■■□ 3.38
TSPAN32-211ENST00000484104 TOPBP1Q92547 1522 aa36.13■■■■□ 3.37
TSPAN32-211ENST00000484104 IFT140Q96RY7 1462 aa35.91■■■■□ 3.34
TSPAN32-211ENST00000484104 CUX1P39880 1505 aa35.86■■■■□ 3.33
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TSPAN32-211ENST00000484104 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.73■■■■□ 3.31
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TSPAN32-211ENST00000484104 TOP2BQ02880 1626 aa35.62■■■■□ 3.29
TSPAN32-211ENST00000484104 SOGA1O94964 1423 aa35.6■■■■□ 3.29
TSPAN32-211ENST00000484104 WDR97A6NE52 1622 aa35.6■■■■□ 3.29
TSPAN32-211ENST00000484104 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.59■■■■□ 3.29
TSPAN32-211ENST00000484104 SYNJ1O43426 1573 aa35.58■■■■□ 3.29
TSPAN32-211ENST00000484104 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.46■■■■□ 3.27
TSPAN32-211ENST00000484104 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.44■■■■□ 3.261e-10■■■■■ 39.9
TSPAN32-211ENST00000484104 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.42■■■■□ 3.26
TSPAN32-211ENST00000484104 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
TSPAN32-211ENST00000484104 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.34■■■■□ 3.25
TSPAN32-211ENST00000484104 PBRM1Q86U86 1689 aa35.32■■■■□ 3.24
TSPAN32-211ENST00000484104 GRIN2BQ13224 1484 aa35.26■■■■□ 3.23
TSPAN32-211ENST00000484104 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.25■■■■□ 3.23
TSPAN32-211ENST00000484104 CHD1O14646 1710 aa35.24■■■■□ 3.23
TSPAN32-211ENST00000484104 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.21■■■■□ 3.23
TSPAN32-211ENST00000484104 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
TSPAN32-211ENST00000484104 OSCARQ8IYS5 282 aa35.13■■■■□ 3.21
TSPAN32-211ENST00000484104 SYNJ2O15056 1496 aa35.04■■■■□ 3.2
TSPAN32-211ENST00000484104 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.02■■■■□ 3.2
TSPAN32-211ENST00000484104 ADAMTS12P58397 1594 aa35■■■■□ 3.19
TSPAN32-211ENST00000484104 FBLN2P98095 1184 aa34.95■■■■□ 3.19
TSPAN32-211ENST00000484104 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
TSPAN32-211ENST00000484104 KIF27Q86VH2 1401 aa34.89■■■■□ 3.18
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TSPAN32-211ENST00000484104 GRIN2AQ12879 1464 aa34.82■■■■□ 3.16
TSPAN32-211ENST00000484104 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.81■■■■□ 3.16
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TSPAN32-211ENST00000484104 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.72■■■■□ 3.15
TSPAN32-211ENST00000484104 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.72■■■■□ 3.15
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TSPAN32-211ENST00000484104 ARHGEF11O15085 1522 aa34.69■■■■□ 3.14
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TSPAN32-211ENST00000484104 CEP170Q5SW79 1584 aa34.66■■■■□ 3.14
TSPAN32-211ENST00000484104 NUP160Q12769 1436 aa34.65■■■■□ 3.14
TSPAN32-211ENST00000484104 IGF1RP08069 1367 aa34.63■■■■□ 3.13
TSPAN32-211ENST00000484104 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.5■■■■□ 3.11
TSPAN32-211ENST00000484104 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.48■■■■□ 3.11
TSPAN32-211ENST00000484104 SHROOM2Q13796 1616 aa34.46■■■■□ 3.11
TSPAN32-211ENST00000484104 ARAP1Q96P48 1450 aa34.39■■■■□ 3.1
TSPAN32-211ENST00000484104 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.33■■■■□ 3.09
TSPAN32-211ENST00000484104 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.31■■■■□ 3.08
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