RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482302.5

ELOVL1-211, Transcript of ELOVL fatty acid elongase 1, humanhuman

TSL 3

Gene ELOVL1, Length 984 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOVL1-211ENST00000482302 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.99■■■■■ 5.27
ELOVL1-211ENST00000482302 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.96■■■■■ 4.47
ELOVL1-211ENST00000482302 ABCC9O60706 1549 aa42.47■■■■■ 4.39
ELOVL1-211ENST00000482302 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.65■■■■■ 4.1
ELOVL1-211ENST00000482302 NACADO15069 1562 aa40.44■■■■■ 4.06
ELOVL1-211ENST00000482302 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.33■■■■■ 4.05
ELOVL1-211ENST00000482302 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.97■■■■□ 3.99
ELOVL1-211ENST00000482302 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
ELOVL1-211ENST00000482302 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.8■■■■□ 3.96
ELOVL1-211ENST00000482302 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.65■■■■□ 3.94
ELOVL1-211ENST00000482302 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.56■■■■□ 3.92
ELOVL1-211ENST00000482302 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.41■■■■□ 3.9
ELOVL1-211ENST00000482302 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.3■■■■□ 3.88
ELOVL1-211ENST00000482302 SCRIBQ14160 1630 aa39.2■■■■□ 3.87
ELOVL1-211ENST00000482302 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.92■■■■□ 3.82
ELOVL1-211ENST00000482302 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
ELOVL1-211ENST00000482302 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.41■■■■□ 3.74
ELOVL1-211ENST00000482302 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.19■■■■□ 3.7
ELOVL1-211ENST00000482302 SMARCA4P51532 1647 aa37.4■■■■□ 3.58
ELOVL1-211ENST00000482302 NCAPD3P42695 1498 aa37.26■■■■□ 3.56
ELOVL1-211ENST00000482302 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
ELOVL1-211ENST00000482302 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.25■■■■□ 3.55
ELOVL1-211ENST00000482302 SMARCA2P51531 1590 aa37.22■■■■□ 3.55
ELOVL1-211ENST00000482302 HMGXB3Q12766 1538 aa37.11■■■■□ 3.53
ELOVL1-211ENST00000482302 MROH2BQ7Z745 1585 aa37■■■■□ 3.51
ELOVL1-211ENST00000482302 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.97■■■■□ 3.51
ELOVL1-211ENST00000482302 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
ELOVL1-211ENST00000482302 ERCC6Q03468 1493 aa36.68■■■■□ 3.46
ELOVL1-211ENST00000482302 WIZO95785 1651 aa36.63■■■■□ 3.45
ELOVL1-211ENST00000482302 NESP48681 1621 aa36.6■■■■□ 3.45
ELOVL1-211ENST00000482302 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.44■■■■□ 3.42
ELOVL1-211ENST00000482302 CUX2O14529 1486 aa36.4■■■■□ 3.42
ELOVL1-211ENST00000482302 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
ELOVL1-211ENST00000482302 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.24■■■■□ 3.39
ELOVL1-211ENST00000482302 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
ELOVL1-211ENST00000482302 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
ELOVL1-211ENST00000482302 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.17■■■■□ 3.38
ELOVL1-211ENST00000482302 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.16■■■■□ 3.38
ELOVL1-211ENST00000482302 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.87■■■■□ 3.33
ELOVL1-211ENST00000482302 CFTRP13569 1480 aa35.86■■■■□ 3.33
ELOVL1-211ENST00000482302 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.84■■■■□ 3.33
ELOVL1-211ENST00000482302 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.81■■■■□ 3.32
ELOVL1-211ENST00000482302 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.77■■■■□ 3.32
ELOVL1-211ENST00000482302 WDR62O43379 1518 aa35.76■■■■□ 3.31
ELOVL1-211ENST00000482302 PRDM2Q13029 1718 aa35.72■■■■□ 3.31
ELOVL1-211ENST00000482302 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.71■■■■□ 3.31
ELOVL1-211ENST00000482302 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
ELOVL1-211ENST00000482302 TOPBP1Q92547 1522 aa35.18■■■■□ 3.22
ELOVL1-211ENST00000482302 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
ELOVL1-211ENST00000482302 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.13■■■■□ 3.21
ELOVL1-211ENST00000482302 ABCC8Q09428 1581 aa35.12■■■■□ 3.21
ELOVL1-211ENST00000482302 IFT140Q96RY7 1462 aa35.07■■■■□ 3.2
ELOVL1-211ENST00000482302 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
ELOVL1-211ENST00000482302 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
ELOVL1-211ENST00000482302 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
ELOVL1-211ENST00000482302 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
ELOVL1-211ENST00000482302 OSCARQ8IYS5 282 aa34.76■■■■□ 3.16
ELOVL1-211ENST00000482302 CUX1P39880 1505 aa34.76■■■■□ 3.15
ELOVL1-211ENST00000482302 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.71■■■■□ 3.15
ELOVL1-211ENST00000482302 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.71■■■■□ 3.15
ELOVL1-211ENST00000482302 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.69■■■■□ 3.14
ELOVL1-211ENST00000482302 SOGA1O94964 1423 aa34.67■■■■□ 3.14
ELOVL1-211ENST00000482302 CHD1O14646 1710 aa34.57■■■■□ 3.12
ELOVL1-211ENST00000482302 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
ELOVL1-211ENST00000482302 WDR97A6NE52 1622 aa34.54■■■■□ 3.12
ELOVL1-211ENST00000482302 TRIM41Q8WV44 630 aa34.5■■■■□ 3.11
ELOVL1-211ENST00000482302 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.4■■■■□ 3.1
ELOVL1-211ENST00000482302 FBLN2P98095 1184 aa34.4■■■■□ 3.1
ELOVL1-211ENST00000482302 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.37■■■■□ 3.09
ELOVL1-211ENST00000482302 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.37■■■■□ 3.09
ELOVL1-211ENST00000482302 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.37■■■■□ 3.09
ELOVL1-211ENST00000482302 PBRM1Q86U86 1689 aa34.36■■■■□ 3.09
ELOVL1-211ENST00000482302 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.36■■■■□ 3.09
ELOVL1-211ENST00000482302 GRIN2BQ13224 1484 aa34.35■■■■□ 3.09
ELOVL1-211ENST00000482302 TOP2BQ02880 1626 aa34.33■■■■□ 3.09
ELOVL1-211ENST00000482302 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.33■■■■□ 3.09
ELOVL1-211ENST00000482302 SYNJ1O43426 1573 aa34.32■■■■□ 3.09
ELOVL1-211ENST00000482302 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.32■■■■□ 3.08
ELOVL1-211ENST00000482302 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
ELOVL1-211ENST00000482302 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.29■■■■□ 3.08
ELOVL1-211ENST00000482302 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.28■■■■□ 3.08
ELOVL1-211ENST00000482302 ARHGEF11O15085 1522 aa34.27■■■■□ 3.08
ELOVL1-211ENST00000482302 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
ELOVL1-211ENST00000482302 SYNJ2O15056 1496 aa34.18■■■■□ 3.06
ELOVL1-211ENST00000482302 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.09■■■■□ 3.05
ELOVL1-211ENST00000482302 ADAMTS12P58397 1594 aa34.01■■■■□ 3.03
ELOVL1-211ENST00000482302 ARAP1Q96P48 1450 aa33.95■■■■□ 3.03
ELOVL1-211ENST00000482302 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.94■■■■□ 3.02
ELOVL1-211ENST00000482302 GRIN2AQ12879 1464 aa33.92■■■■□ 3.02
ELOVL1-211ENST00000482302 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.92■■■■□ 3.02
ELOVL1-211ENST00000482302 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.86■■■■□ 3.01
ELOVL1-211ENST00000482302 CEP170Q5SW79 1584 aa33.8■■■■□ 3
ELOVL1-211ENST00000482302 NUP160Q12769 1436 aa33.75■■■□□ 2.99
ELOVL1-211ENST00000482302 KIF27Q86VH2 1401 aa33.64■■■□□ 2.98
ELOVL1-211ENST00000482302 SHROOM2Q13796 1616 aa33.6■■■□□ 2.97
ELOVL1-211ENST00000482302 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.6■■■□□ 2.97
ELOVL1-211ENST00000482302 CUL7Q14999 1698 aa33.58■■■□□ 2.97
ELOVL1-211ENST00000482302 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.52■■■□□ 2.96
ELOVL1-211ENST00000482302 IGF1RP08069 1367 aa33.5■■■□□ 2.95
ELOVL1-211ENST00000482302 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms