RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481128.1

TP53BP2-208, Transcript of tumor protein p53 binding protein 2, human

TSL 2

Gene TP53BP2, Length 631 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53BP2-208	ENST00000481128	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
TP53BP2-208	ENST00000481128	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		17.21	■□□□□ 0.35
TP53BP2-208	ENST00000481128	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		16.97	■□□□□ 0.31
TP53BP2-208	ENST00000481128	ABCC9	O60706	1549 aa		16.08	■□□□□ 0.16
TP53BP2-208	ENST00000481128	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	15.64	■□□□□ 0.09
TP53BP2-208	ENST00000481128	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TP53BP2-208	ENST00000481128	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		15.57	■□□□□ 0.08
TP53BP2-208	ENST00000481128	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	15.37	■□□□□ 0.05
TP53BP2-208	ENST00000481128	POTED	Q86YR6	584 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TP53BP2-208	ENST00000481128	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		15.03	■□□□□ -0
TP53BP2-208	ENST00000481128	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	14.87	□□□□□ -0.03
TP53BP2-208	ENST00000481128	NACAD	O15069	1562 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TP53BP2-208	ENST00000481128	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		14.77	□□□□□ -0.04
TP53BP2-208	ENST00000481128	FOXD1	Q16676	465 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TP53BP2-208	ENST00000481128	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TP53BP2-208	ENST00000481128	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TP53BP2-208	ENST00000481128	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TP53BP2-208	ENST00000481128	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TP53BP2-208	ENST00000481128	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		14.5	□□□□□ -0.09
TP53BP2-208	ENST00000481128	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		14.49	□□□□□ -0.09
TP53BP2-208	ENST00000481128	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		14.42	□□□□□ -0.1
TP53BP2-208	ENST00000481128	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	14.37	□□□□□ -0.11
TP53BP2-208	ENST00000481128	SCRIB	Q14160	1630 aa		14.23	□□□□□ -0.13
TP53BP2-208	ENST00000481128	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	14.22	□□□□□ -0.13
TP53BP2-208	ENST00000481128	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TP53BP2-208	ENST00000481128	MSH5	O43196	834 aa		14.05	□□□□□ -0.16
TP53BP2-208	ENST00000481128	CUX2	O14529	1486 aa		14	□□□□□ -0.17
TP53BP2-208	ENST00000481128	ERCC6	Q03468	1493 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TP53BP2-208	ENST00000481128	NCAPD3	P42695	1498 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TP53BP2-208	ENST00000481128	NES	P48681	1621 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TP53BP2-208	ENST00000481128	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TP53BP2-208	ENST00000481128	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TP53BP2-208	ENST00000481128	HMGXB3	Q12766	1538 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TP53BP2-208	ENST00000481128	TRIM41	Q8WV44	630 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TP53BP2-208	ENST00000481128	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TP53BP2-208	ENST00000481128	SMARCA2	P51531	1590 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TP53BP2-208	ENST00000481128	SMARCA4	P51532	1647 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TP53BP2-208	ENST00000481128	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TP53BP2-208	ENST00000481128	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TP53BP2-208	ENST00000481128	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TP53BP2-208	ENST00000481128	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TP53BP2-208	ENST00000481128	WDR62	O43379	1518 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TP53BP2-208	ENST00000481128	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TP53BP2-208	ENST00000481128	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TP53BP2-208	ENST00000481128	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TP53BP2-208	ENST00000481128	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TP53BP2-208	ENST00000481128	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TP53BP2-208	ENST00000481128	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TP53BP2-208	ENST00000481128	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TP53BP2-208	ENST00000481128	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TP53BP2-208	ENST00000481128	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TP53BP2-208	ENST00000481128	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TP53BP2-208	ENST00000481128	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TP53BP2-208	ENST00000481128	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TP53BP2-208	ENST00000481128	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TP53BP2-208	ENST00000481128	ARHGEF11	O15085	1522 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TP53BP2-208	ENST00000481128	ADRA2B	P18089	450 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53BP2-208	ENST00000481128	CFTR	P13569	1480 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TP53BP2-208	ENST00000481128	WIZ	O95785	1651 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TP53BP2-208	ENST00000481128	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TP53BP2-208	ENST00000481128	ARAP1	Q96P48	1450 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TP53BP2-208	ENST00000481128	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TP53BP2-208	ENST00000481128	IFT140	Q96RY7	1462 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TP53BP2-208	ENST00000481128	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
TP53BP2-208	ENST00000481128	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TP53BP2-208	ENST00000481128	TOPBP1	Q92547	1522 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TP53BP2-208	ENST00000481128	CHD1	O14646	1710 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TP53BP2-208	ENST00000481128	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TP53BP2-208	ENST00000481128	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TP53BP2-208	ENST00000481128	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TP53BP2-208	ENST00000481128	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36	7e-7	■■■■□ 24.7
TP53BP2-208	ENST00000481128	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TP53BP2-208	ENST00000481128	PRDM2	Q13029	1718 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TP53BP2-208	ENST00000481128	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TP53BP2-208	ENST00000481128	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TP53BP2-208	ENST00000481128	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TP53BP2-208	ENST00000481128	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
TP53BP2-208	ENST00000481128	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TP53BP2-208	ENST00000481128	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TP53BP2-208	ENST00000481128	ABCC8	Q09428	1581 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TP53BP2-208	ENST00000481128	FBLN2	P98095	1184 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TP53BP2-208	ENST00000481128	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TP53BP2-208	ENST00000481128	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TP53BP2-208	ENST00000481128	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TP53BP2-208	ENST00000481128	SYNJ1	O43426	1573 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TP53BP2-208	ENST00000481128	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TP53BP2-208	ENST00000481128	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
TP53BP2-208	ENST00000481128	SOGA1	O94964	1423 aa		12.57	□□□□□ -0.4
TP53BP2-208	ENST00000481128	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		12.57	□□□□□ -0.4
TP53BP2-208	ENST00000481128	WDR97	A6NE52	1622 aa		12.56	□□□□□ -0.4
TP53BP2-208	ENST00000481128	SYNJ2	O15056	1496 aa		12.56	□□□□□ -0.4
TP53BP2-208	ENST00000481128	GRIN2B	Q13224	1484 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TP53BP2-208	ENST00000481128	CUX1	P39880	1505 aa		12.52	□□□□□ -0.4
TP53BP2-208	ENST00000481128	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TP53BP2-208	ENST00000481128	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TP53BP2-208	ENST00000481128	CEP170	Q5SW79	1584 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TP53BP2-208	ENST00000481128	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TP53BP2-208	ENST00000481128	PBRM1	Q86U86	1689 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TP53BP2-208	ENST00000481128	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TP53BP2-208	ENST00000481128	NUP160	Q12769	1436 aa		12.43	□□□□□ -0.42

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