RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480402.1

EPC1-208, Transcript of enhancer of polycomb homolog 1, humanhuman

TSL 2

Gene EPC1, Length 907 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPC1-208ENST00000480402 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.1■■■■■ 4.01
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EPC1-208ENST00000480402 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.07■■■■□ 3.05
EPC1-208ENST00000480402 NACADO15069 1562 aa33.92■■■■□ 3.02
EPC1-208ENST00000480402 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.72■■■□□ 2.99
EPC1-208ENST00000480402 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.58■■■□□ 2.97
EPC1-208ENST00000480402 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.3■■■□□ 2.92
EPC1-208ENST00000480402 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
EPC1-208ENST00000480402 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.23■■■□□ 2.91
EPC1-208ENST00000480402 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.22■■■□□ 2.91
EPC1-208ENST00000480402 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.2■■■□□ 2.91
EPC1-208ENST00000480402 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.04■■■□□ 2.88
EPC1-208ENST00000480402 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.73■■■□□ 2.83
EPC1-208ENST00000480402 SCRIBQ14160 1630 aa32.62■■■□□ 2.81
EPC1-208ENST00000480402 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
EPC1-208ENST00000480402 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.22■■■□□ 2.75
EPC1-208ENST00000480402 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.12■■■□□ 2.73
EPC1-208ENST00000480402 NCAPD3P42695 1498 aa31.33■■■□□ 2.61
EPC1-208ENST00000480402 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.21■■■□□ 2.59
EPC1-208ENST00000480402 SMARCA4P51532 1647 aa31.2■■■□□ 2.59
EPC1-208ENST00000480402 SMARCA2P51531 1590 aa31.16■■■□□ 2.58
EPC1-208ENST00000480402 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
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EPC1-208ENST00000480402 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.96■■■□□ 2.55
EPC1-208ENST00000480402 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
EPC1-208ENST00000480402 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.86■■■□□ 2.53
EPC1-208ENST00000480402 ERCC6Q03468 1493 aa30.77■■■□□ 2.52
EPC1-208ENST00000480402 CUX2O14529 1486 aa30.71■■■□□ 2.51
EPC1-208ENST00000480402 NESP48681 1621 aa30.66■■■□□ 2.5
EPC1-208ENST00000480402 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.56■■■□□ 2.48
EPC1-208ENST00000480402 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.51■■■□□ 2.47
EPC1-208ENST00000480402 WIZO95785 1651 aa30.47■■■□□ 2.47
EPC1-208ENST00000480402 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.4■■■□□ 2.46
EPC1-208ENST00000480402 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.38■■■□□ 2.45
EPC1-208ENST00000480402 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
EPC1-208ENST00000480402 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
EPC1-208ENST00000480402 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.26■■■□□ 2.43
EPC1-208ENST00000480402 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
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EPC1-208ENST00000480402 CFTRP13569 1480 aa30.06■■■□□ 2.4
EPC1-208ENST00000480402 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.99■■■□□ 2.39
EPC1-208ENST00000480402 WDR62O43379 1518 aa29.99■■■□□ 2.39
EPC1-208ENST00000480402 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.98■■■□□ 2.39
EPC1-208ENST00000480402 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.81■■■□□ 2.36
EPC1-208ENST00000480402 PRDM2Q13029 1718 aa29.71■■■□□ 2.35
EPC1-208ENST00000480402 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
EPC1-208ENST00000480402 ABCC8Q09428 1581 aa29.47■■■□□ 2.31
EPC1-208ENST00000480402 TOPBP1Q92547 1522 aa29.43■■■□□ 2.3
EPC1-208ENST00000480402 IFT140Q96RY7 1462 aa29.42■■■□□ 2.3
EPC1-208ENST00000480402 OSCARQ8IYS5 282 aa29.39■■■□□ 2.3
EPC1-208ENST00000480402 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.35■■■□□ 2.29
EPC1-208ENST00000480402 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
EPC1-208ENST00000480402 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
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EPC1-208ENST00000480402 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
EPC1-208ENST00000480402 TRIM41Q8WV44 630 aa29.13■■■□□ 2.25
EPC1-208ENST00000480402 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
EPC1-208ENST00000480402 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
EPC1-208ENST00000480402 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.242e-7■□□□□ 9.6
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EPC1-208ENST00000480402 CUX1P39880 1505 aa28.98■■■□□ 2.23
EPC1-208ENST00000480402 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.97■■■□□ 2.23
EPC1-208ENST00000480402 WDR97A6NE52 1622 aa28.94■■■□□ 2.22
EPC1-208ENST00000480402 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
EPC1-208ENST00000480402 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.87■■■□□ 2.21
EPC1-208ENST00000480402 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.87■■■□□ 2.21
EPC1-208ENST00000480402 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.87■■■□□ 2.21
EPC1-208ENST00000480402 CHD1O14646 1710 aa28.86■■■□□ 2.21
EPC1-208ENST00000480402 FBLN2P98095 1184 aa28.84■■■□□ 2.21
EPC1-208ENST00000480402 ARHGEF11O15085 1522 aa28.82■■■□□ 2.2
EPC1-208ENST00000480402 GRIN2BQ13224 1484 aa28.78■■■□□ 2.2
EPC1-208ENST00000480402 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.76■■■□□ 2.19
EPC1-208ENST00000480402 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
EPC1-208ENST00000480402 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
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EPC1-208ENST00000480402 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.69■■■□□ 2.18
EPC1-208ENST00000480402 SYNJ2O15056 1496 aa28.65■■■□□ 2.18
EPC1-208ENST00000480402 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.18
EPC1-208ENST00000480402 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.63■■■□□ 2.17
EPC1-208ENST00000480402 SYNJ1O43426 1573 aa28.6■■■□□ 2.17
EPC1-208ENST00000480402 TOP2BQ02880 1626 aa28.6■■■□□ 2.17
EPC1-208ENST00000480402 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.59■■■□□ 2.17
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EPC1-208ENST00000480402 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.58■■■□□ 2.17
EPC1-208ENST00000480402 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.58■■■□□ 2.17
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EPC1-208ENST00000480402 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.35■■■□□ 2.13
EPC1-208ENST00000480402 ADAMTS12P58397 1594 aa28.35■■■□□ 2.13
EPC1-208ENST00000480402 NUP160Q12769 1436 aa28.3■■■□□ 2.12
EPC1-208ENST00000480402 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
EPC1-208ENST00000480402 CEP170Q5SW79 1584 aa28.23■■■□□ 2.11
EPC1-208ENST00000480402 SHROOM2Q13796 1616 aa28.13■■■□□ 2.09
EPC1-208ENST00000480402 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.1■■■□□ 2.09
EPC1-208ENST00000480402 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.08■■■□□ 2.09
EPC1-208ENST00000480402 KIF27Q86VH2 1401 aa28.08■■■□□ 2.09
EPC1-208ENST00000480402 IGF1RP08069 1367 aa28.06■■■□□ 2.08
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