RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478548.1

MEN1-215, Transcript of menin 1, humanhuman

TSL 2

Gene MEN1, Length 1,341 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEN1-215ENST00000478548 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.21■■■■■ 6.91
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MEN1-215ENST00000478548 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.65■■■■■ 5.38
MEN1-215ENST00000478548 NACADO15069 1562 aa48.59■■■■■ 5.37
MEN1-215ENST00000478548 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.5■■■■■ 5.35
MEN1-215ENST00000478548 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.49■■■■■ 5.35
MEN1-215ENST00000478548 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.36■■■■■ 5.33
MEN1-215ENST00000478548 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.17■■■■■ 5.3
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MEN1-215ENST00000478548 SCRIBQ14160 1630 aa47.17■■■■■ 5.14
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MEN1-215ENST00000478548 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.66■■■■■ 5.06
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MEN1-215ENST00000478548 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.87■■■■■ 4.93
MEN1-215ENST00000478548 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.62■■■■■ 4.89
MEN1-215ENST00000478548 SMARCA4P51532 1647 aa45.15■■■■■ 4.82
MEN1-215ENST00000478548 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.07■■■■■ 4.81
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MEN1-215ENST00000478548 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.88■■■■■ 4.78
MEN1-215ENST00000478548 NCAPD3P42695 1498 aa44.88■■■■■ 4.78
MEN1-215ENST00000478548 SMARCA2P51531 1590 aa44.78■■■■■ 4.76
MEN1-215ENST00000478548 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.74■■■■■ 4.75
MEN1-215ENST00000478548 HMGXB3Q12766 1538 aa44.63■■■■■ 4.73
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MEN1-215ENST00000478548 NESP48681 1621 aa43.86■■■■■ 4.61
MEN1-215ENST00000478548 ERCC6Q03468 1493 aa43.74■■■■■ 4.59
MEN1-215ENST00000478548 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.64■■■■■ 4.58
MEN1-215ENST00000478548 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.54■■■■■ 4.56
MEN1-215ENST00000478548 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.41■■■■■ 4.54
MEN1-215ENST00000478548 CUX2O14529 1486 aa43.36■■■■■ 4.53
MEN1-215ENST00000478548 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.36■■■■■ 4.53
MEN1-215ENST00000478548 CFTRP13569 1480 aa43.32■■■■■ 4.53
MEN1-215ENST00000478548 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.27■■■■■ 4.52
MEN1-215ENST00000478548 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.23■■■■■ 4.51
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MEN1-215ENST00000478548 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.03■■■■■ 4.48
MEN1-215ENST00000478548 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.97■■■■■ 4.47
MEN1-215ENST00000478548 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.97■■■■■ 4.47
MEN1-215ENST00000478548 PRDM2Q13029 1718 aa42.97■■■■■ 4.47
MEN1-215ENST00000478548 WDR62O43379 1518 aa42.84■■■■■ 4.45
MEN1-215ENST00000478548 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
MEN1-215ENST00000478548 TOPBP1Q92547 1522 aa42.37■■■■■ 4.37
MEN1-215ENST00000478548 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.33■■■■■ 4.37
MEN1-215ENST00000478548 ABCC8Q09428 1581 aa42.31■■■■■ 4.36
MEN1-215ENST00000478548 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.31■■■■■ 4.36
MEN1-215ENST00000478548 CUX1P39880 1505 aa42.09■■■■■ 4.33
MEN1-215ENST00000478548 IFT140Q96RY7 1462 aa42.07■■■■■ 4.33
MEN1-215ENST00000478548 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
MEN1-215ENST00000478548 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
MEN1-215ENST00000478548 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
MEN1-215ENST00000478548 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.91■■■■■ 4.3
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MEN1-215ENST00000478548 SOGA1O94964 1423 aa41.82■■■■■ 4.28
MEN1-215ENST00000478548 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.78■■■■■ 4.28
MEN1-215ENST00000478548 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
MEN1-215ENST00000478548 SYNJ1O43426 1573 aa41.74■■■■■ 4.27
MEN1-215ENST00000478548 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.73■■■■■ 4.27
MEN1-215ENST00000478548 TOP2BQ02880 1626 aa41.72■■■■■ 4.27
MEN1-215ENST00000478548 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.67■■■■■ 4.265e-7■■■■■ 27.6
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MEN1-215ENST00000478548 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
MEN1-215ENST00000478548 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.52■■■■■ 4.24
MEN1-215ENST00000478548 OSCARQ8IYS5 282 aa41.49■■■■■ 4.23
MEN1-215ENST00000478548 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.36■■■■■ 4.21
MEN1-215ENST00000478548 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.33■■■■■ 4.21
MEN1-215ENST00000478548 GRIN2BQ13224 1484 aa41.31■■■■■ 4.2
MEN1-215ENST00000478548 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.28■■■■■ 4.2
MEN1-215ENST00000478548 PBRM1Q86U86 1689 aa41.25■■■■■ 4.19
MEN1-215ENST00000478548 CHD1O14646 1710 aa41.24■■■■■ 4.19
MEN1-215ENST00000478548 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
MEN1-215ENST00000478548 FBLN2P98095 1184 aa41.18■■■■■ 4.18
MEN1-215ENST00000478548 SYNJ2O15056 1496 aa41.05■■■■■ 4.16
MEN1-215ENST00000478548 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
MEN1-215ENST00000478548 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41■■■■■ 4.15
MEN1-215ENST00000478548 ADAMTS12P58397 1594 aa40.94■■■■■ 4.14
MEN1-215ENST00000478548 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
MEN1-215ENST00000478548 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
MEN1-215ENST00000478548 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
MEN1-215ENST00000478548 KIF27Q86VH2 1401 aa40.88■■■■■ 4.13
MEN1-215ENST00000478548 ARHGEF11O15085 1522 aa40.88■■■■■ 4.13
MEN1-215ENST00000478548 TRIM41Q8WV44 630 aa40.87■■■■■ 4.13
MEN1-215ENST00000478548 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.85■■■■■ 4.13
MEN1-215ENST00000478548 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.82■■■■■ 4.13
MEN1-215ENST00000478548 IGF1RP08069 1367 aa40.8■■■■■ 4.12
MEN1-215ENST00000478548 GRIN2AQ12879 1464 aa40.8■■■■■ 4.12
MEN1-215ENST00000478548 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.65■■■■■ 4.1
MEN1-215ENST00000478548 NUP160Q12769 1436 aa40.65■■■■■ 4.1
MEN1-215ENST00000478548 CEP170Q5SW79 1584 aa40.63■■■■■ 4.09
MEN1-215ENST00000478548 CUL7Q14999 1698 aa40.62■■■■■ 4.09
MEN1-215ENST00000478548 ARAP1Q96P48 1450 aa40.55■■■■■ 4.08
MEN1-215ENST00000478548 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.5■■■■■ 4.07
MEN1-215ENST00000478548 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.48■■■■■ 4.07
MEN1-215ENST00000478548 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.42■■■■■ 4.06
MEN1-215ENST00000478548 SHROOM2Q13796 1616 aa40.36■■■■■ 4.05
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