RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477206.5

GUK1-222, Transcript of guanylate kinase 1, human

TSL 2

Gene GUK1, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GUK1-222	ENST00000477206	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		42.65	■■■■■ 4.42
GUK1-222	ENST00000477206	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		38.15	■■■■□ 3.7
GUK1-222	ENST00000477206	ABCC9	O60706	1549 aa		37.69	■■■■□ 3.62
GUK1-222	ENST00000477206	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		36.07	■■■■□ 3.37
GUK1-222	ENST00000477206	NACAD	O15069	1562 aa		35.9	■■■■□ 3.34
GUK1-222	ENST00000477206	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		35.71	■■■■□ 3.31
GUK1-222	ENST00000477206	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		35.52	■■■■□ 3.28
GUK1-222	ENST00000477206	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	35.48	■■■■□ 3.27
GUK1-222	ENST00000477206	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		35.29	■■■■□ 3.24
GUK1-222	ENST00000477206	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		35.24	■■■■□ 3.23
GUK1-222	ENST00000477206	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	35.09	■■■■□ 3.21
GUK1-222	ENST00000477206	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		35	■■■■□ 3.19
GUK1-222	ENST00000477206	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		34.84	■■■■□ 3.17
GUK1-222	ENST00000477206	SCRIB	Q14160	1630 aa		34.82	■■■■□ 3.16
GUK1-222	ENST00000477206	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		34.58	■■■■□ 3.13
GUK1-222	ENST00000477206	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	34.13	■■■■□ 3.05
GUK1-222	ENST00000477206	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		34.08	■■■■□ 3.05
GUK1-222	ENST00000477206	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		33.9	■■■■□ 3.02
GUK1-222	ENST00000477206	SMARCA4	P51532	1647 aa		33.23	■■■□□ 2.91
GUK1-222	ENST00000477206	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
GUK1-222	ENST00000477206	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		33.1	■■■□□ 2.89
GUK1-222	ENST00000477206	NCAPD3	P42695	1498 aa		33.09	■■■□□ 2.89
GUK1-222	ENST00000477206	SMARCA2	P51531	1590 aa		33.05	■■■□□ 2.88
GUK1-222	ENST00000477206	HMGXB3	Q12766	1538 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GUK1-222	ENST00000477206	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		32.88	■■■□□ 2.85
GUK1-222	ENST00000477206	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GUK1-222	ENST00000477206	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
GUK1-222	ENST00000477206	WIZ	O95785	1651 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GUK1-222	ENST00000477206	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GUK1-222	ENST00000477206	NES	P48681	1621 aa		32.5	■■■□□ 2.79
GUK1-222	ENST00000477206	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		32.34	■■■□□ 2.77
GUK1-222	ENST00000477206	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
GUK1-222	ENST00000477206	CUX2	O14529	1486 aa		32.29	■■■□□ 2.76
GUK1-222	ENST00000477206	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
GUK1-222	ENST00000477206	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		32.15	■■■□□ 2.74
GUK1-222	ENST00000477206	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
GUK1-222	ENST00000477206	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GUK1-222	ENST00000477206	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GUK1-222	ENST00000477206	CFTR	P13569	1480 aa		31.86	■■■□□ 2.69
GUK1-222	ENST00000477206	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		31.85	■■■□□ 2.69
GUK1-222	ENST00000477206	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		31.82	■■■□□ 2.68
GUK1-222	ENST00000477206	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GUK1-222	ENST00000477206	WDR62	O43379	1518 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GUK1-222	ENST00000477206	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GUK1-222	ENST00000477206	PRDM2	Q13029	1718 aa		31.68	■■■□□ 2.66
GUK1-222	ENST00000477206	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		31.66	■■■□□ 2.66
GUK1-222	ENST00000477206	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
GUK1-222	ENST00000477206	TOPBP1	Q92547	1522 aa		31.25	■■■□□ 2.59
GUK1-222	ENST00000477206	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		31.21	■■■□□ 2.59
GUK1-222	ENST00000477206	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
GUK1-222	ENST00000477206	ABCC8	Q09428	1581 aa		31.15	■■■□□ 2.58
GUK1-222	ENST00000477206	IFT140	Q96RY7	1462 aa		31.14	■■■□□ 2.57
GUK1-222	ENST00000477206	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
GUK1-222	ENST00000477206	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	30.98	■■■□□ 2.55
GUK1-222	ENST00000477206	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	30.97	■■■□□ 2.55
GUK1-222	ENST00000477206	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	30.96	■■■□□ 2.55
GUK1-222	ENST00000477206	CUX1	P39880	1505 aa		30.89	■■■□□ 2.54
GUK1-222	ENST00000477206	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		30.84	■■■□□ 2.53
GUK1-222	ENST00000477206	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		30.82	■■■□□ 2.53
GUK1-222	ENST00000477206	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	30.8	■■■□□ 2.52	1e-11	■■■■□ 24.2
GUK1-222	ENST00000477206	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		30.77	■■■□□ 2.52
GUK1-222	ENST00000477206	SOGA1	O94964	1423 aa		30.76	■■■□□ 2.51
GUK1-222	ENST00000477206	WDR97	A6NE52	1622 aa		30.68	■■■□□ 2.5
GUK1-222	ENST00000477206	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	30.66	■■■□□ 2.5
GUK1-222	ENST00000477206	CHD1	O14646	1710 aa		30.66	■■■□□ 2.5
GUK1-222	ENST00000477206	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		30.57	■■■□□ 2.48
GUK1-222	ENST00000477206	TRIM41	Q8WV44	630 aa		30.53	■■■□□ 2.48
GUK1-222	ENST00000477206	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.53	■■■□□ 2.48
GUK1-222	ENST00000477206	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.52	■■■□□ 2.48
GUK1-222	ENST00000477206	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.51	■■■□□ 2.48
GUK1-222	ENST00000477206	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.51	■■■□□ 2.47
GUK1-222	ENST00000477206	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		30.5	■■■□□ 2.47
GUK1-222	ENST00000477206	GRIN2B	Q13224	1484 aa		30.5	■■■□□ 2.47
GUK1-222	ENST00000477206	PBRM1	Q86U86	1689 aa		30.49	■■■□□ 2.47
GUK1-222	ENST00000477206	FBLN2	P98095	1184 aa		30.48	■■■□□ 2.47
GUK1-222	ENST00000477206	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		30.47	■■■□□ 2.47
GUK1-222	ENST00000477206	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		30.47	■■■□□ 2.47
GUK1-222	ENST00000477206	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		30.47	■■■□□ 2.47
GUK1-222	ENST00000477206	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		30.47	■■■□□ 2.47
GUK1-222	ENST00000477206	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	30.47	■■■□□ 2.47
GUK1-222	ENST00000477206	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		30.44	■■■□□ 2.46
GUK1-222	ENST00000477206	ARHGEF11	O15085	1522 aa		30.42	■■■□□ 2.46
GUK1-222	ENST00000477206	SYNJ2	O15056	1496 aa		30.36	■■■□□ 2.45
GUK1-222	ENST00000477206	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	30.3	■■■□□ 2.44
GUK1-222	ENST00000477206	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		30.29	■■■□□ 2.44
GUK1-222	ENST00000477206	ADAMTS12	P58397	1594 aa		30.24	■■■□□ 2.43
GUK1-222	ENST00000477206	ARAP1	Q96P48	1450 aa		30.15	■■■□□ 2.42
GUK1-222	ENST00000477206	GRIN2A	Q12879	1464 aa		30.13	■■■□□ 2.41
GUK1-222	ENST00000477206	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		30.12	■■■□□ 2.41
GUK1-222	ENST00000477206	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		30.06	■■■□□ 2.4
GUK1-222	ENST00000477206	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		30.05	■■■□□ 2.4
GUK1-222	ENST00000477206	CEP170	Q5SW79	1584 aa		30.03	■■■□□ 2.4
GUK1-222	ENST00000477206	NUP160	Q12769	1436 aa		29.99	■■■□□ 2.39
GUK1-222	ENST00000477206	KIF27	Q86VH2	1401 aa		29.88	■■■□□ 2.37
GUK1-222	ENST00000477206	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		29.85	■■■□□ 2.37
GUK1-222	ENST00000477206	SHROOM2	Q13796	1616 aa		29.85	■■■□□ 2.37
GUK1-222	ENST00000477206	CUL7	Q14999	1698 aa		29.82	■■■□□ 2.36
GUK1-222	ENST00000477206	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.81	■■■□□ 2.36
GUK1-222	ENST00000477206	IGF1R	P08069	1367 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GUK1-222	ENST00000477206	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	29.65	■■■□□ 2.34

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