RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471700.6

PSME2-202, Transcript of proteasome activator subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene PSME2, Length 706 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME2-202ENST00000471700 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.96■■■■□ 3.03
PSME2-202ENST00000471700 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.3■■■□□ 2.44
PSME2-202ENST00000471700 ABCC9O60706 1549 aa29.5■■■□□ 2.31
PSME2-202ENST00000471700 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.46■■■□□ 2.15
PSME2-202ENST00000471700 NACADO15069 1562 aa28.41■■■□□ 2.14
PSME2-202ENST00000471700 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PSME2-202ENST00000471700 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.26■■■□□ 2.11
PSME2-202ENST00000471700 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.23■■■□□ 2.11
PSME2-202ENST00000471700 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.13■■■□□ 2.09
PSME2-202ENST00000471700 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.82■■■□□ 2.04
PSME2-202ENST00000471700 SCRIBQ14160 1630 aa27.62■■■□□ 2.01
PSME2-202ENST00000471700 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.52■■■□□ 2
PSME2-202ENST00000471700 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.47■■□□□ 1.991e-8■■■□□ 15
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PSME2-202ENST00000471700 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.86■■□□□ 1.89
PSME2-202ENST00000471700 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PSME2-202ENST00000471700 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.72■■□□□ 1.87
PSME2-202ENST00000471700 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.5■■□□□ 1.83
PSME2-202ENST00000471700 SMARCA4P51532 1647 aa26.4■■□□□ 1.82
PSME2-202ENST00000471700 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PSME2-202ENST00000471700 SMARCA2P51531 1590 aa26.23■■□□□ 1.79
PSME2-202ENST00000471700 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.17■■□□□ 1.78
PSME2-202ENST00000471700 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.16■■□□□ 1.78
PSME2-202ENST00000471700 NCAPD3P42695 1498 aa26.14■■□□□ 1.78
PSME2-202ENST00000471700 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.12■■□□□ 1.77
PSME2-202ENST00000471700 HMGXB3Q12766 1538 aa26.12■■□□□ 1.77
PSME2-202ENST00000471700 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PSME2-202ENST00000471700 WIZO95785 1651 aa25.92■■□□□ 1.74
PSME2-202ENST00000471700 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
PSME2-202ENST00000471700 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PSME2-202ENST00000471700 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.54■■□□□ 1.68
PSME2-202ENST00000471700 NESP48681 1621 aa25.52■■□□□ 1.68
PSME2-202ENST00000471700 ERCC6Q03468 1493 aa25.48■■□□□ 1.67
PSME2-202ENST00000471700 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.37■■□□□ 1.65
PSME2-202ENST00000471700 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.32■■□□□ 1.64
PSME2-202ENST00000471700 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.31■■□□□ 1.64
PSME2-202ENST00000471700 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.28■■□□□ 1.64
PSME2-202ENST00000471700 CFTRP13569 1480 aa25.26■■□□□ 1.63
PSME2-202ENST00000471700 PRDM2Q13029 1718 aa25.23■■□□□ 1.63
PSME2-202ENST00000471700 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PSME2-202ENST00000471700 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PSME2-202ENST00000471700 CUX2O14529 1486 aa25.18■■□□□ 1.62
PSME2-202ENST00000471700 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.15■■□□□ 1.62
PSME2-202ENST00000471700 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.14■■□□□ 1.61
PSME2-202ENST00000471700 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.09■■□□□ 1.61
PSME2-202ENST00000471700 WDR62O43379 1518 aa25.02■■□□□ 1.6
PSME2-202ENST00000471700 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PSME2-202ENST00000471700 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.76■■□□□ 1.55
PSME2-202ENST00000471700 ABCC8Q09428 1581 aa24.75■■□□□ 1.55
PSME2-202ENST00000471700 TOPBP1Q92547 1522 aa24.74■■□□□ 1.55
PSME2-202ENST00000471700 IFT140Q96RY7 1462 aa24.58■■□□□ 1.53
PSME2-202ENST00000471700 CUX1P39880 1505 aa24.56■■□□□ 1.52
PSME2-202ENST00000471700 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PSME2-202ENST00000471700 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.5■■□□□ 1.51
PSME2-202ENST00000471700 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PSME2-202ENST00000471700 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PSME2-202ENST00000471700 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PSME2-202ENST00000471700 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.43■■□□□ 1.5
PSME2-202ENST00000471700 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
PSME2-202ENST00000471700 TOP2BQ02880 1626 aa24.4■■□□□ 1.5
PSME2-202ENST00000471700 SYNJ1O43426 1573 aa24.39■■□□□ 1.5
PSME2-202ENST00000471700 SOGA1O94964 1423 aa24.39■■□□□ 1.5
PSME2-202ENST00000471700 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.38■■□□□ 1.49
PSME2-202ENST00000471700 WDR97A6NE52 1622 aa24.36■■□□□ 1.49
PSME2-202ENST00000471700 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.482e-10■□□□□ 8.2
PSME2-202ENST00000471700 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.25■■□□□ 1.47
PSME2-202ENST00000471700 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PSME2-202ENST00000471700 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.21■■□□□ 1.47
PSME2-202ENST00000471700 PBRM1Q86U86 1689 aa24.21■■□□□ 1.47
PSME2-202ENST00000471700 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.21■■□□□ 1.47
PSME2-202ENST00000471700 GRIN2BQ13224 1484 aa24.15■■□□□ 1.46
PSME2-202ENST00000471700 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.14■■□□□ 1.46
PSME2-202ENST00000471700 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.13■■□□□ 1.45
PSME2-202ENST00000471700 CHD1O14646 1710 aa24.13■■□□□ 1.45
PSME2-202ENST00000471700 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
PSME2-202ENST00000471700 OSCARQ8IYS5 282 aa24.02■■□□□ 1.44
PSME2-202ENST00000471700 SYNJ2O15056 1496 aa24■■□□□ 1.43
PSME2-202ENST00000471700 ADAMTS12P58397 1594 aa23.99■■□□□ 1.43
PSME2-202ENST00000471700 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.99■■□□□ 1.43
PSME2-202ENST00000471700 FBLN2P98095 1184 aa23.97■■□□□ 1.43
PSME2-202ENST00000471700 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PSME2-202ENST00000471700 KIF27Q86VH2 1401 aa23.91■■□□□ 1.42
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PSME2-202ENST00000471700 GRIN2AQ12879 1464 aa23.85■■□□□ 1.41
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PSME2-202ENST00000471700 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.83■■□□□ 1.41
PSME2-202ENST00000471700 TRIM41Q8WV44 630 aa23.8■■□□□ 1.4
PSME2-202ENST00000471700 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.77■■□□□ 1.4
PSME2-202ENST00000471700 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.77■■□□□ 1.4
PSME2-202ENST00000471700 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.77■■□□□ 1.4
PSME2-202ENST00000471700 ARHGEF11O15085 1522 aa23.74■■□□□ 1.39
PSME2-202ENST00000471700 CEP170Q5SW79 1584 aa23.74■■□□□ 1.39
PSME2-202ENST00000471700 NUP160Q12769 1436 aa23.71■■□□□ 1.39
PSME2-202ENST00000471700 IGF1RP08069 1367 aa23.7■■□□□ 1.38
PSME2-202ENST00000471700 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.64■■□□□ 1.38
PSME2-202ENST00000471700 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.62■■□□□ 1.37
PSME2-202ENST00000471700 SHROOM2Q13796 1616 aa23.59■■□□□ 1.37
PSME2-202ENST00000471700 ARAP1Q96P48 1450 aa23.55■■□□□ 1.36
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PSME2-202ENST00000471700 EEA1Q15075 1411 aa23.5■■□□□ 1.35
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