RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471535.1

P4HB-206, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene P4HB, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4HB-206ENST00000471535 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.69■■■■■ 6.67
P4HB-206ENST00000471535 ABCC9O60706 1549 aa50.22■■■■■ 5.63
P4HB-206ENST00000471535 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.22■■■■■ 5.63
P4HB-206ENST00000471535 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.62■■■■■ 5.21
P4HB-206ENST00000471535 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.52■■■■■ 5.2
P4HB-206ENST00000471535 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.48■■■■■ 5.19
P4HB-206ENST00000471535 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.27■■■■■ 5.16
P4HB-206ENST00000471535 NACADO15069 1562 aa47.17■■■■■ 5.14
P4HB-206ENST00000471535 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.89■■■■■ 5.1
P4HB-206ENST00000471535 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.82■■■■■ 5.09
P4HB-206ENST00000471535 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.71■■■■■ 5.07
P4HB-206ENST00000471535 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.42■■■■■ 5.02
P4HB-206ENST00000471535 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.15■■■■■ 4.98
P4HB-206ENST00000471535 SCRIBQ14160 1630 aa46.01■■■■■ 4.96
P4HB-206ENST00000471535 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.57■■■■■ 4.89
P4HB-206ENST00000471535 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.32■■■■■ 4.85
P4HB-206ENST00000471535 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.3■■■■■ 4.84
P4HB-206ENST00000471535 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
P4HB-206ENST00000471535 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.01■■■■■ 4.64
P4HB-206ENST00000471535 SMARCA4P51532 1647 aa43.94■■■■■ 4.62
P4HB-206ENST00000471535 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
P4HB-206ENST00000471535 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.74■■■■■ 4.59
P4HB-206ENST00000471535 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.64■■■■■ 4.58
P4HB-206ENST00000471535 SMARCA2P51531 1590 aa43.58■■■■■ 4.57
P4HB-206ENST00000471535 NCAPD3P42695 1498 aa43.55■■■■■ 4.56
P4HB-206ENST00000471535 CUX2O14529 1486 aa43.5■■■■■ 4.55
P4HB-206ENST00000471535 ERCC6Q03468 1493 aa43.45■■■■■ 4.55
P4HB-206ENST00000471535 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.41■■■■■ 4.54
P4HB-206ENST00000471535 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
P4HB-206ENST00000471535 HMGXB3Q12766 1538 aa43.33■■■■■ 4.53
P4HB-206ENST00000471535 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
P4HB-206ENST00000471535 WIZO95785 1651 aa43.29■■■■■ 4.52
P4HB-206ENST00000471535 NESP48681 1621 aa42.97■■■■■ 4.47
P4HB-206ENST00000471535 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
P4HB-206ENST00000471535 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
P4HB-206ENST00000471535 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.65■■■■■ 4.42
P4HB-206ENST00000471535 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
P4HB-206ENST00000471535 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.47■■■■■ 4.39
P4HB-206ENST00000471535 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.38■■■■■ 4.38
P4HB-206ENST00000471535 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.35■■■■■ 4.37
P4HB-206ENST00000471535 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.33■■■■■ 4.37
P4HB-206ENST00000471535 CFTRP13569 1480 aa42.1■■■■■ 4.33
P4HB-206ENST00000471535 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.09■■■■■ 4.33
P4HB-206ENST00000471535 WDR62O43379 1518 aa41.95■■■■■ 4.31
P4HB-206ENST00000471535 TRIM41Q8WV44 630 aa41.95■■■■■ 4.31
P4HB-206ENST00000471535 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.87■■■■■ 4.29
P4HB-206ENST00000471535 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.84■■■■■ 4.29
P4HB-206ENST00000471535 PRDM2Q13029 1718 aa41.78■■■■■ 4.28
P4HB-206ENST00000471535 OSCARQ8IYS5 282 aa41.51■■■■■ 4.24
P4HB-206ENST00000471535 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
P4HB-206ENST00000471535 TOPBP1Q92547 1522 aa41.22■■■■■ 4.19
P4HB-206ENST00000471535 ABCC8Q09428 1581 aa41.18■■■■■ 4.18
P4HB-206ENST00000471535 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.18■■■■■ 4.18
P4HB-206ENST00000471535 IFT140Q96RY7 1462 aa41.02■■■■■ 4.16
P4HB-206ENST00000471535 CUX1P39880 1505 aa41.02■■■■■ 4.16
P4HB-206ENST00000471535 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
P4HB-206ENST00000471535 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
P4HB-206ENST00000471535 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
P4HB-206ENST00000471535 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
P4HB-206ENST00000471535 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
P4HB-206ENST00000471535 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.88■■■■■ 4.13
P4HB-206ENST00000471535 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.85■■■■■ 4.13
P4HB-206ENST00000471535 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.76■■■■■ 4.12
P4HB-206ENST00000471535 SOGA1O94964 1423 aa40.76■■■■■ 4.11
P4HB-206ENST00000471535 SYNJ1O43426 1573 aa40.75■■■■■ 4.11
P4HB-206ENST00000471535 ARHGEF11O15085 1522 aa40.74■■■■■ 4.11
P4HB-206ENST00000471535 TOP2BQ02880 1626 aa40.7■■■■■ 4.11
P4HB-206ENST00000471535 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.11
P4HB-206ENST00000471535 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
P4HB-206ENST00000471535 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.67■■■■■ 4.1
P4HB-206ENST00000471535 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.56■■■■■ 4.081e-13■■■■■ 34.3
P4HB-206ENST00000471535 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.55■■■■■ 4.08
P4HB-206ENST00000471535 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
P4HB-206ENST00000471535 FBLN2P98095 1184 aa40.48■■■■■ 4.07
P4HB-206ENST00000471535 CHD1O14646 1710 aa40.47■■■■■ 4.07
P4HB-206ENST00000471535 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.42■■■■■ 4.06
P4HB-206ENST00000471535 WDR97A6NE52 1622 aa40.41■■■■■ 4.06
P4HB-206ENST00000471535 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
P4HB-206ENST00000471535 ARAP1Q96P48 1450 aa40.29■■■■■ 4.04
P4HB-206ENST00000471535 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.28■■■■■ 4.04
P4HB-206ENST00000471535 GRIN2BQ13224 1484 aa40.22■■■■■ 4.03
P4HB-206ENST00000471535 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.22■■■■■ 4.03
P4HB-206ENST00000471535 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.17■■■■■ 4.02
P4HB-206ENST00000471535 PBRM1Q86U86 1689 aa40.15■■■■■ 4.02
P4HB-206ENST00000471535 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
P4HB-206ENST00000471535 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
P4HB-206ENST00000471535 KIF27Q86VH2 1401 aa40■■■■□ 3.99
P4HB-206ENST00000471535 CLASP1Q7Z460 1538 aa40■■■■□ 3.99
P4HB-206ENST00000471535 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.93■■■■□ 3.98
P4HB-206ENST00000471535 SYNJ2O15056 1496 aa39.91■■■■□ 3.98
P4HB-206ENST00000471535 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.86■■■■□ 3.97
P4HB-206ENST00000471535 ADAMTS12P58397 1594 aa39.85■■■■□ 3.97
P4HB-206ENST00000471535 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.81■■■■□ 3.96
P4HB-206ENST00000471535 IGF1RP08069 1367 aa39.79■■■■□ 3.96
P4HB-206ENST00000471535 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.75■■■■□ 3.95
P4HB-206ENST00000471535 GRIN2AQ12879 1464 aa39.7■■■■□ 3.95
P4HB-206ENST00000471535 CUL7Q14999 1698 aa39.64■■■■□ 3.94
P4HB-206ENST00000471535 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.6■■■■□ 3.93
P4HB-206ENST00000471535 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.52■■■■□ 3.92
P4HB-206ENST00000471535 CEP170Q5SW79 1584 aa39.49■■■■□ 3.91
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