RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469804.1

KPNA4-202, Transcript of karyopherin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene KPNA4, Length 790 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA4-202ENST00000469804 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.49■■■■■ 7.43
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KPNA4-202ENST00000469804 ABCC9O60706 1549 aa53.23■■■■■ 6.11
KPNA4-202ENST00000469804 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.3■■■■■ 5.8
KPNA4-202ENST00000469804 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.25■■■■■ 5.79
KPNA4-202ENST00000469804 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.25■■■■■ 5.79
KPNA4-202ENST00000469804 NACADO15069 1562 aa51.22■■■■■ 5.79
KPNA4-202ENST00000469804 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.92■■■■■ 5.74
KPNA4-202ENST00000469804 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.82■■■■■ 5.73
KPNA4-202ENST00000469804 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.32■■■■■ 5.65
KPNA4-202ENST00000469804 SCRIBQ14160 1630 aa49.94■■■■■ 5.59
KPNA4-202ENST00000469804 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.78■■■■■ 5.56
KPNA4-202ENST00000469804 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.74■■■■■ 5.55
KPNA4-202ENST00000469804 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.09■■■■■ 5.45
KPNA4-202ENST00000469804 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.61■■■■■ 5.37
KPNA4-202ENST00000469804 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.41■■■■■ 5.34
KPNA4-202ENST00000469804 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.18■■■■■ 5.3
KPNA4-202ENST00000469804 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.94■■■■■ 5.26
KPNA4-202ENST00000469804 SMARCA4P51532 1647 aa47.74■■■■■ 5.23
KPNA4-202ENST00000469804 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.64■■■■■ 5.22
KPNA4-202ENST00000469804 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.45■■■■■ 5.19
KPNA4-202ENST00000469804 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.33■■■■■ 5.17
KPNA4-202ENST00000469804 SMARCA2P51531 1590 aa47.28■■■■■ 5.16
KPNA4-202ENST00000469804 NCAPD3P42695 1498 aa47.21■■■■■ 5.15
KPNA4-202ENST00000469804 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.2■■■■■ 5.15
KPNA4-202ENST00000469804 HMGXB3Q12766 1538 aa47.08■■■■■ 5.13
KPNA4-202ENST00000469804 WIZO95785 1651 aa47.03■■■■■ 5.12
KPNA4-202ENST00000469804 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
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KPNA4-202ENST00000469804 NESP48681 1621 aa46.17■■■■■ 4.98
KPNA4-202ENST00000469804 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.01■■■■■ 4.96
KPNA4-202ENST00000469804 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
KPNA4-202ENST00000469804 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.88■■■■■ 4.94
KPNA4-202ENST00000469804 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.85■■■■■ 4.93
KPNA4-202ENST00000469804 ERCC6Q03468 1493 aa45.81■■■■■ 4.92
KPNA4-202ENST00000469804 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.72■■■■■ 4.91
KPNA4-202ENST00000469804 CFTRP13569 1480 aa45.66■■■■■ 4.9
KPNA4-202ENST00000469804 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.6■■■■■ 4.89
KPNA4-202ENST00000469804 PRDM2Q13029 1718 aa45.54■■■■■ 4.88
KPNA4-202ENST00000469804 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.86
KPNA4-202ENST00000469804 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.4■■■■■ 4.86
KPNA4-202ENST00000469804 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.32■■■■■ 4.85
KPNA4-202ENST00000469804 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.21■■■■■ 4.83
KPNA4-202ENST00000469804 CUX2O14529 1486 aa45.19■■■■■ 4.82
KPNA4-202ENST00000469804 WDR62O43379 1518 aa45.08■■■■■ 4.81
KPNA4-202ENST00000469804 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
KPNA4-202ENST00000469804 TOPBP1Q92547 1522 aa44.72■■■■■ 4.75
KPNA4-202ENST00000469804 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.7■■■■■ 4.75
KPNA4-202ENST00000469804 ABCC8Q09428 1581 aa44.61■■■■■ 4.73
KPNA4-202ENST00000469804 CUX1P39880 1505 aa44.51■■■■■ 4.72
KPNA4-202ENST00000469804 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
KPNA4-202ENST00000469804 IFT140Q96RY7 1462 aa44.33■■■■■ 4.69
KPNA4-202ENST00000469804 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.31■■■■■ 4.68
KPNA4-202ENST00000469804 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
KPNA4-202ENST00000469804 SYNJ1O43426 1573 aa44.24■■■■■ 4.67
KPNA4-202ENST00000469804 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.24■■■■■ 4.67
KPNA4-202ENST00000469804 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.21■■■■■ 4.67
KPNA4-202ENST00000469804 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.2■■■■■ 4.67
KPNA4-202ENST00000469804 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.19■■■■■ 4.67
KPNA4-202ENST00000469804 TOP2BQ02880 1626 aa44.17■■■■■ 4.66
KPNA4-202ENST00000469804 SOGA1O94964 1423 aa44.12■■■■■ 4.65
KPNA4-202ENST00000469804 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
KPNA4-202ENST00000469804 WDR97A6NE52 1622 aa44.03■■■■■ 4.64
KPNA4-202ENST00000469804 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.94■■■■■ 4.62
KPNA4-202ENST00000469804 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
KPNA4-202ENST00000469804 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.83■■■■■ 4.61
KPNA4-202ENST00000469804 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.73■■■■■ 4.59
KPNA4-202ENST00000469804 PBRM1Q86U86 1689 aa43.7■■■■■ 4.59
KPNA4-202ENST00000469804 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.64■■■■■ 4.58
KPNA4-202ENST00000469804 GRIN2BQ13224 1484 aa43.58■■■■■ 4.57
KPNA4-202ENST00000469804 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.57■■■■■ 4.56
KPNA4-202ENST00000469804 CHD1O14646 1710 aa43.55■■■■■ 4.56
KPNA4-202ENST00000469804 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.48■■■■■ 4.55
KPNA4-202ENST00000469804 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.45■■■■■ 4.55
KPNA4-202ENST00000469804 FBLN2P98095 1184 aa43.32■■■■■ 4.53
KPNA4-202ENST00000469804 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.31■■■■■ 4.52
KPNA4-202ENST00000469804 OSCARQ8IYS5 282 aa43.3■■■■■ 4.52
KPNA4-202ENST00000469804 TRIM41Q8WV44 630 aa43.3■■■■■ 4.52
KPNA4-202ENST00000469804 ADAMTS12P58397 1594 aa43.29■■■■■ 4.52
KPNA4-202ENST00000469804 SYNJ2O15056 1496 aa43.28■■■■■ 4.52
KPNA4-202ENST00000469804 KIF27Q86VH2 1401 aa43.26■■■■■ 4.52
KPNA4-202ENST00000469804 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.5
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KPNA4-202ENST00000469804 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.08■■■■■ 4.49
KPNA4-202ENST00000469804 GRIN2AQ12879 1464 aa43.06■■■■■ 4.48
KPNA4-202ENST00000469804 IGF1RP08069 1367 aa43.04■■■■■ 4.48
KPNA4-202ENST00000469804 CUL7Q14999 1698 aa43.02■■■■■ 4.48
KPNA4-202ENST00000469804 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.97■■■■■ 4.47
KPNA4-202ENST00000469804 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.97■■■■■ 4.47
KPNA4-202ENST00000469804 CEP170Q5SW79 1584 aa42.92■■■■■ 4.46
KPNA4-202ENST00000469804 NUP160Q12769 1436 aa42.83■■■■■ 4.45
KPNA4-202ENST00000469804 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.8■■■■■ 4.44
KPNA4-202ENST00000469804 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.79■■■■■ 4.44
KPNA4-202ENST00000469804 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.79■■■■■ 4.44
KPNA4-202ENST00000469804 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.79■■■■■ 4.44
KPNA4-202ENST00000469804 ARHGEF11O15085 1522 aa42.74■■■■■ 4.43
KPNA4-202ENST00000469804 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.6■■■■■ 4.41
KPNA4-202ENST00000469804 SHROOM2Q13796 1616 aa42.57■■■■■ 4.4
KPNA4-202ENST00000469804 EEA1Q15075 1411 aa42.54■■■■■ 4.4
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