RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468776.5

PXK-207, Transcript of PX domain containing serine/threonine kinase like, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PXK, Length 1,653 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXK-207ENST00000468776 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.08■■■■■ 6.73
PXK-207ENST00000468776 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.29■■■■■ 5.64
PXK-207ENST00000468776 ABCC9O60706 1549 aa48.44■■■■■ 5.34
PXK-207ENST00000468776 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.7■■■■■ 5.23
PXK-207ENST00000468776 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.47■■■■■ 5.19
PXK-207ENST00000468776 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.24■■■■■ 5.15
PXK-207ENST00000468776 NACADO15069 1562 aa47.12■■■■■ 5.13
PXK-207ENST00000468776 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.1■■■■■ 5.13
PXK-207ENST00000468776 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.95■■■■■ 5.11
PXK-207ENST00000468776 SCRIBQ14160 1630 aa46.01■■■■■ 4.96
PXK-207ENST00000468776 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.88■■■■■ 4.93
PXK-207ENST00000468776 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.71■■■■■ 4.91
PXK-207ENST00000468776 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.49■■■■■ 4.87
PXK-207ENST00000468776 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.47■■■■■ 4.87
PXK-207ENST00000468776 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.39■■■■■ 4.7
PXK-207ENST00000468776 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
PXK-207ENST00000468776 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
PXK-207ENST00000468776 SMARCA4P51532 1647 aa44.08■■■■■ 4.65
PXK-207ENST00000468776 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.02■■■■■ 4.64
PXK-207ENST00000468776 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.85■■■■■ 4.61
PXK-207ENST00000468776 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.83■■■■■ 4.61
PXK-207ENST00000468776 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.7■■■■■ 4.59
PXK-207ENST00000468776 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.64■■■■■ 4.58
PXK-207ENST00000468776 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.62■■■■■ 4.57
PXK-207ENST00000468776 SMARCA2P51531 1590 aa43.62■■■■■ 4.57
PXK-207ENST00000468776 WIZO95785 1651 aa43.58■■■■■ 4.57
PXK-207ENST00000468776 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.5■■■■■ 4.55
PXK-207ENST00000468776 NCAPD3P42695 1498 aa43.49■■■■■ 4.55
PXK-207ENST00000468776 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
PXK-207ENST00000468776 HMGXB3Q12766 1538 aa43.31■■■■■ 4.52
PXK-207ENST00000468776 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
PXK-207ENST00000468776 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.69■■■■■ 4.42
PXK-207ENST00000468776 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.29■■■■■ 4.36
PXK-207ENST00000468776 CFTRP13569 1480 aa42.2■■■■■ 4.35
PXK-207ENST00000468776 NESP48681 1621 aa42.18■■■■■ 4.34
PXK-207ENST00000468776 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.17■■■■■ 4.34
PXK-207ENST00000468776 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.9■■■■■ 4.3
PXK-207ENST00000468776 PRDM2Q13029 1718 aa41.89■■■■■ 4.3
PXK-207ENST00000468776 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.78■■■■■ 4.28
PXK-207ENST00000468776 ERCC6Q03468 1493 aa41.68■■■■■ 4.26
PXK-207ENST00000468776 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.67■■■■■ 4.26
PXK-207ENST00000468776 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.64■■■■■ 4.26
PXK-207ENST00000468776 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.39■■■■■ 4.22
PXK-207ENST00000468776 ABCC8Q09428 1581 aa41.38■■■■■ 4.22
PXK-207ENST00000468776 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.32■■■■■ 4.21
PXK-207ENST00000468776 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
PXK-207ENST00000468776 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
PXK-207ENST00000468776 CUX1P39880 1505 aa41.23■■■■■ 4.19
PXK-207ENST00000468776 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.22■■■■■ 4.19
PXK-207ENST00000468776 TOPBP1Q92547 1522 aa41.21■■■■■ 4.19
PXK-207ENST00000468776 WDR62O43379 1518 aa41.19■■■■■ 4.19
PXK-207ENST00000468776 SYNJ1O43426 1573 aa41.14■■■■■ 4.18
PXK-207ENST00000468776 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.11■■■■■ 4.17
PXK-207ENST00000468776 TOP2BQ02880 1626 aa41.1■■■■■ 4.17
PXK-207ENST00000468776 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.07■■■■■ 4.17
PXK-207ENST00000468776 TRIM41Q8WV44 630 aa41.04■■■■■ 4.16
PXK-207ENST00000468776 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.95■■■■■ 4.15
PXK-207ENST00000468776 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
PXK-207ENST00000468776 CUX2O14529 1486 aa40.87■■■■■ 4.13
PXK-207ENST00000468776 SOGA1O94964 1423 aa40.81■■■■■ 4.12
PXK-207ENST00000468776 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.76■■■■■ 4.11
PXK-207ENST00000468776 IFT140Q96RY7 1462 aa40.73■■■■■ 4.11
PXK-207ENST00000468776 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
PXK-207ENST00000468776 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.6■■■■■ 4.09
PXK-207ENST00000468776 WDR97A6NE52 1622 aa40.51■■■■■ 4.08
PXK-207ENST00000468776 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
PXK-207ENST00000468776 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
PXK-207ENST00000468776 KIF27Q86VH2 1401 aa40.39■■■■■ 4.06
PXK-207ENST00000468776 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.39■■■■■ 4.06
PXK-207ENST00000468776 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.33■■■■■ 4.05
PXK-207ENST00000468776 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.32■■■■■ 4.05
PXK-207ENST00000468776 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.04
PXK-207ENST00000468776 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.32■■■■■ 4.04
PXK-207ENST00000468776 EEA1Q15075 1411 aa40.2■■■■■ 4.03
PXK-207ENST00000468776 GRIN2BQ13224 1484 aa40.19■■■■■ 4.02
PXK-207ENST00000468776 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
PXK-207ENST00000468776 IGF1RP08069 1367 aa40.15■■■■■ 4.02
PXK-207ENST00000468776 PBRM1Q86U86 1689 aa40.14■■■■■ 4.02
PXK-207ENST00000468776 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.12■■■■■ 4.01
PXK-207ENST00000468776 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.09■■■■■ 4.01
PXK-207ENST00000468776 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.01■■■■□ 3.99
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PXK-207ENST00000468776 CUL7Q14999 1698 aa39.91■■■■□ 3.98
PXK-207ENST00000468776 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.9■■■■□ 3.98
PXK-207ENST00000468776 ADAMTS12P58397 1594 aa39.87■■■■□ 3.97
PXK-207ENST00000468776 PRXQ9BXM0 1461 aa39.83■■■■□ 3.97
PXK-207ENST00000468776 SYNJ2O15056 1496 aa39.82■■■■□ 3.97
PXK-207ENST00000468776 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
PXK-207ENST00000468776 FBLN2P98095 1184 aa39.79■■■■□ 3.96
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PXK-207ENST00000468776 KIF21BO75037 1637 aa39.69■■■■□ 3.94
PXK-207ENST00000468776 GRIN2AQ12879 1464 aa39.67■■■■□ 3.94
PXK-207ENST00000468776 CHD1O14646 1710 aa39.65■■■■□ 3.94
PXK-207ENST00000468776 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.6■■■■□ 3.93
PXK-207ENST00000468776 GOLGA3Q08378 1498 aa39.55■■■■□ 3.92
PXK-207ENST00000468776 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.47■■■■□ 3.91
PXK-207ENST00000468776 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
PXK-207ENST00000468776 OSCARQ8IYS5 282 aa39.45■■■■□ 3.91
PXK-207ENST00000468776 NUP160Q12769 1436 aa39.45■■■■□ 3.91
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