RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466975.5

ZNF638-214, Transcript of zinc finger protein 638, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF638, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF638-214ENST00000466975 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.66■■■□□ 2.82
ZNF638-214ENST00000466975 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.2■■■□□ 2.27
ZNF638-214ENST00000466975 ABCC9O60706 1549 aa28.85■■■□□ 2.21
ZNF638-214ENST00000466975 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.73■■■□□ 2.03
ZNF638-214ENST00000466975 NACADO15069 1562 aa27.63■■■□□ 2.01
ZNF638-214ENST00000466975 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.5■■□□□ 1.99
ZNF638-214ENST00000466975 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.41■■□□□ 1.98
ZNF638-214ENST00000466975 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
ZNF638-214ENST00000466975 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.1■■□□□ 1.93
ZNF638-214ENST00000466975 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
ZNF638-214ENST00000466975 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.79■■□□□ 1.88
ZNF638-214ENST00000466975 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.76■■□□□ 1.87
ZNF638-214ENST00000466975 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.72■■□□□ 1.87
ZNF638-214ENST00000466975 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.71■■□□□ 1.87
ZNF638-214ENST00000466975 SCRIBQ14160 1630 aa26.49■■□□□ 1.83
ZNF638-214ENST00000466975 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
ZNF638-214ENST00000466975 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.07■■□□□ 1.76
ZNF638-214ENST00000466975 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.05■■□□□ 1.76
ZNF638-214ENST00000466975 NCAPD3P42695 1498 aa25.5■■□□□ 1.67
ZNF638-214ENST00000466975 SMARCA2P51531 1590 aa25.41■■□□□ 1.66
ZNF638-214ENST00000466975 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
ZNF638-214ENST00000466975 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.38■■□□□ 1.65
ZNF638-214ENST00000466975 SMARCA4P51532 1647 aa25.36■■□□□ 1.65
ZNF638-214ENST00000466975 HMGXB3Q12766 1538 aa25.3■■□□□ 1.64
ZNF638-214ENST00000466975 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.19■■□□□ 1.62
ZNF638-214ENST00000466975 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
ZNF638-214ENST00000466975 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.06■■□□□ 1.6
ZNF638-214ENST00000466975 ERCC6Q03468 1493 aa25.04■■□□□ 1.6
ZNF638-214ENST00000466975 CUX2O14529 1486 aa24.95■■□□□ 1.58
ZNF638-214ENST00000466975 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.87■■□□□ 1.57
ZNF638-214ENST00000466975 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.81■■□□□ 1.56
ZNF638-214ENST00000466975 NESP48681 1621 aa24.79■■□□□ 1.56
ZNF638-214ENST00000466975 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.74■■□□□ 1.55
ZNF638-214ENST00000466975 WIZO95785 1651 aa24.72■■□□□ 1.55
ZNF638-214ENST00000466975 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
ZNF638-214ENST00000466975 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.61■■□□□ 1.53
ZNF638-214ENST00000466975 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
ZNF638-214ENST00000466975 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
ZNF638-214ENST00000466975 CFTRP13569 1480 aa24.47■■□□□ 1.51
ZNF638-214ENST00000466975 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.45■■□□□ 1.51
ZNF638-214ENST00000466975 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.45■■□□□ 1.5
ZNF638-214ENST00000466975 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.43■■□□□ 1.5
ZNF638-214ENST00000466975 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.39■■□□□ 1.5
ZNF638-214ENST00000466975 WDR62O43379 1518 aa24.35■■□□□ 1.49
ZNF638-214ENST00000466975 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.27■■□□□ 1.48
ZNF638-214ENST00000466975 PRDM2Q13029 1718 aa24.12■■□□□ 1.45
ZNF638-214ENST00000466975 ABCC8Q09428 1581 aa24.11■■□□□ 1.45
ZNF638-214ENST00000466975 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
ZNF638-214ENST00000466975 IFT140Q96RY7 1462 aa23.97■■□□□ 1.43
ZNF638-214ENST00000466975 TOPBP1Q92547 1522 aa23.93■■□□□ 1.42
ZNF638-214ENST00000466975 OSCARQ8IYS5 282 aa23.9■■□□□ 1.42
ZNF638-214ENST00000466975 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.89■■□□□ 1.41
ZNF638-214ENST00000466975 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
ZNF638-214ENST00000466975 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
ZNF638-214ENST00000466975 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
ZNF638-214ENST00000466975 SOGA1O94964 1423 aa23.68■■□□□ 1.38
ZNF638-214ENST00000466975 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
ZNF638-214ENST00000466975 WDR97A6NE52 1622 aa23.62■■□□□ 1.37
ZNF638-214ENST00000466975 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
ZNF638-214ENST00000466975 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.371e-12■■■■■ 26.8
ZNF638-214ENST00000466975 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.57■■□□□ 1.36
ZNF638-214ENST00000466975 TRIM41Q8WV44 630 aa23.55■■□□□ 1.36
ZNF638-214ENST00000466975 CUX1P39880 1505 aa23.54■■□□□ 1.36
ZNF638-214ENST00000466975 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.54■■□□□ 1.36
ZNF638-214ENST00000466975 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ZNF638-214ENST00000466975 FBLN2P98095 1184 aa23.5■■□□□ 1.35
ZNF638-214ENST00000466975 GRIN2BQ13224 1484 aa23.46■■□□□ 1.35
ZNF638-214ENST00000466975 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ZNF638-214ENST00000466975 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ZNF638-214ENST00000466975 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
ZNF638-214ENST00000466975 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.39■■□□□ 1.34
ZNF638-214ENST00000466975 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.37■■□□□ 1.33
ZNF638-214ENST00000466975 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.37■■□□□ 1.33
ZNF638-214ENST00000466975 SYNJ2O15056 1496 aa23.34■■□□□ 1.33
ZNF638-214ENST00000466975 ARHGEF11O15085 1522 aa23.33■■□□□ 1.33
ZNF638-214ENST00000466975 CHD1O14646 1710 aa23.33■■□□□ 1.32
ZNF638-214ENST00000466975 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.32■■□□□ 1.32
ZNF638-214ENST00000466975 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.32■■□□□ 1.32
ZNF638-214ENST00000466975 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.32■■□□□ 1.32
ZNF638-214ENST00000466975 TOP2BQ02880 1626 aa23.31■■□□□ 1.32
ZNF638-214ENST00000466975 SYNJ1O43426 1573 aa23.29■■□□□ 1.32
ZNF638-214ENST00000466975 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.26■■□□□ 1.31
ZNF638-214ENST00000466975 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.23■■□□□ 1.31
ZNF638-214ENST00000466975 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.22■■□□□ 1.31
ZNF638-214ENST00000466975 PBRM1Q86U86 1689 aa23.19■■□□□ 1.3
ZNF638-214ENST00000466975 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.17■■□□□ 1.3
ZNF638-214ENST00000466975 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.14■■□□□ 1.3
ZNF638-214ENST00000466975 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.14■■□□□ 1.29
ZNF638-214ENST00000466975 GRIN2AQ12879 1464 aa23.1■■□□□ 1.29
ZNF638-214ENST00000466975 ARAP1Q96P48 1450 aa23.09■■□□□ 1.29
ZNF638-214ENST00000466975 ADAMTS12P58397 1594 aa23.05■■□□□ 1.28
ZNF638-214ENST00000466975 NUP160Q12769 1436 aa23.02■■□□□ 1.28
ZNF638-214ENST00000466975 KIF27Q86VH2 1401 aa22.99■■□□□ 1.27
ZNF638-214ENST00000466975 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ZNF638-214ENST00000466975 CEP170Q5SW79 1584 aa22.89■■□□□ 1.26
ZNF638-214ENST00000466975 IGF1RP08069 1367 aa22.88■■□□□ 1.25
ZNF638-214ENST00000466975 JPH4Q96JJ6 628 aa22.87■■□□□ 1.25
ZNF638-214ENST00000466975 CUL7Q14999 1698 aa22.82■■□□□ 1.24
ZNF638-214ENST00000466975 SHROOM2Q13796 1616 aa22.82■■□□□ 1.24
ZNF638-214ENST00000466975 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms