RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466861.1

SUMO3-205, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2

Gene SUMO3, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-205ENST00000466861 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.42■■■■■ 6.62
SUMO3-205ENST00000466861 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.18■■■■■ 5.62
SUMO3-205ENST00000466861 ABCC9O60706 1549 aa48.74■■■■■ 5.39
SUMO3-205ENST00000466861 NACADO15069 1562 aa47.14■■■■■ 5.14
SUMO3-205ENST00000466861 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.11■■■■■ 5.13
SUMO3-205ENST00000466861 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.03■■■■■ 5.12
SUMO3-205ENST00000466861 MYO15BQ96JP2 1530 aa47■■■■■ 5.11
SUMO3-205ENST00000466861 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.87■■■■■ 5.09
SUMO3-205ENST00000466861 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.81■■■■■ 5.08
SUMO3-205ENST00000466861 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.99■■■■■ 4.95
SUMO3-205ENST00000466861 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.62■■■■■ 4.89
SUMO3-205ENST00000466861 SCRIBQ14160 1630 aa45.6■■■■■ 4.89
SUMO3-205ENST00000466861 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.53■■■■■ 4.88
SUMO3-205ENST00000466861 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.36■■■■■ 4.85
SUMO3-205ENST00000466861 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.57■■■■■ 4.73
SUMO3-205ENST00000466861 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.42■■■■■ 4.7
SUMO3-205ENST00000466861 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.17■■■■■ 4.66
SUMO3-205ENST00000466861 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.85■■■■■ 4.61
SUMO3-205ENST00000466861 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.75■■■■■ 4.59
SUMO3-205ENST00000466861 SMARCA4P51532 1647 aa43.73■■■■■ 4.59
SUMO3-205ENST00000466861 SMARCA2P51531 1590 aa43.48■■■■■ 4.55
SUMO3-205ENST00000466861 NCAPD3P42695 1498 aa43.47■■■■■ 4.55
SUMO3-205ENST00000466861 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.45■■■■■ 4.55
SUMO3-205ENST00000466861 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.41■■■■■ 4.54
SUMO3-205ENST00000466861 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.39■■■■■ 4.54
SUMO3-205ENST00000466861 HMGXB3Q12766 1538 aa43.27■■■■■ 4.52
SUMO3-205ENST00000466861 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
SUMO3-205ENST00000466861 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
SUMO3-205ENST00000466861 WIZO95785 1651 aa42.93■■■■■ 4.46
SUMO3-205ENST00000466861 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.41
SUMO3-205ENST00000466861 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.31■■■■■ 4.36
SUMO3-205ENST00000466861 NESP48681 1621 aa42.21■■■■■ 4.35
SUMO3-205ENST00000466861 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.17■■■■■ 4.34
SUMO3-205ENST00000466861 ERCC6Q03468 1493 aa42.06■■■■■ 4.32
SUMO3-205ENST00000466861 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.02■■■■■ 4.32
SUMO3-205ENST00000466861 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.01■■■■■ 4.32
SUMO3-205ENST00000466861 CFTRP13569 1480 aa41.97■■■■■ 4.31
SUMO3-205ENST00000466861 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
SUMO3-205ENST00000466861 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.78■■■■■ 4.28
SUMO3-205ENST00000466861 PRDM2Q13029 1718 aa41.71■■■■■ 4.27
SUMO3-205ENST00000466861 CUX2O14529 1486 aa41.68■■■■■ 4.26
SUMO3-205ENST00000466861 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.66■■■■■ 4.26
SUMO3-205ENST00000466861 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
SUMO3-205ENST00000466861 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.61■■■■■ 4.25
SUMO3-205ENST00000466861 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.53■■■■■ 4.24
SUMO3-205ENST00000466861 WDR62O43379 1518 aa41.4■■■■■ 4.22
SUMO3-205ENST00000466861 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
SUMO3-205ENST00000466861 ABCC8Q09428 1581 aa41.15■■■■■ 4.18
SUMO3-205ENST00000466861 TOPBP1Q92547 1522 aa41.01■■■■■ 4.16
SUMO3-205ENST00000466861 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41■■■■■ 4.15
SUMO3-205ENST00000466861 IFT140Q96RY7 1462 aa40.77■■■■■ 4.12
SUMO3-205ENST00000466861 CUX1P39880 1505 aa40.72■■■■■ 4.11
SUMO3-205ENST00000466861 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
SUMO3-205ENST00000466861 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.57■■■■■ 4.08
SUMO3-205ENST00000466861 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
SUMO3-205ENST00000466861 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.55■■■■■ 4.08
SUMO3-205ENST00000466861 SOGA1O94964 1423 aa40.5■■■■■ 4.07
SUMO3-205ENST00000466861 TOP2BQ02880 1626 aa40.48■■■■■ 4.07
SUMO3-205ENST00000466861 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.48■■■■■ 4.07
SUMO3-205ENST00000466861 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
SUMO3-205ENST00000466861 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.41■■■■■ 4.06
SUMO3-205ENST00000466861 WDR97A6NE52 1622 aa40.4■■■■■ 4.06
SUMO3-205ENST00000466861 SYNJ1O43426 1573 aa40.38■■■■■ 4.05
SUMO3-205ENST00000466861 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
SUMO3-205ENST00000466861 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.26■■■■■ 4.03
SUMO3-205ENST00000466861 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.24■■■■■ 4.039e-7■□□□□ 8.2
SUMO3-205ENST00000466861 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
SUMO3-205ENST00000466861 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.17■■■■■ 4.02
SUMO3-205ENST00000466861 GRIN2BQ13224 1484 aa40.06■■■■■ 4
SUMO3-205ENST00000466861 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.06■■■■■ 4
SUMO3-205ENST00000466861 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.05■■■■■ 4
SUMO3-205ENST00000466861 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
SUMO3-205ENST00000466861 PBRM1Q86U86 1689 aa39.95■■■■□ 3.99
SUMO3-205ENST00000466861 OSCARQ8IYS5 282 aa39.93■■■■□ 3.98
SUMO3-205ENST00000466861 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.91■■■■□ 3.98
SUMO3-205ENST00000466861 CHD1O14646 1710 aa39.81■■■■□ 3.96
SUMO3-205ENST00000466861 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.81■■■■□ 3.96
SUMO3-205ENST00000466861 SYNJ2O15056 1496 aa39.77■■■■□ 3.96
SUMO3-205ENST00000466861 KIF27Q86VH2 1401 aa39.73■■■■□ 3.95
SUMO3-205ENST00000466861 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
SUMO3-205ENST00000466861 FBLN2P98095 1184 aa39.69■■■■□ 3.94
SUMO3-205ENST00000466861 ADAMTS12P58397 1594 aa39.64■■■■□ 3.94
SUMO3-205ENST00000466861 TRIM41Q8WV44 630 aa39.64■■■■□ 3.94
SUMO3-205ENST00000466861 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.64■■■■□ 3.94
SUMO3-205ENST00000466861 GRIN2AQ12879 1464 aa39.51■■■■□ 3.92
SUMO3-205ENST00000466861 IGF1RP08069 1367 aa39.51■■■■□ 3.92
SUMO3-205ENST00000466861 CUL7Q14999 1698 aa39.47■■■■□ 3.91
SUMO3-205ENST00000466861 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.43■■■■□ 3.9
SUMO3-205ENST00000466861 NUP160Q12769 1436 aa39.37■■■■□ 3.89
SUMO3-205ENST00000466861 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.29■■■■□ 3.88
SUMO3-205ENST00000466861 CEP170Q5SW79 1584 aa39.27■■■■□ 3.88
SUMO3-205ENST00000466861 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.26■■■■□ 3.88
SUMO3-205ENST00000466861 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.24■■■■□ 3.87
SUMO3-205ENST00000466861 ARHGEF11O15085 1522 aa39.24■■■■□ 3.87
SUMO3-205ENST00000466861 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.22■■■■□ 3.87
SUMO3-205ENST00000466861 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.22■■■■□ 3.87
SUMO3-205ENST00000466861 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.22■■■■□ 3.87
SUMO3-205ENST00000466861 EEA1Q15075 1411 aa39.14■■■■□ 3.86
SUMO3-205ENST00000466861 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.09■■■■□ 3.85
SUMO3-205ENST00000466861 SHROOM2Q13796 1616 aa39.06■■■■□ 3.84
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