RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466076.1

BCR-208, Transcript of BCR, RhoGEF and GTPase activating protein, humanhuman

TSL 3

Gene BCR, Length 495 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCR-208ENST00000466076 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.6■■■■□ 3.61
BCR-208ENST00000466076 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.23■■■□□ 2.91
BCR-208ENST00000466076 ABCC9O60706 1549 aa31.9■■■□□ 2.7
BCR-208ENST00000466076 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
BCR-208ENST00000466076 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.2■■■□□ 2.59
BCR-208ENST00000466076 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.15■■■□□ 2.58
BCR-208ENST00000466076 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.14■■■□□ 2.58
BCR-208ENST00000466076 NACADO15069 1562 aa31.12■■■□□ 2.57
BCR-208ENST00000466076 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31■■■□□ 2.55
BCR-208ENST00000466076 SCRIBQ14160 1630 aa30.29■■■□□ 2.44
BCR-208ENST00000466076 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.22■■■□□ 2.43
BCR-208ENST00000466076 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.98■■■□□ 2.39
BCR-208ENST00000466076 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.94■■■□□ 2.38
BCR-208ENST00000466076 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.88■■■□□ 2.37
BCR-208ENST00000466076 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
BCR-208ENST00000466076 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.17■■■□□ 2.26
BCR-208ENST00000466076 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
BCR-208ENST00000466076 SMARCA4P51532 1647 aa29.05■■■□□ 2.24
BCR-208ENST00000466076 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.94■■■□□ 2.22
BCR-208ENST00000466076 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.91■■■□□ 2.22
BCR-208ENST00000466076 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
BCR-208ENST00000466076 SMARCA2P51531 1590 aa28.79■■■□□ 2.2
BCR-208ENST00000466076 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.79■■■□□ 2.2
BCR-208ENST00000466076 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.76■■■□□ 2.19
BCR-208ENST00000466076 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.72■■■□□ 2.19
BCR-208ENST00000466076 NCAPD3P42695 1498 aa28.69■■■□□ 2.18
BCR-208ENST00000466076 WIZO95785 1651 aa28.65■■■□□ 2.18
BCR-208ENST00000466076 HMGXB3Q12766 1538 aa28.61■■■□□ 2.17
BCR-208ENST00000466076 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
BCR-208ENST00000466076 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
BCR-208ENST00000466076 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
BCR-208ENST00000466076 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.08■■■□□ 2.09
BCR-208ENST00000466076 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.87■■■□□ 2.05
BCR-208ENST00000466076 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.86■■■□□ 2.05
BCR-208ENST00000466076 CFTRP13569 1480 aa27.83■■■□□ 2.04
BCR-208ENST00000466076 NESP48681 1621 aa27.74■■■□□ 2.03
BCR-208ENST00000466076 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.67■■■□□ 2.02
BCR-208ENST00000466076 PRDM2Q13029 1718 aa27.66■■■□□ 2.02
BCR-208ENST00000466076 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.54■■■□□ 2
BCR-208ENST00000466076 ERCC6Q03468 1493 aa27.51■■■□□ 2
BCR-208ENST00000466076 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.47■■□□□ 1.99
BCR-208ENST00000466076 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.46■■□□□ 1.99
BCR-208ENST00000466076 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.32■■□□□ 1.96
BCR-208ENST00000466076 ABCC8Q09428 1581 aa27.27■■□□□ 1.96
BCR-208ENST00000466076 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
BCR-208ENST00000466076 WDR62O43379 1518 aa27.21■■□□□ 1.95
BCR-208ENST00000466076 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.2■■□□□ 1.94
BCR-208ENST00000466076 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
BCR-208ENST00000466076 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.19■■□□□ 1.94
BCR-208ENST00000466076 TOPBP1Q92547 1522 aa27.16■■□□□ 1.94
BCR-208ENST00000466076 CUX1P39880 1505 aa27.13■■□□□ 1.93
BCR-208ENST00000466076 TOP2BQ02880 1626 aa27.08■■□□□ 1.93
BCR-208ENST00000466076 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.07■■□□□ 1.92
BCR-208ENST00000466076 SYNJ1O43426 1573 aa27.05■■□□□ 1.92
BCR-208ENST00000466076 CUX2O14529 1486 aa27.05■■□□□ 1.92
BCR-208ENST00000466076 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.97■■□□□ 1.91
BCR-208ENST00000466076 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
BCR-208ENST00000466076 TRIM41Q8WV44 630 aa26.94■■□□□ 1.9
BCR-208ENST00000466076 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.92■■□□□ 1.9
BCR-208ENST00000466076 IFT140Q96RY7 1462 aa26.89■■□□□ 1.9
BCR-208ENST00000466076 SOGA1O94964 1423 aa26.87■■□□□ 1.89
BCR-208ENST00000466076 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
BCR-208ENST00000466076 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.8■■□□□ 1.88
BCR-208ENST00000466076 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.76■■□□□ 1.87
BCR-208ENST00000466076 WDR97A6NE52 1622 aa26.72■■□□□ 1.87
BCR-208ENST00000466076 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
BCR-208ENST00000466076 KIF27Q86VH2 1401 aa26.62■■□□□ 1.85
BCR-208ENST00000466076 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
BCR-208ENST00000466076 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
BCR-208ENST00000466076 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.59■■□□□ 1.85
BCR-208ENST00000466076 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.58■■□□□ 1.85
BCR-208ENST00000466076 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.843e-14■■■■□ 24.1
BCR-208ENST00000466076 EEA1Q15075 1411 aa26.52■■□□□ 1.84
BCR-208ENST00000466076 GRIN2BQ13224 1484 aa26.51■■□□□ 1.83
BCR-208ENST00000466076 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.48■■□□□ 1.83
BCR-208ENST00000466076 PBRM1Q86U86 1689 aa26.47■■□□□ 1.83
BCR-208ENST00000466076 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.42■■□□□ 1.82
BCR-208ENST00000466076 IGF1RP08069 1367 aa26.4■■□□□ 1.82
BCR-208ENST00000466076 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
BCR-208ENST00000466076 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.36■■□□□ 1.81
BCR-208ENST00000466076 CUL7Q14999 1698 aa26.34■■□□□ 1.81
BCR-208ENST00000466076 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.33■■□□□ 1.81
BCR-208ENST00000466076 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.31■■□□□ 1.8
BCR-208ENST00000466076 ADAMTS12P58397 1594 aa26.3■■□□□ 1.8
BCR-208ENST00000466076 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
BCR-208ENST00000466076 SYNJ2O15056 1496 aa26.28■■□□□ 1.8
BCR-208ENST00000466076 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.27■■□□□ 1.8
BCR-208ENST00000466076 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
BCR-208ENST00000466076 PRXQ9BXM0 1461 aa26.22■■□□□ 1.79
BCR-208ENST00000466076 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.19■■□□□ 1.78
BCR-208ENST00000466076 FBLN2P98095 1184 aa26.16■■□□□ 1.78
BCR-208ENST00000466076 GRIN2AQ12879 1464 aa26.16■■□□□ 1.78
BCR-208ENST00000466076 KIF21BO75037 1637 aa26.14■■□□□ 1.78
BCR-208ENST00000466076 CHD1O14646 1710 aa26.14■■□□□ 1.77
BCR-208ENST00000466076 GOLGA3Q08378 1498 aa26.04■■□□□ 1.76
BCR-208ENST00000466076 NUP160Q12769 1436 aa26.02■■□□□ 1.76
BCR-208ENST00000466076 OSCARQ8IYS5 282 aa26.01■■□□□ 1.75
BCR-208ENST00000466076 CEP170Q5SW79 1584 aa25.96■■□□□ 1.75
BCR-208ENST00000466076 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.92■■□□□ 1.74
BCR-208ENST00000466076 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
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