RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464849.5

ANKRD54-209, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 456 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-209ENST00000464849 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.03■■■□□ 2.56
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ANKRD54-209ENST00000464849 ABCC9O60706 1549 aa27.55■■■□□ 2
ANKRD54-209ENST00000464849 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.29■■□□□ 1.8
ANKRD54-209ENST00000464849 NACADO15069 1562 aa26.17■■□□□ 1.78
ANKRD54-209ENST00000464849 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.1■■□□□ 1.77
ANKRD54-209ENST00000464849 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.88■■□□□ 1.73
ANKRD54-209ENST00000464849 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
ANKRD54-209ENST00000464849 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.7
ANKRD54-209ENST00000464849 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.66■■□□□ 1.7
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ANKRD54-209ENST00000464849 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.58■■□□□ 1.69
ANKRD54-209ENST00000464849 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.52■■□□□ 1.68
ANKRD54-209ENST00000464849 SCRIBQ14160 1630 aa25.34■■□□□ 1.65
ANKRD54-209ENST00000464849 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD54-209ENST00000464849 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
ANKRD54-209ENST00000464849 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.87■■□□□ 1.57
ANKRD54-209ENST00000464849 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.78■■□□□ 1.56
ANKRD54-209ENST00000464849 SMARCA4P51532 1647 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-209ENST00000464849 NCAPD3P42695 1498 aa24.15■■□□□ 1.46
ANKRD54-209ENST00000464849 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD54-209ENST00000464849 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54-209ENST00000464849 SMARCA2P51531 1590 aa24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-209ENST00000464849 HMGXB3Q12766 1538 aa24.02■■□□□ 1.44
ANKRD54-209ENST00000464849 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.93■■□□□ 1.42
ANKRD54-209ENST00000464849 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
ANKRD54-209ENST00000464849 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.91■■□□□ 1.42
ANKRD54-209ENST00000464849 ERCC6Q03468 1493 aa23.78■■□□□ 1.4
ANKRD54-209ENST00000464849 NESP48681 1621 aa23.73■■□□□ 1.39
ANKRD54-209ENST00000464849 WIZO95785 1651 aa23.64■■□□□ 1.37
ANKRD54-209ENST00000464849 CUX2O14529 1486 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-209ENST00000464849 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.57■■□□□ 1.36
ANKRD54-209ENST00000464849 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
ANKRD54-209ENST00000464849 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD54-209ENST00000464849 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD54-209ENST00000464849 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ANKRD54-209ENST00000464849 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54-209ENST00000464849 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-209ENST00000464849 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD54-209ENST00000464849 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54-209ENST00000464849 CFTRP13569 1480 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-209ENST00000464849 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD54-209ENST00000464849 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54-209ENST00000464849 WDR62O43379 1518 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54-209ENST00000464849 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD54-209ENST00000464849 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ANKRD54-209ENST00000464849 PRDM2Q13029 1718 aa22.97■■□□□ 1.27
ANKRD54-209ENST00000464849 TOPBP1Q92547 1522 aa22.77■■□□□ 1.24
ANKRD54-209ENST00000464849 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD54-209ENST00000464849 IFT140Q96RY7 1462 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54-209ENST00000464849 ABCC8Q09428 1581 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54-209ENST00000464849 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54-209ENST00000464849 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54-209ENST00000464849 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54-209ENST00000464849 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54-209ENST00000464849 OSCARQ8IYS5 282 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54-209ENST00000464849 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ANKRD54-209ENST00000464849 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54-209ENST00000464849 CUX1P39880 1505 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54-209ENST00000464849 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54-209ENST00000464849 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54-209ENST00000464849 SOGA1O94964 1423 aa22.44■■□□□ 1.18
ANKRD54-209ENST00000464849 TRIM41Q8WV44 630 aa22.44■■□□□ 1.18
ANKRD54-209ENST00000464849 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
ANKRD54-209ENST00000464849 WDR97A6NE52 1622 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54-209ENST00000464849 CHD1O14646 1710 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54-209ENST00000464849 FBLN2P98095 1184 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54-209ENST00000464849 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54-209ENST00000464849 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD54-209ENST00000464849 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD54-209ENST00000464849 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD54-209ENST00000464849 ARHGEF11O15085 1522 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54-209ENST00000464849 GRIN2BQ13224 1484 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-209ENST00000464849 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-209ENST00000464849 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-209ENST00000464849 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54-209ENST00000464849 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54-209ENST00000464849 TOP2BQ02880 1626 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-209ENST00000464849 SYNJ1O43426 1573 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54-209ENST00000464849 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-209ENST00000464849 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-209ENST00000464849 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-209ENST00000464849 SYNJ2O15056 1496 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-209ENST00000464849 PBRM1Q86U86 1689 aa22.14■■□□□ 1.14
ANKRD54-209ENST00000464849 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-209ENST00000464849 ARAP1Q96P48 1450 aa22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54-209ENST00000464849 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54-209ENST00000464849 ADAMTS12P58397 1594 aa21.99■■□□□ 1.11
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ANKRD54-209ENST00000464849 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54-209ENST00000464849 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54-209ENST00000464849 NUP160Q12769 1436 aa21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54-209ENST00000464849 CEP170Q5SW79 1584 aa21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-209ENST00000464849 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54-209ENST00000464849 KIF27Q86VH2 1401 aa21.75■■□□□ 1.07
ANKRD54-209ENST00000464849 SHROOM2Q13796 1616 aa21.73■■□□□ 1.07
ANKRD54-209ENST00000464849 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54-209ENST00000464849 IGF1RP08069 1367 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54-209ENST00000464849 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54-209ENST00000464849 CUL7Q14999 1698 aa21.66■■□□□ 1.06
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