RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464375.5

ZNF638-212, Transcript of zinc finger protein 638, humanhuman

TSL 3

Gene ZNF638, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF638-212ENST00000464375 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.81■■■■□ 3.32
ZNF638-212ENST00000464375 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.04■■■□□ 2.72
ZNF638-212ENST00000464375 ABCC9O60706 1549 aa31.76■■■□□ 2.68
ZNF638-212ENST00000464375 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.35■■■□□ 2.45
ZNF638-212ENST00000464375 NACADO15069 1562 aa30.21■■■□□ 2.43
ZNF638-212ENST00000464375 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.08■■■□□ 2.41
ZNF638-212ENST00000464375 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.87■■■□□ 2.37
ZNF638-212ENST00000464375 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
ZNF638-212ENST00000464375 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.74■■■□□ 2.35
ZNF638-212ENST00000464375 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.6■■■□□ 2.33
ZNF638-212ENST00000464375 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.59■■■□□ 2.33
ZNF638-212ENST00000464375 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.58■■■□□ 2.33
ZNF638-212ENST00000464375 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.48■■■□□ 2.31
ZNF638-212ENST00000464375 SCRIBQ14160 1630 aa29.2■■■□□ 2.27
ZNF638-212ENST00000464375 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.08■■■□□ 2.25
ZNF638-212ENST00000464375 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.73■■■□□ 2.19
ZNF638-212ENST00000464375 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
ZNF638-212ENST00000464375 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.58■■■□□ 2.17
ZNF638-212ENST00000464375 SMARCA4P51532 1647 aa27.89■■■□□ 2.05
ZNF638-212ENST00000464375 NCAPD3P42695 1498 aa27.88■■■□□ 2.05
ZNF638-212ENST00000464375 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.83■■■□□ 2.05
ZNF638-212ENST00000464375 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
ZNF638-212ENST00000464375 SMARCA2P51531 1590 aa27.77■■■□□ 2.04
ZNF638-212ENST00000464375 HMGXB3Q12766 1538 aa27.71■■■□□ 2.03
ZNF638-212ENST00000464375 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.61■■■□□ 2.01
ZNF638-212ENST00000464375 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.6■■■□□ 2.01
ZNF638-212ENST00000464375 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
ZNF638-212ENST00000464375 ERCC6Q03468 1493 aa27.38■■□□□ 1.97
ZNF638-212ENST00000464375 NESP48681 1621 aa27.38■■□□□ 1.97
ZNF638-212ENST00000464375 WIZO95785 1651 aa27.3■■□□□ 1.96
ZNF638-212ENST00000464375 CUX2O14529 1486 aa27.26■■□□□ 1.95
ZNF638-212ENST00000464375 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.22■■□□□ 1.95
ZNF638-212ENST00000464375 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
ZNF638-212ENST00000464375 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
ZNF638-212ENST00000464375 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.06■■□□□ 1.92
ZNF638-212ENST00000464375 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.04■■□□□ 1.92
ZNF638-212ENST00000464375 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.03■■□□□ 1.92
ZNF638-212ENST00000464375 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
ZNF638-212ENST00000464375 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.95■■□□□ 1.9
ZNF638-212ENST00000464375 CFTRP13569 1480 aa26.8■■□□□ 1.88
ZNF638-212ENST00000464375 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.8■■□□□ 1.88
ZNF638-212ENST00000464375 WDR62O43379 1518 aa26.74■■□□□ 1.87
ZNF638-212ENST00000464375 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.74■■□□□ 1.87
ZNF638-212ENST00000464375 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.74■■□□□ 1.87
ZNF638-212ENST00000464375 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.64■■□□□ 1.86
ZNF638-212ENST00000464375 PRDM2Q13029 1718 aa26.6■■□□□ 1.85
ZNF638-212ENST00000464375 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ZNF638-212ENST00000464375 TOPBP1Q92547 1522 aa26.27■■□□□ 1.8
ZNF638-212ENST00000464375 ABCC8Q09428 1581 aa26.21■■□□□ 1.79
ZNF638-212ENST00000464375 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.2■■□□□ 1.78
ZNF638-212ENST00000464375 IFT140Q96RY7 1462 aa26.19■■□□□ 1.78
ZNF638-212ENST00000464375 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
ZNF638-212ENST00000464375 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
ZNF638-212ENST00000464375 OSCARQ8IYS5 282 aa26.05■■□□□ 1.76
ZNF638-212ENST00000464375 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
ZNF638-212ENST00000464375 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
ZNF638-212ENST00000464375 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
ZNF638-212ENST00000464375 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.741e-12■■■■■ 26.8
ZNF638-212ENST00000464375 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.92■■□□□ 1.74
ZNF638-212ENST00000464375 CUX1P39880 1505 aa25.92■■□□□ 1.74
ZNF638-212ENST00000464375 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.89■■□□□ 1.73
ZNF638-212ENST00000464375 SOGA1O94964 1423 aa25.88■■□□□ 1.73
ZNF638-212ENST00000464375 TRIM41Q8WV44 630 aa25.87■■□□□ 1.73
ZNF638-212ENST00000464375 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
ZNF638-212ENST00000464375 CHD1O14646 1710 aa25.8■■□□□ 1.72
ZNF638-212ENST00000464375 WDR97A6NE52 1622 aa25.77■■□□□ 1.72
ZNF638-212ENST00000464375 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.73■■□□□ 1.71
ZNF638-212ENST00000464375 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.73■■□□□ 1.71
ZNF638-212ENST00000464375 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.73■■□□□ 1.71
ZNF638-212ENST00000464375 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.68■■□□□ 1.7
ZNF638-212ENST00000464375 FBLN2P98095 1184 aa25.68■■□□□ 1.7
ZNF638-212ENST00000464375 ARHGEF11O15085 1522 aa25.65■■□□□ 1.7
ZNF638-212ENST00000464375 GRIN2BQ13224 1484 aa25.63■■□□□ 1.69
ZNF638-212ENST00000464375 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
ZNF638-212ENST00000464375 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.61■■□□□ 1.69
ZNF638-212ENST00000464375 PBRM1Q86U86 1689 aa25.6■■□□□ 1.69
ZNF638-212ENST00000464375 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.59■■□□□ 1.69
ZNF638-212ENST00000464375 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.59■■□□□ 1.69
ZNF638-212ENST00000464375 TOP2BQ02880 1626 aa25.57■■□□□ 1.68
ZNF638-212ENST00000464375 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.56■■□□□ 1.68
ZNF638-212ENST00000464375 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
ZNF638-212ENST00000464375 SYNJ1O43426 1573 aa25.56■■□□□ 1.68
ZNF638-212ENST00000464375 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
ZNF638-212ENST00000464375 SYNJ2O15056 1496 aa25.53■■□□□ 1.68
ZNF638-212ENST00000464375 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.49■■□□□ 1.67
ZNF638-212ENST00000464375 ARAP1Q96P48 1450 aa25.42■■□□□ 1.66
ZNF638-212ENST00000464375 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.42■■□□□ 1.66
ZNF638-212ENST00000464375 ADAMTS12P58397 1594 aa25.35■■□□□ 1.65
ZNF638-212ENST00000464375 GRIN2AQ12879 1464 aa25.31■■□□□ 1.64
ZNF638-212ENST00000464375 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.3■■□□□ 1.64
ZNF638-212ENST00000464375 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.27■■□□□ 1.64
ZNF638-212ENST00000464375 CEP170Q5SW79 1584 aa25.22■■□□□ 1.63
ZNF638-212ENST00000464375 NUP160Q12769 1436 aa25.22■■□□□ 1.63
ZNF638-212ENST00000464375 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.12■■□□□ 1.61
ZNF638-212ENST00000464375 SHROOM2Q13796 1616 aa25.1■■□□□ 1.61
ZNF638-212ENST00000464375 KIF27Q86VH2 1401 aa25.05■■□□□ 1.6
ZNF638-212ENST00000464375 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
ZNF638-212ENST00000464375 IGF1RP08069 1367 aa25.03■■□□□ 1.6
ZNF638-212ENST00000464375 CUL7Q14999 1698 aa24.99■■□□□ 1.59
ZNF638-212ENST00000464375 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms