RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464280.5

NISCH-204, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 3

Gene NISCH, Length 833 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-204ENST00000464280 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.42■■■□□ 2.14
NISCH-204ENST00000464280 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.39■■□□□ 1.66
NISCH-204ENST00000464280 ABCC9O60706 1549 aa24.77■■□□□ 1.56
NISCH-204ENST00000464280 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.89■■□□□ 1.41
NISCH-204ENST00000464280 NACADO15069 1562 aa23.83■■□□□ 1.41
NISCH-204ENST00000464280 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.74■■□□□ 1.39
NISCH-204ENST00000464280 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.66■■□□□ 1.38
NISCH-204ENST00000464280 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
NISCH-204ENST00000464280 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.54■■□□□ 1.36
NISCH-204ENST00000464280 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.42■■□□□ 1.34
NISCH-204ENST00000464280 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.12■■□□□ 1.29
NISCH-204ENST00000464280 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
NISCH-204ENST00000464280 SCRIBQ14160 1630 aa23.09■■□□□ 1.29
NISCH-204ENST00000464280 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.92■■□□□ 1.26
NISCH-204ENST00000464280 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.72■■□□□ 1.23
NISCH-204ENST00000464280 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
NISCH-204ENST00000464280 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.46■■□□□ 1.19
NISCH-204ENST00000464280 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-204ENST00000464280 SMARCA4P51532 1647 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-204ENST00000464280 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NISCH-204ENST00000464280 SMARCA2P51531 1590 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-204ENST00000464280 NCAPD3P42695 1498 aa21.95■■□□□ 1.1
NISCH-204ENST00000464280 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.94■■□□□ 1.1
NISCH-204ENST00000464280 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.88■■□□□ 1.09
NISCH-204ENST00000464280 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.87■■□□□ 1.09
NISCH-204ENST00000464280 HMGXB3Q12766 1538 aa21.87■■□□□ 1.09
NISCH-204ENST00000464280 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
NISCH-204ENST00000464280 WIZO95785 1651 aa21.69■■□□□ 1.06
NISCH-204ENST00000464280 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NISCH-204ENST00000464280 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NISCH-204ENST00000464280 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.44■■□□□ 1.02
NISCH-204ENST00000464280 NESP48681 1621 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-204ENST00000464280 ERCC6Q03468 1493 aa21.39■■□□□ 1.02
NISCH-204ENST00000464280 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.29■■□□□ 1
NISCH-204ENST00000464280 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-204ENST00000464280 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.26■□□□□ 0.99
NISCH-204ENST00000464280 CUX2O14529 1486 aa21.2■□□□□ 0.98
NISCH-204ENST00000464280 PRDM2Q13029 1718 aa21.18■□□□□ 0.98
NISCH-204ENST00000464280 CFTRP13569 1480 aa21.17■□□□□ 0.98
NISCH-204ENST00000464280 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
NISCH-204ENST00000464280 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-204ENST00000464280 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.07■□□□□ 0.96
NISCH-204ENST00000464280 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.07■□□□□ 0.96
NISCH-204ENST00000464280 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.03■□□□□ 0.96
NISCH-204ENST00000464280 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
NISCH-204ENST00000464280 WDR62O43379 1518 aa20.98■□□□□ 0.95
NISCH-204ENST00000464280 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
NISCH-204ENST00000464280 ABCC8Q09428 1581 aa20.77■□□□□ 0.92
NISCH-204ENST00000464280 TOPBP1Q92547 1522 aa20.73■□□□□ 0.91
NISCH-204ENST00000464280 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-204ENST00000464280 IFT140Q96RY7 1462 aa20.61■□□□□ 0.89
NISCH-204ENST00000464280 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-204ENST00000464280 CUX1P39880 1505 aa20.54■□□□□ 0.88
NISCH-204ENST00000464280 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
NISCH-204ENST00000464280 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NISCH-204ENST00000464280 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
NISCH-204ENST00000464280 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.48■□□□□ 0.87
NISCH-204ENST00000464280 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NISCH-204ENST00000464280 SOGA1O94964 1423 aa20.44■□□□□ 0.86
NISCH-204ENST00000464280 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.43■□□□□ 0.86
NISCH-204ENST00000464280 WDR97A6NE52 1622 aa20.42■□□□□ 0.86
NISCH-204ENST00000464280 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.42■□□□□ 0.86
NISCH-204ENST00000464280 TOP2BQ02880 1626 aa20.39■□□□□ 0.86
NISCH-204ENST00000464280 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
NISCH-204ENST00000464280 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 32.3
NISCH-204ENST00000464280 SYNJ1O43426 1573 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-204ENST00000464280 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
NISCH-204ENST00000464280 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.29■□□□□ 0.84
NISCH-204ENST00000464280 OSCARQ8IYS5 282 aa20.29■□□□□ 0.84
NISCH-204ENST00000464280 CHD1O14646 1710 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-204ENST00000464280 PBRM1Q86U86 1689 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-204ENST00000464280 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.24■□□□□ 0.83
NISCH-204ENST00000464280 GRIN2BQ13224 1484 aa20.23■□□□□ 0.83
NISCH-204ENST00000464280 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.23■□□□□ 0.83
NISCH-204ENST00000464280 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
NISCH-204ENST00000464280 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.19■□□□□ 0.82
NISCH-204ENST00000464280 FBLN2P98095 1184 aa20.15■□□□□ 0.82
NISCH-204ENST00000464280 SYNJ2O15056 1496 aa20.11■□□□□ 0.81
NISCH-204ENST00000464280 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NISCH-204ENST00000464280 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.07■□□□□ 0.8
NISCH-204ENST00000464280 ADAMTS12P58397 1594 aa20.04■□□□□ 0.8
NISCH-204ENST00000464280 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-204ENST00000464280 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-204ENST00000464280 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-204ENST00000464280 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.98■□□□□ 0.79
NISCH-204ENST00000464280 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.98■□□□□ 0.79
NISCH-204ENST00000464280 KIF27Q86VH2 1401 aa19.98■□□□□ 0.79
NISCH-204ENST00000464280 GRIN2AQ12879 1464 aa19.97■□□□□ 0.79
NISCH-204ENST00000464280 ARHGEF11O15085 1522 aa19.97■□□□□ 0.79
NISCH-204ENST00000464280 CUL7Q14999 1698 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-204ENST00000464280 CEP170Q5SW79 1584 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-204ENST00000464280 NUP160Q12769 1436 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-204ENST00000464280 IGF1RP08069 1367 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-204ENST00000464280 TRIM41Q8WV44 630 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-204ENST00000464280 SHROOM2Q13796 1616 aa19.78■□□□□ 0.76
NISCH-204ENST00000464280 ARAP1Q96P48 1450 aa19.78■□□□□ 0.76
NISCH-204ENST00000464280 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.76■□□□□ 0.75
NISCH-204ENST00000464280 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-204ENST00000464280 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-204ENST00000464280 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms