RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461614.1

EPHA2-202, Transcript of EPH receptor A2, humanhuman

TSL 2

Gene EPHA2, Length 875 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2-202ENST00000461614 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.64■■■■■ 7.46
EPHA2-202ENST00000461614 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.07■■■■■ 6.41
EPHA2-202ENST00000461614 ABCC9O60706 1549 aa54.45■■■■■ 6.31
EPHA2-202ENST00000461614 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.14■■■■■ 5.94
EPHA2-202ENST00000461614 NACADO15069 1562 aa51.93■■■■■ 5.9
EPHA2-202ENST00000461614 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.78■■■■■ 5.88
EPHA2-202ENST00000461614 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.43■■■■■ 5.82
EPHA2-202ENST00000461614 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.22■■■■■ 5.79
EPHA2-202ENST00000461614 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.98■■■■■ 5.75
EPHA2-202ENST00000461614 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.89■■■■■ 5.74
EPHA2-202ENST00000461614 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.79■■■■■ 5.72
EPHA2-202ENST00000461614 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.55■■■■■ 5.68
EPHA2-202ENST00000461614 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.49■■■■■ 5.67
EPHA2-202ENST00000461614 SCRIBQ14160 1630 aa50.2■■■■■ 5.63
EPHA2-202ENST00000461614 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.01■■■■■ 5.6
EPHA2-202ENST00000461614 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.28■■■■■ 5.48
EPHA2-202ENST00000461614 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.23■■■■■ 5.47
EPHA2-202ENST00000461614 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.01■■■■■ 5.44
EPHA2-202ENST00000461614 SMARCA4P51532 1647 aa47.96■■■■■ 5.27
EPHA2-202ENST00000461614 NCAPD3P42695 1498 aa47.92■■■■■ 5.26
EPHA2-202ENST00000461614 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.85■■■■■ 5.25
EPHA2-202ENST00000461614 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.83■■■■■ 5.25
EPHA2-202ENST00000461614 SMARCA2P51531 1590 aa47.78■■■■■ 5.24
EPHA2-202ENST00000461614 HMGXB3Q12766 1538 aa47.63■■■■■ 5.22
EPHA2-202ENST00000461614 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.49■■■■■ 5.19
EPHA2-202ENST00000461614 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.49■■■■■ 5.19
EPHA2-202ENST00000461614 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.44■■■■■ 5.18
EPHA2-202ENST00000461614 ERCC6Q03468 1493 aa47.02■■■■■ 5.12
EPHA2-202ENST00000461614 WIZO95785 1651 aa46.94■■■■■ 5.11
EPHA2-202ENST00000461614 NESP48681 1621 aa46.94■■■■■ 5.1
EPHA2-202ENST00000461614 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.76■■■■■ 5.08
EPHA2-202ENST00000461614 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.74■■■■■ 5.07
EPHA2-202ENST00000461614 CUX2O14529 1486 aa46.71■■■■■ 5.07
EPHA2-202ENST00000461614 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.49■■■■■ 5.03
EPHA2-202ENST00000461614 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.48■■■■■ 5.03
EPHA2-202ENST00000461614 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.44■■■■■ 5.02
EPHA2-202ENST00000461614 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.36■■■■■ 5.01
EPHA2-202ENST00000461614 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
EPHA2-202ENST00000461614 CFTRP13569 1480 aa46.09■■■■■ 4.97
EPHA2-202ENST00000461614 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.03■■■■■ 4.96
EPHA2-202ENST00000461614 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.98■■■■■ 4.95
EPHA2-202ENST00000461614 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.97■■■■■ 4.95
EPHA2-202ENST00000461614 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.97■■■■■ 4.95
EPHA2-202ENST00000461614 WDR62O43379 1518 aa45.88■■■■■ 4.94
EPHA2-202ENST00000461614 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.88■■■■■ 4.94
EPHA2-202ENST00000461614 PRDM2Q13029 1718 aa45.67■■■■■ 4.9
EPHA2-202ENST00000461614 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.53■■■■■ 4.88
EPHA2-202ENST00000461614 TOPBP1Q92547 1522 aa45.16■■■■■ 4.82
EPHA2-202ENST00000461614 ABCC8Q09428 1581 aa45.15■■■■■ 4.82
EPHA2-202ENST00000461614 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.13■■■■■ 4.82
EPHA2-202ENST00000461614 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.06■■■■■ 4.8
EPHA2-202ENST00000461614 IFT140Q96RY7 1462 aa45.04■■■■■ 4.8
EPHA2-202ENST00000461614 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
EPHA2-202ENST00000461614 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.73■■■■■ 4.75
EPHA2-202ENST00000461614 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.7■■■■■ 4.75
EPHA2-202ENST00000461614 OSCARQ8IYS5 282 aa44.69■■■■■ 4.74
EPHA2-202ENST00000461614 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.67■■■■■ 4.74
EPHA2-202ENST00000461614 CUX1P39880 1505 aa44.6■■■■■ 4.73
EPHA2-202ENST00000461614 SOGA1O94964 1423 aa44.56■■■■■ 4.72
EPHA2-202ENST00000461614 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.54■■■■■ 4.724e-9■■■□□ 19.2
EPHA2-202ENST00000461614 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.54■■■■■ 4.72
EPHA2-202ENST00000461614 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.54■■■■■ 4.72
EPHA2-202ENST00000461614 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.37■■■■■ 4.69
EPHA2-202ENST00000461614 WDR97A6NE52 1622 aa44.34■■■■■ 4.69
EPHA2-202ENST00000461614 TRIM41Q8WV44 630 aa44.22■■■■■ 4.67
EPHA2-202ENST00000461614 CHD1O14646 1710 aa44.2■■■■■ 4.67
EPHA2-202ENST00000461614 FBLN2P98095 1184 aa44.15■■■■■ 4.66
EPHA2-202ENST00000461614 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.13■■■■■ 4.65
EPHA2-202ENST00000461614 GRIN2BQ13224 1484 aa44.11■■■■■ 4.65
EPHA2-202ENST00000461614 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.1■■■■■ 4.65
EPHA2-202ENST00000461614 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.08■■■■■ 4.65
EPHA2-202ENST00000461614 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.06■■■■■ 4.64
EPHA2-202ENST00000461614 TOP2BQ02880 1626 aa44.06■■■■■ 4.64
EPHA2-202ENST00000461614 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.05■■■■■ 4.64
EPHA2-202ENST00000461614 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.02■■■■■ 4.64
EPHA2-202ENST00000461614 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.01■■■■■ 4.64
EPHA2-202ENST00000461614 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.01■■■■■ 4.64
EPHA2-202ENST00000461614 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.01■■■■■ 4.64
EPHA2-202ENST00000461614 SYNJ1O43426 1573 aa44.01■■■■■ 4.64
EPHA2-202ENST00000461614 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.95■■■■■ 4.63
EPHA2-202ENST00000461614 PBRM1Q86U86 1689 aa43.95■■■■■ 4.63
EPHA2-202ENST00000461614 ARHGEF11O15085 1522 aa43.94■■■■■ 4.63
EPHA2-202ENST00000461614 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.62
EPHA2-202ENST00000461614 SYNJ2O15056 1496 aa43.89■■■■■ 4.62
EPHA2-202ENST00000461614 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.73■■■■■ 4.59
EPHA2-202ENST00000461614 ADAMTS12P58397 1594 aa43.58■■■■■ 4.57
EPHA2-202ENST00000461614 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.58■■■■■ 4.57
EPHA2-202ENST00000461614 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.56■■■■■ 4.56
EPHA2-202ENST00000461614 ARAP1Q96P48 1450 aa43.55■■■■■ 4.56
EPHA2-202ENST00000461614 GRIN2AQ12879 1464 aa43.53■■■■■ 4.56
EPHA2-202ENST00000461614 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.5■■■■■ 4.55
EPHA2-202ENST00000461614 NUP160Q12769 1436 aa43.36■■■■■ 4.53
EPHA2-202ENST00000461614 CEP170Q5SW79 1584 aa43.33■■■■■ 4.53
EPHA2-202ENST00000461614 KIF27Q86VH2 1401 aa43.24■■■■■ 4.51
EPHA2-202ENST00000461614 IGF1RP08069 1367 aa43.12■■■■■ 4.49
EPHA2-202ENST00000461614 SHROOM2Q13796 1616 aa43.09■■■■■ 4.49
EPHA2-202ENST00000461614 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.06■■■■■ 4.48
EPHA2-202ENST00000461614 CUL7Q14999 1698 aa43.05■■■■■ 4.48
EPHA2-202ENST00000461614 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.96■■■■■ 4.47
EPHA2-202ENST00000461614 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.92■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms