RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.4■■■■■ 4.7
DDR1-241ENST00000460944 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.48■■■■□ 3.91
DDR1-241ENST00000460944 ABCC9O60706 1549 aa38.47■■■■□ 3.75
DDR1-241ENST00000460944 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.1■■■■□ 3.53
DDR1-241ENST00000460944 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.07■■■■□ 3.52
DDR1-241ENST00000460944 NACADO15069 1562 aa37.07■■■■□ 3.52
DDR1-241ENST00000460944 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
DDR1-241ENST00000460944 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.87■■■■□ 3.49
DDR1-241ENST00000460944 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.75■■■■□ 3.47
DDR1-241ENST00000460944 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.25■■■■□ 3.39
DDR1-241ENST00000460944 SCRIBQ14160 1630 aa36.02■■■■□ 3.36
DDR1-241ENST00000460944 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.94■■■■□ 3.34
DDR1-241ENST00000460944 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.89■■■■□ 3.34
DDR1-241ENST00000460944 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.61■■■■□ 3.29
DDR1-241ENST00000460944 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.1■■■■□ 3.21
DDR1-241ENST00000460944 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
DDR1-241ENST00000460944 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.81■■■■□ 3.16
DDR1-241ENST00000460944 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.56■■■■□ 3.12
DDR1-241ENST00000460944 SMARCA4P51532 1647 aa34.45■■■■□ 3.11
DDR1-241ENST00000460944 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.1
DDR1-241ENST00000460944 SMARCA2P51531 1590 aa34.22■■■■□ 3.07
DDR1-241ENST00000460944 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.2■■■■□ 3.07
DDR1-241ENST00000460944 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.2■■■■□ 3.07
DDR1-241ENST00000460944 NCAPD3P42695 1498 aa34.16■■■■□ 3.06
DDR1-241ENST00000460944 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.1■■■■□ 3.05
DDR1-241ENST00000460944 HMGXB3Q12766 1538 aa34.04■■■■□ 3.04
DDR1-241ENST00000460944 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
DDR1-241ENST00000460944 WIZO95785 1651 aa33.87■■■■□ 3.01
DDR1-241ENST00000460944 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
DDR1-241ENST00000460944 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
DDR1-241ENST00000460944 NESP48681 1621 aa33.3■■■□□ 2.92
DDR1-241ENST00000460944 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.3■■■□□ 2.92
DDR1-241ENST00000460944 ERCC6Q03468 1493 aa33.2■■■□□ 2.91
DDR1-241ENST00000460944 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.19■■■□□ 2.9
DDR1-241ENST00000460944 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
DDR1-241ENST00000460944 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.1■■■□□ 2.89
DDR1-241ENST00000460944 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.06■■■□□ 2.88
DDR1-241ENST00000460944 CFTRP13569 1480 aa33■■■□□ 2.87
DDR1-241ENST00000460944 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.97■■■□□ 2.87
DDR1-241ENST00000460944 PRDM2Q13029 1718 aa32.86■■■□□ 2.85
DDR1-241ENST00000460944 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.82■■■□□ 2.84
DDR1-241ENST00000460944 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
DDR1-241ENST00000460944 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.8■■■□□ 2.84
DDR1-241ENST00000460944 CUX2O14529 1486 aa32.79■■■□□ 2.84
DDR1-241ENST00000460944 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.72■■■□□ 2.83
DDR1-241ENST00000460944 WDR62O43379 1518 aa32.59■■■□□ 2.81
DDR1-241ENST00000460944 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
DDR1-241ENST00000460944 ABCC8Q09428 1581 aa32.34■■■□□ 2.77
DDR1-241ENST00000460944 TOPBP1Q92547 1522 aa32.31■■■□□ 2.76
DDR1-241ENST00000460944 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.3■■■□□ 2.76
DDR1-241ENST00000460944 IFT140Q96RY7 1462 aa32.1■■■□□ 2.73
DDR1-241ENST00000460944 CUX1P39880 1505 aa32.09■■■□□ 2.73
DDR1-241ENST00000460944 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
DDR1-241ENST00000460944 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.98■■■□□ 2.71
DDR1-241ENST00000460944 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.96■■■□□ 2.71
DDR1-241ENST00000460944 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
DDR1-241ENST00000460944 SOGA1O94964 1423 aa31.91■■■□□ 2.7
DDR1-241ENST00000460944 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
DDR1-241ENST00000460944 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.88■■■□□ 2.69
DDR1-241ENST00000460944 TOP2BQ02880 1626 aa31.88■■■□□ 2.69
DDR1-241ENST00000460944 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.88■■■□□ 2.69
DDR1-241ENST00000460944 SYNJ1O43426 1573 aa31.85■■■□□ 2.69
DDR1-241ENST00000460944 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
DDR1-241ENST00000460944 WDR97A6NE52 1622 aa31.75■■■□□ 2.67
DDR1-241ENST00000460944 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.73■■■□□ 2.672e-7■■■■■ 31.6
DDR1-241ENST00000460944 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
DDR1-241ENST00000460944 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.68■■■□□ 2.66
DDR1-241ENST00000460944 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.64■■■□□ 2.66
DDR1-241ENST00000460944 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.56■■■□□ 2.64
DDR1-241ENST00000460944 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.55■■■□□ 2.64
DDR1-241ENST00000460944 GRIN2BQ13224 1484 aa31.54■■■□□ 2.64
DDR1-241ENST00000460944 PBRM1Q86U86 1689 aa31.52■■■□□ 2.64
DDR1-241ENST00000460944 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.48■■■□□ 2.63
DDR1-241ENST00000460944 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
DDR1-241ENST00000460944 OSCARQ8IYS5 282 aa31.43■■■□□ 2.62
DDR1-241ENST00000460944 CHD1O14646 1710 aa31.42■■■□□ 2.62
DDR1-241ENST00000460944 FBLN2P98095 1184 aa31.37■■■□□ 2.61
DDR1-241ENST00000460944 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.32■■■□□ 2.6
DDR1-241ENST00000460944 SYNJ2O15056 1496 aa31.32■■■□□ 2.6
DDR1-241ENST00000460944 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
DDR1-241ENST00000460944 KIF27Q86VH2 1401 aa31.3■■■□□ 2.6
DDR1-241ENST00000460944 TRIM41Q8WV44 630 aa31.28■■■□□ 2.6
DDR1-241ENST00000460944 ADAMTS12P58397 1594 aa31.26■■■□□ 2.59
DDR1-241ENST00000460944 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.2■■■□□ 2.59
DDR1-241ENST00000460944 GRIN2AQ12879 1464 aa31.13■■■□□ 2.57
DDR1-241ENST00000460944 CUL7Q14999 1698 aa31.09■■■□□ 2.57
DDR1-241ENST00000460944 IGF1RP08069 1367 aa31.08■■■□□ 2.57
DDR1-241ENST00000460944 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.03■■■□□ 2.56
DDR1-241ENST00000460944 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.97■■■□□ 2.55
DDR1-241ENST00000460944 NUP160Q12769 1436 aa30.97■■■□□ 2.55
DDR1-241ENST00000460944 CEP170Q5SW79 1584 aa30.96■■■□□ 2.55
DDR1-241ENST00000460944 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.94■■■□□ 2.54
DDR1-241ENST00000460944 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.93■■■□□ 2.54
DDR1-241ENST00000460944 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.93■■■□□ 2.54
DDR1-241ENST00000460944 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.93■■■□□ 2.54
DDR1-241ENST00000460944 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.93■■■□□ 2.54
DDR1-241ENST00000460944 ARHGEF11O15085 1522 aa30.93■■■□□ 2.54
DDR1-241ENST00000460944 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.79■■■□□ 2.52
DDR1-241ENST00000460944 EEA1Q15075 1411 aa30.79■■■□□ 2.52
DDR1-241ENST00000460944 SHROOM2Q13796 1616 aa30.73■■■□□ 2.51
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