RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458295.5

SH3BGR-209, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SH3BGR, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGR-209ENST00000458295 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.21■■■■□ 3.07
SH3BGR-209ENST00000458295 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.69■■■□□ 2.5
SH3BGR-209ENST00000458295 ABCC9O60706 1549 aa30.5■■■□□ 2.47
SH3BGR-209ENST00000458295 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.09■■■□□ 2.25
SH3BGR-209ENST00000458295 NACADO15069 1562 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BGR-209ENST00000458295 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.66■■■□□ 2.18
SH3BGR-209ENST00000458295 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BGR-209ENST00000458295 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BGR-209ENST00000458295 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.54■■■□□ 2.16
SH3BGR-209ENST00000458295 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
SH3BGR-209ENST00000458295 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.38■■■□□ 2.13
SH3BGR-209ENST00000458295 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
SH3BGR-209ENST00000458295 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.32■■■□□ 2.12
SH3BGR-209ENST00000458295 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.95■■■□□ 2.07
SH3BGR-209ENST00000458295 SCRIBQ14160 1630 aa27.9■■■□□ 2.06
SH3BGR-209ENST00000458295 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.62■■■□□ 2.01
SH3BGR-209ENST00000458295 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
SH3BGR-209ENST00000458295 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BGR-209ENST00000458295 NCAPD3P42695 1498 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BGR-209ENST00000458295 SMARCA4P51532 1647 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BGR-209ENST00000458295 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BGR-209ENST00000458295 HMGXB3Q12766 1538 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BGR-209ENST00000458295 SMARCA2P51531 1590 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BGR-209ENST00000458295 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SH3BGR-209ENST00000458295 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BGR-209ENST00000458295 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BGR-209ENST00000458295 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SH3BGR-209ENST00000458295 NESP48681 1621 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BGR-209ENST00000458295 CUX2O14529 1486 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BGR-209ENST00000458295 ERCC6Q03468 1493 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BGR-209ENST00000458295 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BGR-209ENST00000458295 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BGR-209ENST00000458295 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SH3BGR-209ENST00000458295 WIZO95785 1651 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BGR-209ENST00000458295 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BGR-209ENST00000458295 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BGR-209ENST00000458295 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BGR-209ENST00000458295 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
SH3BGR-209ENST00000458295 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
SH3BGR-209ENST00000458295 WDR62O43379 1518 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BGR-209ENST00000458295 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BGR-209ENST00000458295 CFTRP13569 1480 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BGR-209ENST00000458295 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BGR-209ENST00000458295 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BGR-209ENST00000458295 PRDM2Q13029 1718 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BGR-209ENST00000458295 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SH3BGR-209ENST00000458295 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BGR-209ENST00000458295 TOPBP1Q92547 1522 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BGR-209ENST00000458295 IFT140Q96RY7 1462 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BGR-209ENST00000458295 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SH3BGR-209ENST00000458295 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BGR-209ENST00000458295 ABCC8Q09428 1581 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BGR-209ENST00000458295 OSCARQ8IYS5 282 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BGR-209ENST00000458295 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SH3BGR-209ENST00000458295 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SH3BGR-209ENST00000458295 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SH3BGR-209ENST00000458295 TRIM41Q8WV44 630 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BGR-209ENST00000458295 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.56
SH3BGR-209ENST00000458295 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BGR-209ENST00000458295 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BGR-209ENST00000458295 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BGR-209ENST00000458295 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BGR-209ENST00000458295 CUX1P39880 1505 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BGR-209ENST00000458295 CHD1O14646 1710 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BGR-209ENST00000458295 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BGR-209ENST00000458295 ARHGEF11O15085 1522 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BGR-209ENST00000458295 SOGA1O94964 1423 aa24.7■■□□□ 1.55
SH3BGR-209ENST00000458295 WDR97A6NE52 1622 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BGR-209ENST00000458295 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SH3BGR-209ENST00000458295 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BGR-209ENST00000458295 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BGR-209ENST00000458295 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SH3BGR-209ENST00000458295 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BGR-209ENST00000458295 GRIN2BQ13224 1484 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BGR-209ENST00000458295 ARAP1Q96P48 1450 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BGR-209ENST00000458295 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BGR-209ENST00000458295 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BGR-209ENST00000458295 PBRM1Q86U86 1689 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BGR-209ENST00000458295 FBLN2P98095 1184 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BGR-209ENST00000458295 SYNJ2O15056 1496 aa24.45■■□□□ 1.51
SH3BGR-209ENST00000458295 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BGR-209ENST00000458295 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BGR-209ENST00000458295 SYNJ1O43426 1573 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BGR-209ENST00000458295 TOP2BQ02880 1626 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BGR-209ENST00000458295 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BGR-209ENST00000458295 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SH3BGR-209ENST00000458295 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
SH3BGR-209ENST00000458295 ADAMTS12P58397 1594 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BGR-209ENST00000458295 GRIN2AQ12879 1464 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BGR-209ENST00000458295 CEP170Q5SW79 1584 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BGR-209ENST00000458295 NUP160Q12769 1436 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BGR-209ENST00000458295 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BGR-209ENST00000458295 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BGR-209ENST00000458295 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BGR-209ENST00000458295 SHROOM2Q13796 1616 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BGR-209ENST00000458295 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SH3BGR-209ENST00000458295 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BGR-209ENST00000458295 IGF1RP08069 1367 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BGR-209ENST00000458295 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
SH3BGR-209ENST00000458295 CUL7Q14999 1698 aa23.83■■□□□ 1.4
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