RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457387.1

CCDC18-AS1-223, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 806 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.13■■■□□ 2.89
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CCDC18-AS1-223ENST00000457387 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.75■■■□□ 2.19
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 NACADO15069 1562 aa28.41■■■□□ 2.14
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.15■■■□□ 2.1
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CCDC18-AS1-223ENST00000457387 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.86■■■□□ 2.05
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CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.49■■□□□ 1.99
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CCDC18-AS1-223ENST00000457387 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 SCRIBQ14160 1630 aa27.3■■□□□ 1.96
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CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ERCC6Q03468 1493 aa26.3■■□□□ 1.8
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CCDC18-AS1-223ENST00000457387 NESP48681 1621 aa26.06■■□□□ 1.76
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 HMGXB3Q12766 1538 aa26.03■■□□□ 1.76
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CCDC18-AS1-223ENST00000457387 SMARCA4P51532 1647 aa25.98■■□□□ 1.75
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CCDC18-AS1-223ENST00000457387 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.74■■□□□ 1.71
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.73■■□□□ 1.71
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CCDC18-AS1-223ENST00000457387 WDR62O43379 1518 aa25.42■■□□□ 1.66
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 WIZO95785 1651 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.15■■□□□ 1.62
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CCDC18-AS1-223ENST00000457387 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
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CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ARAP1Q96P48 1450 aa24.52■■□□□ 1.52
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CCDC18-AS1-223ENST00000457387 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
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CCDC18-AS1-223ENST00000457387 SYNJ1O43426 1573 aa24.14■■□□□ 1.45
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 WDR97A6NE52 1622 aa24.13■■□□□ 1.45
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.13■■□□□ 1.45
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 GRIN2BQ13224 1484 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CUX1P39880 1505 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 SYNJ2O15056 1496 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.99■■□□□ 1.43
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 PBRM1Q86U86 1689 aa23.95■■□□□ 1.43
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.87■■□□□ 1.41
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.86■■□□□ 1.41
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CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CEP170Q5SW79 1584 aa23.74■■□□□ 1.39
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ADAMTS12P58397 1594 aa23.73■■□□□ 1.39
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 NUP160Q12769 1436 aa23.71■■□□□ 1.39
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 SHROOM2Q13796 1616 aa23.67■■□□□ 1.38
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.63■■□□□ 1.37
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.57■■□□□ 1.36
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.51■■□□□ 1.35
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 TOP2BQ02880 1626 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.4■■□□□ 1.34
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