RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1-205ENST00000450873 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.61■■□□□ 1.05
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RABGEF1-205ENST00000450873 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.21■□□□□ 0.99
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RABGEF1-205ENST00000450873 SMARCA2P51531 1590 aa19.7■□□□□ 0.74
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RABGEF1-205ENST00000450873 SOGA1O94964 1423 aa18.34■□□□□ 0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.34■□□□□ 0.53
RABGEF1-205ENST00000450873 ARHGEF11O15085 1522 aa18.33■□□□□ 0.53
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RABGEF1-205ENST00000450873 CUX1P39880 1505 aa18.3■□□□□ 0.52
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RABGEF1-205ENST00000450873 NUP160Q12769 1436 aa17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1-205ENST00000450873 CEP170Q5SW79 1584 aa17.88■□□□□ 0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 KIF27Q86VH2 1401 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 SHROOM2Q13796 1616 aa17.84■□□□□ 0.45
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RABGEF1-205ENST00000450873 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.7■□□□□ 0.42
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