RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449178.5

PCBP1-AS1-236, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCBP1-AS1, Length 539 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 NISCHQ9Y2I1 1504 aa9.47□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 CHIC1Q5VXU3 224 aa9.31□□□□□ -0.92
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 ABCC9O60706 1549 aa8.81□□□□□ -1
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 DNAJC5BQ9UF47 199 aa8.69□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa8.4□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa8.22□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 SLC24A1O60721 1099 aa8.06□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 NACADO15069 1562 aa8.05□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 CECR2Q9BXF3 1484 aa8.02□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.97□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 EHMT2Q96KQ7 1210 aa7.97□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.92□□□□□ -1.14
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 BICRAQ9NZM4 1560 aa7.92□□□□□ -1.14
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 UNC13AQ9UPW8 1703 aa7.89□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.87□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 CUX2O14529 1486 aa7.84□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.83□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 FOXD1Q16676 465 aa7.83□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 TRIM41Q8WV44 630 aa7.82□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.82□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 PLPPR3Q6T4P5 718 aa7.73□□□□□ -1.17
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 ERCC6Q03468 1493 aa7.69□□□□□ -1.18
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 SCRIBQ14160 1630 aa7.66□□□□□ -1.18
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 KCNA4P22459 653 aa7.64□□□□□ -1.19
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 CSRNP3Q8WYN3 585 aa7.63□□□□□ -1.19
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 OSCARQ8IYS5 282 aa7.48□□□□□ -1.21
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 NCAPD3P42695 1498 aa7.46□□□□□ -1.22
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 NESP48681 1621 aa7.4□□□□□ -1.22
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 TRHP20396 242 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.37□□□□□ -1.23
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa7.34□□□□□ -1.23
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 SMARCA4P51532 1647 aa7.34□□□□□ -1.24
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa7.33□□□□□ -1.24
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 SMARCA2P51531 1590 aa7.33□□□□□ -1.24
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 HMGXB3Q12766 1538 aa7.32□□□□□ -1.24
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 MROH2BQ7Z745 1585 aa7.31□□□□□ -1.24
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 PPP6R1Q9UPN7 881 aa7.31□□□□□ -1.24
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 MSH5O43196 834 aa7.3□□□□□ -1.24
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.3□□□□□ -1.24
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 ADRA2BP18089 450 aa7.29□□□□□ -1.24
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.28□□□□□ -1.24
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.28□□□□□ -1.24
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.28□□□□□ -1.24
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 MRC2Q9UBG0 1479 aa7.27□□□□□ -1.25
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 WIZO95785 1651 aa7.27□□□□□ -1.25
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa7.26□□□□□ -1.25
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 PEG3Q9GZU2 1588 aa7.25□□□□□ -1.25
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 WDR62O43379 1518 aa7.25□□□□□ -1.25
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 ARHGEF11O15085 1522 aa7.24□□□□□ -1.25
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.22□□□□□ -1.25
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 POTEDQ86YR6 584 aa7.21□□□□□ -1.26
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.15□□□□□ -1.27
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 ARAP1Q96P48 1450 aa7.11□□□□□ -1.27
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 ZBTB22O15209 634 aa7.1□□□□□ -1.27
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.1□□□□□ -1.27
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.08□□□□□ -1.28
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 IFT140Q96RY7 1462 aa7.05□□□□□ -1.28
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 PRDM2Q13029 1718 aa7.05□□□□□ -1.28
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 FBLN2P98095 1184 aa7.05□□□□□ -1.28
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 CFTRP13569 1480 aa7□□□□□ -1.29
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.96□□□□□ -1.3
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 FBXO41Q8TF61 875 aa6.96□□□□□ -1.3
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 CHD1O14646 1710 aa6.96□□□□□ -1.3
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 ABCC8Q09428 1581 aa6.94□□□□□ -1.3
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6.93□□□□□ -1.3
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.92□□□□□ -1.3
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 TAOK2Q9UL54 1235 aa6.9□□□□□ -1.3
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.9□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 TOPBP1Q92547 1522 aa6.9□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 SYNJ1O43426 1573 aa6.9□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.89□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 SOCS7O14512 581 aa6.88□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-236ENST00000449178 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms