RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442452.1

ACHE-211, Transcript of acetylcholinesterase (Cartwright blood group), humanhuman

TSL 3

Gene ACHE, Length 1,472 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACHE-211ENST00000442452 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.28■■■■■ 4.04
ACHE-211ENST00000442452 ABCC9O60706 1549 aa36.55■■■■□ 3.44
ACHE-211ENST00000442452 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36■■■■□ 3.35
ACHE-211ENST00000442452 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.79■■■■□ 3.16
ACHE-211ENST00000442452 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.53■■■■□ 3.12
ACHE-211ENST00000442452 NACADO15069 1562 aa34.15■■■■□ 3.06
ACHE-211ENST00000442452 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.93■■■■□ 3.02
ACHE-211ENST00000442452 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.84■■■■□ 3.01
ACHE-211ENST00000442452 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.79■■■■□ 3
ACHE-211ENST00000442452 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
ACHE-211ENST00000442452 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.59■■■□□ 2.97
ACHE-211ENST00000442452 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.5■■■□□ 2.95
ACHE-211ENST00000442452 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.32■■■□□ 2.93
ACHE-211ENST00000442452 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.02■■■□□ 2.88
ACHE-211ENST00000442452 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.99■■■□□ 2.87
ACHE-211ENST00000442452 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.97■■■□□ 2.87
ACHE-211ENST00000442452 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
ACHE-211ENST00000442452 SCRIBQ14160 1630 aa32.78■■■□□ 2.84
ACHE-211ENST00000442452 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.32■■■□□ 2.76
ACHE-211ENST00000442452 CUX2O14529 1486 aa31.7■■■□□ 2.66
ACHE-211ENST00000442452 ERCC6Q03468 1493 aa31.57■■■□□ 2.64
ACHE-211ENST00000442452 NCAPD3P42695 1498 aa31.54■■■□□ 2.64
ACHE-211ENST00000442452 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.37■■■□□ 2.61
ACHE-211ENST00000442452 HMGXB3Q12766 1538 aa31.26■■■□□ 2.59
ACHE-211ENST00000442452 NESP48681 1621 aa31.25■■■□□ 2.59
ACHE-211ENST00000442452 SMARCA2P51531 1590 aa31.24■■■□□ 2.59
ACHE-211ENST00000442452 SMARCA4P51532 1647 aa31.21■■■□□ 2.59
ACHE-211ENST00000442452 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
ACHE-211ENST00000442452 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
ACHE-211ENST00000442452 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.04■■■□□ 2.56
ACHE-211ENST00000442452 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
ACHE-211ENST00000442452 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.92■■■□□ 2.54
ACHE-211ENST00000442452 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.91■■■□□ 2.54
ACHE-211ENST00000442452 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
ACHE-211ENST00000442452 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.83■■■□□ 2.53
ACHE-211ENST00000442452 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.74■■■□□ 2.51
ACHE-211ENST00000442452 WIZO95785 1651 aa30.7■■■□□ 2.51
ACHE-211ENST00000442452 TRIM41Q8WV44 630 aa30.67■■■□□ 2.5
ACHE-211ENST00000442452 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.55■■■□□ 2.48
ACHE-211ENST00000442452 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
ACHE-211ENST00000442452 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.53■■■□□ 2.48
ACHE-211ENST00000442452 WDR62O43379 1518 aa30.48■■■□□ 2.47
ACHE-211ENST00000442452 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
ACHE-211ENST00000442452 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.29■■■□□ 2.44
ACHE-211ENST00000442452 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.22■■■□□ 2.43
ACHE-211ENST00000442452 OSCARQ8IYS5 282 aa30.14■■■□□ 2.42
ACHE-211ENST00000442452 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.1■■■□□ 2.41
ACHE-211ENST00000442452 CFTRP13569 1480 aa30.1■■■□□ 2.41
ACHE-211ENST00000442452 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
ACHE-211ENST00000442452 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.86■■■□□ 2.37
ACHE-211ENST00000442452 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.86■■■□□ 2.37
ACHE-211ENST00000442452 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.86■■■□□ 2.37
ACHE-211ENST00000442452 PRDM2Q13029 1718 aa29.77■■■□□ 2.36
ACHE-211ENST00000442452 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
ACHE-211ENST00000442452 ARHGEF11O15085 1522 aa29.7■■■□□ 2.35
ACHE-211ENST00000442452 IFT140Q96RY7 1462 aa29.7■■■□□ 2.35
ACHE-211ENST00000442452 TOPBP1Q92547 1522 aa29.59■■■□□ 2.33
ACHE-211ENST00000442452 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
ACHE-211ENST00000442452 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.49■■■□□ 2.31
ACHE-211ENST00000442452 ABCC8Q09428 1581 aa29.45■■■□□ 2.31
ACHE-211ENST00000442452 CHD1O14646 1710 aa29.44■■■□□ 2.3
ACHE-211ENST00000442452 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.43■■■□□ 2.3
ACHE-211ENST00000442452 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.39■■■□□ 2.3
ACHE-211ENST00000442452 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
ACHE-211ENST00000442452 ARAP1Q96P48 1450 aa29.39■■■□□ 2.29
ACHE-211ENST00000442452 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
ACHE-211ENST00000442452 FBLN2P98095 1184 aa29.29■■■□□ 2.28
ACHE-211ENST00000442452 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
ACHE-211ENST00000442452 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.16■■■□□ 2.26
ACHE-211ENST00000442452 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
ACHE-211ENST00000442452 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.12■■■□□ 2.25
ACHE-211ENST00000442452 SOGA1O94964 1423 aa29.1■■■□□ 2.25
ACHE-211ENST00000442452 CUX1P39880 1505 aa29.09■■■□□ 2.25
ACHE-211ENST00000442452 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.09■■■□□ 2.25
ACHE-211ENST00000442452 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.07■■■□□ 2.24
ACHE-211ENST00000442452 WDR97A6NE52 1622 aa29.01■■■□□ 2.23
ACHE-211ENST00000442452 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.99■■■□□ 2.23
ACHE-211ENST00000442452 SYNJ1O43426 1573 aa28.99■■■□□ 2.23
ACHE-211ENST00000442452 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
ACHE-211ENST00000442452 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
ACHE-211ENST00000442452 TOP2BQ02880 1626 aa28.95■■■□□ 2.22
ACHE-211ENST00000442452 GRIN2BQ13224 1484 aa28.91■■■□□ 2.22
ACHE-211ENST00000442452 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.91■■■□□ 2.22
ACHE-211ENST00000442452 SYNJ2O15056 1496 aa28.88■■■□□ 2.21
ACHE-211ENST00000442452 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
ACHE-211ENST00000442452 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.8■■■□□ 2.2
ACHE-211ENST00000442452 PBRM1Q86U86 1689 aa28.78■■■□□ 2.2
ACHE-211ENST00000442452 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.74■■■□□ 2.19
ACHE-211ENST00000442452 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.68■■■□□ 2.18
ACHE-211ENST00000442452 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.65■■■□□ 2.18
ACHE-211ENST00000442452 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.61■■■□□ 2.17
ACHE-211ENST00000442452 GRIN2AQ12879 1464 aa28.54■■■□□ 2.16
ACHE-211ENST00000442452 KIF27Q86VH2 1401 aa28.5■■■□□ 2.15
ACHE-211ENST00000442452 CEP170Q5SW79 1584 aa28.49■■■□□ 2.15
ACHE-211ENST00000442452 ADAMTS12P58397 1594 aa28.47■■■□□ 2.15
ACHE-211ENST00000442452 NUP160Q12769 1436 aa28.47■■■□□ 2.15
ACHE-211ENST00000442452 SHROOM2Q13796 1616 aa28.42■■■□□ 2.14
ACHE-211ENST00000442452 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.37■■■□□ 2.13
ACHE-211ENST00000442452 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.34■■■□□ 2.13
ACHE-211ENST00000442452 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.34■■■□□ 2.13
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