RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439491.2

SLC29A4-205, Transcript of solute carrier family 29 member 4, humanhuman

TSL 3

Gene SLC29A4, Length 805 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4-205ENST00000439491 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.58■■■■□ 3.61
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SLC29A4-205ENST00000439491 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.92■■■□□ 2.7
SLC29A4-205ENST00000439491 NACADO15069 1562 aa31.77■■■□□ 2.68
SLC29A4-205ENST00000439491 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.49■■■□□ 2.63
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SLC29A4-205ENST00000439491 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.29■■■□□ 2.6
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SLC29A4-205ENST00000439491 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.16■■■□□ 2.58
SLC29A4-205ENST00000439491 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.01■■■□□ 2.56
SLC29A4-205ENST00000439491 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.97■■■□□ 2.55
SLC29A4-205ENST00000439491 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.92■■■□□ 2.543e-7■□□□□ 9.8
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SLC29A4-205ENST00000439491 SCRIBQ14160 1630 aa30.62■■■□□ 2.49
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SLC29A4-205ENST00000439491 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.18■■■□□ 2.42
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SLC29A4-205ENST00000439491 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.22■■■□□ 2.27
SLC29A4-205ENST00000439491 SMARCA2P51531 1590 aa29.2■■■□□ 2.26
SLC29A4-205ENST00000439491 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
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SLC29A4-205ENST00000439491 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.09■■■□□ 2.25
SLC29A4-205ENST00000439491 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.93■■■□□ 2.22
SLC29A4-205ENST00000439491 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
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SLC29A4-205ENST00000439491 CUX2O14529 1486 aa28.72■■■□□ 2.19
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SLC29A4-205ENST00000439491 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.64■■■□□ 2.18
SLC29A4-205ENST00000439491 WIZO95785 1651 aa28.61■■■□□ 2.17
SLC29A4-205ENST00000439491 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
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SLC29A4-205ENST00000439491 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
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SLC29A4-205ENST00000439491 WDR62O43379 1518 aa28.13■■■□□ 2.09
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SLC29A4-205ENST00000439491 PRDM2Q13029 1718 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC29A4-205ENST00000439491 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.9■■■□□ 2.06
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SLC29A4-205ENST00000439491 WDR97A6NE52 1622 aa27.18■■□□□ 1.94
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SLC29A4-205ENST00000439491 SOGA1O94964 1423 aa27.1■■□□□ 1.93
SLC29A4-205ENST00000439491 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
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SLC29A4-205ENST00000439491 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.04■■□□□ 1.92
SLC29A4-205ENST00000439491 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.04■■□□□ 1.92
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SLC29A4-205ENST00000439491 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.9■■□□□ 1.9
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SLC29A4-205ENST00000439491 TOP2BQ02880 1626 aa26.87■■□□□ 1.89
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SLC29A4-205ENST00000439491 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.83■■□□□ 1.89
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SLC29A4-205ENST00000439491 FBLN2P98095 1184 aa26.78■■□□□ 1.88
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SLC29A4-205ENST00000439491 ARAP1Q96P48 1450 aa26.72■■□□□ 1.87
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SLC29A4-205ENST00000439491 ADAMTS12P58397 1594 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC29A4-205ENST00000439491 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC29A4-205ENST00000439491 GRIN2AQ12879 1464 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC29A4-205ENST00000439491 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.57■■□□□ 1.84
SLC29A4-205ENST00000439491 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC29A4-205ENST00000439491 NUP160Q12769 1436 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC29A4-205ENST00000439491 CEP170Q5SW79 1584 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC29A4-205ENST00000439491 SHROOM2Q13796 1616 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC29A4-205ENST00000439491 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.35■■□□□ 1.81
SLC29A4-205ENST00000439491 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.29■■□□□ 1.8
SLC29A4-205ENST00000439491 CUL7Q14999 1698 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC29A4-205ENST00000439491 KIF27Q86VH2 1401 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC29A4-205ENST00000439491 IGF1RP08069 1367 aa26.19■■□□□ 1.78
SLC29A4-205ENST00000439491 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
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