RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431068.5

GNB2-208, Transcript of G protein subunit beta 2, human

TSL 5

Gene GNB2, Length 910 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNB2-208	ENST00000431068	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		43.87	■■■■■ 4.61
GNB2-208	ENST00000431068	ABCC9	O60706	1549 aa		39.75	■■■■□ 3.95
GNB2-208	ENST00000431068	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.54	■■■■□ 3.92
GNB2-208	ENST00000431068	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.75	■■■■□ 3.63
GNB2-208	ENST00000431068	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		37.44	■■■■□ 3.58
GNB2-208	ENST00000431068	NACAD	O15069	1562 aa		37.41	■■■■□ 3.58
GNB2-208	ENST00000431068	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.04	■■■■□ 3.52
GNB2-208	ENST00000431068	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.9	■■■■□ 3.5
GNB2-208	ENST00000431068	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	36.9	■■■■□ 3.5
GNB2-208	ENST00000431068	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		36.81	■■■■□ 3.48
GNB2-208	ENST00000431068	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.65	■■■■□ 3.46
GNB2-208	ENST00000431068	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	36.34	■■■■□ 3.41
GNB2-208	ENST00000431068	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		36.24	■■■■□ 3.39
GNB2-208	ENST00000431068	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.17	■■■■□ 3.38
GNB2-208	ENST00000431068	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.01	■■■■□ 3.35
GNB2-208	ENST00000431068	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.91	■■■■□ 3.34
GNB2-208	ENST00000431068	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.84	■■■■□ 3.33
GNB2-208	ENST00000431068	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.79	■■■■□ 3.32
GNB2-208	ENST00000431068	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		34.59	■■■■□ 3.13
GNB2-208	ENST00000431068	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.51	■■■■□ 3.11
GNB2-208	ENST00000431068	CUX2	O14529	1486 aa		34.39	■■■■□ 3.1
GNB2-208	ENST00000431068	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.38	■■■■□ 3.09
GNB2-208	ENST00000431068	ERCC6	Q03468	1493 aa		34.36	■■■■□ 3.09
GNB2-208	ENST00000431068	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.31	■■■■□ 3.08
GNB2-208	ENST00000431068	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.29	■■■■□ 3.08
GNB2-208	ENST00000431068	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.29	■■■■□ 3.08
GNB2-208	ENST00000431068	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	34.1	■■■■□ 3.05
GNB2-208	ENST00000431068	NES	P48681	1621 aa		34.07	■■■■□ 3.04
GNB2-208	ENST00000431068	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.06	■■■■□ 3.04
GNB2-208	ENST00000431068	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		33.98	■■■■□ 3.03
GNB2-208	ENST00000431068	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.84	■■■■□ 3.01
GNB2-208	ENST00000431068	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.81	■■■■□ 3
GNB2-208	ENST00000431068	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		33.8	■■■■□ 3
GNB2-208	ENST00000431068	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.67	■■■□□ 2.98
GNB2-208	ENST00000431068	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.6	■■■□□ 2.97
GNB2-208	ENST00000431068	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.44	■■■□□ 2.94
GNB2-208	ENST00000431068	WIZ	O95785	1651 aa		33.39	■■■□□ 2.94
GNB2-208	ENST00000431068	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.36	■■■□□ 2.93
GNB2-208	ENST00000431068	WDR62	O43379	1518 aa		33.3	■■■□□ 2.92
GNB2-208	ENST00000431068	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.18	■■■□□ 2.9
GNB2-208	ENST00000431068	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.09	■■■□□ 2.89
GNB2-208	ENST00000431068	CFTR	P13569	1480 aa		33.02	■■■□□ 2.88
GNB2-208	ENST00000431068	TRIM41	Q8WV44	630 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GNB2-208	ENST00000431068	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
GNB2-208	ENST00000431068	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
GNB2-208	ENST00000431068	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
GNB2-208	ENST00000431068	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.74	■■■□□ 2.83
GNB2-208	ENST00000431068	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GNB2-208	ENST00000431068	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		32.55	■■■□□ 2.8
GNB2-208	ENST00000431068	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.51	■■■□□ 2.79
GNB2-208	ENST00000431068	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
GNB2-208	ENST00000431068	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GNB2-208	ENST00000431068	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GNB2-208	ENST00000431068	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GNB2-208	ENST00000431068	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GNB2-208	ENST00000431068	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
GNB2-208	ENST00000431068	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GNB2-208	ENST00000431068	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GNB2-208	ENST00000431068	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.26	■■■□□ 2.75
GNB2-208	ENST00000431068	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
GNB2-208	ENST00000431068	CHD1	O14646	1710 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GNB2-208	ENST00000431068	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.11	■■■□□ 2.73	4e-7	■■■■■ 28.4
GNB2-208	ENST00000431068	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
GNB2-208	ENST00000431068	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GNB2-208	ENST00000431068	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		31.94	■■■□□ 2.7
GNB2-208	ENST00000431068	FBLN2	P98095	1184 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GNB2-208	ENST00000431068	ARAP1	Q96P48	1450 aa		31.92	■■■□□ 2.7
GNB2-208	ENST00000431068	SOGA1	O94964	1423 aa		31.9	■■■□□ 2.7
GNB2-208	ENST00000431068	WDR97	A6NE52	1622 aa		31.87	■■■□□ 2.69
GNB2-208	ENST00000431068	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
GNB2-208	ENST00000431068	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		31.85	■■■□□ 2.69
GNB2-208	ENST00000431068	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.84	■■■□□ 2.69
GNB2-208	ENST00000431068	CUX1	P39880	1505 aa		31.79	■■■□□ 2.68
GNB2-208	ENST00000431068	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.75	■■■□□ 2.67
GNB2-208	ENST00000431068	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
GNB2-208	ENST00000431068	SYNJ1	O43426	1573 aa		31.71	■■■□□ 2.67
GNB2-208	ENST00000431068	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
GNB2-208	ENST00000431068	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.69	■■■□□ 2.66
GNB2-208	ENST00000431068	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
GNB2-208	ENST00000431068	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.63	■■■□□ 2.65
GNB2-208	ENST00000431068	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.6	■■■□□ 2.65
GNB2-208	ENST00000431068	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.53	■■■□□ 2.64
GNB2-208	ENST00000431068	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.49	■■■□□ 2.63
GNB2-208	ENST00000431068	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.47	■■■□□ 2.63
GNB2-208	ENST00000431068	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.29	■■■□□ 2.6
GNB2-208	ENST00000431068	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.29	■■■□□ 2.6
GNB2-208	ENST00000431068	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	31.27	■■■□□ 2.6
GNB2-208	ENST00000431068	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.59
GNB2-208	ENST00000431068	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		31.24	■■■□□ 2.59
GNB2-208	ENST00000431068	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.22	■■■□□ 2.59
GNB2-208	ENST00000431068	TOP2B	Q02880	1626 aa		31.21	■■■□□ 2.59
GNB2-208	ENST00000431068	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.21	■■■□□ 2.59
GNB2-208	ENST00000431068	NUP160	Q12769	1436 aa		31.19	■■■□□ 2.58
GNB2-208	ENST00000431068	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.13	■■■□□ 2.57
GNB2-208	ENST00000431068	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.11	■■■□□ 2.57
GNB2-208	ENST00000431068	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.09	■■■□□ 2.57
GNB2-208	ENST00000431068	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	30.96	■■■□□ 2.55
GNB2-208	ENST00000431068	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	30.89	■■■□□ 2.53
GNB2-208	ENST00000431068	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		30.86	■■■□□ 2.53
GNB2-208	ENST00000431068	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		30.83	■■■□□ 2.53

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