RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428818.5

TTC28-AS1-208, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene TTC28-AS1, Length 706 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-208ENST00000428818 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.34■■□□□ 1.49
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.1■■□□□ 1.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.6■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-208ENST00000428818 FOXD1Q16676 465 aa20.39■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ABCC9O60706 1549 aa20.03■□□□□ 0.8
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.47■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.25■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NACADO15069 1562 aa19.22■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-208ENST00000428818 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.11■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.11■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.09■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.07■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.06■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ADRA2BP18089 450 aa19.05■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MSH5O43196 834 aa19.02■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SCRIBQ14160 1630 aa18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-208ENST00000428818 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.8■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-208ENST00000428818 POTEDQ86YR6 584 aa18.58■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.4■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-208ENST00000428818 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.16■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SMARCA4P51532 1647 aa18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-208ENST00000428818 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.87■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.77■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.75■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-208ENST00000428818 WIZO95785 1651 aa17.75■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SMARCA2P51531 1590 aa17.74■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-208ENST00000428818 HMGXB3Q12766 1538 aa17.71■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NCAPD3P42695 1498 aa17.68■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-208ENST00000428818 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NESP48681 1621 aa17.41■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.32■□□□□ 0.36
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.32■□□□□ 0.36
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.28■□□□□ 0.36
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PRDM2Q13029 1718 aa17.26■□□□□ 0.35
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.22■□□□□ 0.35
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.2■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-208ENST00000428818 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ERCC6Q03468 1493 aa17.18■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.15■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CFTRP13569 1480 aa17.12■□□□□ 0.33
TTC28-AS1-208ENST00000428818 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.05■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-208ENST00000428818 WDR62O43379 1518 aa16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CUX2O14529 1486 aa16.96■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-208ENST00000428818 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KCNA4P22459 653 aa16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TOPBP1Q92547 1522 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CUX1P39880 1505 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ABCC8Q09428 1581 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SYNJ1O43426 1573 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 WDR97A6NE52 1622 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TOP2BQ02880 1626 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 IFT140Q96RY7 1462 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-208ENST00000428818 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PBRM1Q86U86 1689 aa16.55■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.51■□□□□ 0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CHD1O14646 1710 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SOGA1O94964 1423 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.4■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-208ENST00000428818 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.36■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ADAMTS12P58397 1594 aa16.35■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-208ENST00000428818 GRIN2BQ13224 1484 aa16.33■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.25■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RNF39Q9H2S5 420 aa16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms