RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428732.1

DEPDC1-AS1-201, DEPDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene DEPDC1-AS1, Length 1,247 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.04■■■□□ 2.88
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.07■■■□□ 2.72
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ABCC9O60706 1549 aa29.81■■■□□ 2.36
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.68■■■□□ 2.34
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.31■■■□□ 2.12
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 NACADO15069 1562 aa28.08■■■□□ 2.09
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.06■■■□□ 2.08
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.94■■■□□ 2.06
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.74■■■□□ 2.03
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.66■■■□□ 2.02
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.65■■■□□ 2.02
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 FOXD1Q16676 465 aa27.51■■□□□ 1.99
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.51■■□□□ 1.99
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.27■■□□□ 1.96
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.11■■□□□ 1.93
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SCRIBQ14160 1630 aa27.06■■□□□ 1.92
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 POTEDQ86YR6 584 aa27.03■■□□□ 1.92
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.9■■□□□ 1.9
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.86■■□□□ 1.89
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 MSH5O43196 834 aa26.13■■□□□ 1.77
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 NCAPD3P42695 1498 aa25.94■■□□□ 1.74
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.85■■□□□ 1.73
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.82■■□□□ 1.72
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SMARCA4P51532 1647 aa25.8■■□□□ 1.72
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SMARCA2P51531 1590 aa25.77■■□□□ 1.72
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 HMGXB3Q12766 1538 aa25.73■■□□□ 1.71
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ERCC6Q03468 1493 aa25.73■■□□□ 1.71
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CUX2O14529 1486 aa25.71■■□□□ 1.71
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 NESP48681 1621 aa25.59■■□□□ 1.69
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.54■■□□□ 1.68
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.48■■□□□ 1.67
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.36■■□□□ 1.65
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.23■■□□□ 1.63
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.22■■□□□ 1.63
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 WIZO95785 1651 aa25.16■■□□□ 1.62
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.15■■□□□ 1.62
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.02■■□□□ 1.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.01■■□□□ 1.59
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 WDR62O43379 1518 aa24.96■■□□□ 1.59
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.92■■□□□ 1.58
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.9■■□□□ 1.58
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ADRA2BP18089 450 aa24.9■■□□□ 1.58
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.87■■□□□ 1.57
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CFTRP13569 1480 aa24.84■■□□□ 1.57
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 TRIM41Q8WV44 630 aa24.66■■□□□ 1.54
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.56■■□□□ 1.52
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PRDM2Q13029 1718 aa24.55■■□□□ 1.52
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 OSCARQ8IYS5 282 aa24.52■■□□□ 1.52
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 IFT140Q96RY7 1462 aa24.4■■□□□ 1.5
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 TOPBP1Q92547 1522 aa24.39■■□□□ 1.49
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ABCC8Q09428 1581 aa24.3■■□□□ 1.48
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.29■■□□□ 1.48
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.23■■□□□ 1.47
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.23■■□□□ 1.47
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.23■■□□□ 1.47
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ARHGEF11O15085 1522 aa24.15■■□□□ 1.46
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CHD1O14646 1710 aa24.07■■□□□ 1.44
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.06■■□□□ 1.44
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 FBLN2P98095 1184 aa24.02■■□□□ 1.44
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SOGA1O94964 1423 aa24.01■■□□□ 1.43
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.97■■□□□ 1.43
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.97■■□□□ 1.43
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CUX1P39880 1505 aa23.94■■□□□ 1.42
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.91■■□□□ 1.42
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ARAP1Q96P48 1450 aa23.9■■□□□ 1.42
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 WDR97A6NE52 1622 aa23.9■■□□□ 1.42
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 GRIN2BQ13224 1484 aa23.82■■□□□ 1.4
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.81■■□□□ 1.4
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SYNJ1O43426 1573 aa23.78■■□□□ 1.4
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SYNJ2O15056 1496 aa23.75■■□□□ 1.39
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.72■■□□□ 1.39
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PBRM1Q86U86 1689 aa23.71■■□□□ 1.39
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.69■■□□□ 1.38
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.66■■□□□ 1.38
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 GRIN2AQ12879 1464 aa23.52■■□□□ 1.36
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 TOP2BQ02880 1626 aa23.51■■□□□ 1.35
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.51■■□□□ 1.35
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