RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424699.5

PRKRA-202, Transcript of protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2, humanhuman

TSL 2

Gene PRKRA, Length 1,616 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRA-202ENST00000424699 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.98■■■■■ 5.91
PRKRA-202ENST00000424699 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.15■■■■■ 4.98
PRKRA-202ENST00000424699 ABCC9O60706 1549 aa45■■■■■ 4.79
PRKRA-202ENST00000424699 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
PRKRA-202ENST00000424699 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.31■■■■■ 4.52
PRKRA-202ENST00000424699 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.27■■■■■ 4.52
PRKRA-202ENST00000424699 NACADO15069 1562 aa43.24■■■■■ 4.51
PRKRA-202ENST00000424699 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.97■■■■■ 4.47
PRKRA-202ENST00000424699 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.91■■■■■ 4.46
PRKRA-202ENST00000424699 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.65■■■■■ 4.42
PRKRA-202ENST00000424699 SCRIBQ14160 1630 aa42.26■■■■■ 4.36
PRKRA-202ENST00000424699 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.11■■■■■ 4.33
PRKRA-202ENST00000424699 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.06■■■■■ 4.32
PRKRA-202ENST00000424699 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.38■■■■■ 4.21
PRKRA-202ENST00000424699 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.12■■■■■ 4.17
PRKRA-202ENST00000424699 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
PRKRA-202ENST00000424699 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.74■■■■■ 4.11
PRKRA-202ENST00000424699 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.57■■■■■ 4.09
PRKRA-202ENST00000424699 SMARCA4P51532 1647 aa40.37■■■■■ 4.05
PRKRA-202ENST00000424699 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
PRKRA-202ENST00000424699 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.16■■■■■ 4.02
PRKRA-202ENST00000424699 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40■■■■□ 3.99
PRKRA-202ENST00000424699 SMARCA2P51531 1590 aa39.92■■■■□ 3.98
PRKRA-202ENST00000424699 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.89■■■■□ 3.98
PRKRA-202ENST00000424699 NCAPD3P42695 1498 aa39.87■■■■□ 3.97
PRKRA-202ENST00000424699 WIZO95785 1651 aa39.82■■■■□ 3.97
PRKRA-202ENST00000424699 HMGXB3Q12766 1538 aa39.76■■■■□ 3.96
PRKRA-202ENST00000424699 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
PRKRA-202ENST00000424699 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
PRKRA-202ENST00000424699 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.26■■■■□ 3.88
PRKRA-202ENST00000424699 NESP48681 1621 aa39.07■■■■□ 3.84
PRKRA-202ENST00000424699 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
PRKRA-202ENST00000424699 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.85■■■■□ 3.81
PRKRA-202ENST00000424699 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.8■■■■□ 3.8
PRKRA-202ENST00000424699 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.71■■■■□ 3.79
PRKRA-202ENST00000424699 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.71■■■■□ 3.79
PRKRA-202ENST00000424699 ERCC6Q03468 1493 aa38.67■■■■□ 3.78
PRKRA-202ENST00000424699 CFTRP13569 1480 aa38.58■■■■□ 3.77
PRKRA-202ENST00000424699 PRDM2Q13029 1718 aa38.54■■■■□ 3.76
PRKRA-202ENST00000424699 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.46■■■■□ 3.75
PRKRA-202ENST00000424699 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
PRKRA-202ENST00000424699 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.35■■■■□ 3.73
PRKRA-202ENST00000424699 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.27■■■■□ 3.72
PRKRA-202ENST00000424699 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.16■■■■□ 3.7
PRKRA-202ENST00000424699 CUX2O14529 1486 aa38.12■■■■□ 3.69
PRKRA-202ENST00000424699 WDR62O43379 1518 aa38.08■■■■□ 3.69
PRKRA-202ENST00000424699 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.03■■■■□ 3.68
PRKRA-202ENST00000424699 TOPBP1Q92547 1522 aa37.8■■■■□ 3.64
PRKRA-202ENST00000424699 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.77■■■■□ 3.64
PRKRA-202ENST00000424699 CUX1P39880 1505 aa37.65■■■■□ 3.62
PRKRA-202ENST00000424699 ABCC8Q09428 1581 aa37.61■■■■□ 3.61
PRKRA-202ENST00000424699 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.59
PRKRA-202ENST00000424699 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.45■■■■□ 3.59
PRKRA-202ENST00000424699 SYNJ1O43426 1573 aa37.45■■■■□ 3.59
PRKRA-202ENST00000424699 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
PRKRA-202ENST00000424699 IFT140Q96RY7 1462 aa37.4■■■■□ 3.58
PRKRA-202ENST00000424699 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.39■■■■□ 3.58
PRKRA-202ENST00000424699 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
PRKRA-202ENST00000424699 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.38■■■■□ 3.58
PRKRA-202ENST00000424699 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.38■■■■□ 3.57
PRKRA-202ENST00000424699 TOP2BQ02880 1626 aa37.35■■■■□ 3.57
PRKRA-202ENST00000424699 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
PRKRA-202ENST00000424699 WDR97A6NE52 1622 aa37.27■■■■□ 3.56
PRKRA-202ENST00000424699 SOGA1O94964 1423 aa37.26■■■■□ 3.55
PRKRA-202ENST00000424699 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.15■■■■□ 3.543e-6■■■■□ 24.7
PRKRA-202ENST00000424699 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
PRKRA-202ENST00000424699 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.04■■■■□ 3.52
PRKRA-202ENST00000424699 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.99■■■■□ 3.51
PRKRA-202ENST00000424699 PBRM1Q86U86 1689 aa36.98■■■■□ 3.51
PRKRA-202ENST00000424699 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.87■■■■□ 3.49
PRKRA-202ENST00000424699 CHD1O14646 1710 aa36.86■■■■□ 3.49
PRKRA-202ENST00000424699 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.82■■■■□ 3.48
PRKRA-202ENST00000424699 GRIN2BQ13224 1484 aa36.79■■■■□ 3.48
PRKRA-202ENST00000424699 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.67■■■■□ 3.46
PRKRA-202ENST00000424699 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
PRKRA-202ENST00000424699 ADAMTS12P58397 1594 aa36.6■■■■□ 3.45
PRKRA-202ENST00000424699 FBLN2P98095 1184 aa36.59■■■■□ 3.45
PRKRA-202ENST00000424699 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.58■■■■□ 3.45
PRKRA-202ENST00000424699 TRIM41Q8WV44 630 aa36.57■■■■□ 3.44
PRKRA-202ENST00000424699 SYNJ2O15056 1496 aa36.54■■■■□ 3.44
PRKRA-202ENST00000424699 KIF27Q86VH2 1401 aa36.52■■■■□ 3.44
PRKRA-202ENST00000424699 OSCARQ8IYS5 282 aa36.52■■■■□ 3.44
PRKRA-202ENST00000424699 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.49■■■■□ 3.43
PRKRA-202ENST00000424699 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.42
PRKRA-202ENST00000424699 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.39■■■■□ 3.42
PRKRA-202ENST00000424699 GRIN2AQ12879 1464 aa36.38■■■■□ 3.41
PRKRA-202ENST00000424699 IGF1RP08069 1367 aa36.38■■■■□ 3.41
PRKRA-202ENST00000424699 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.36■■■■□ 3.41
PRKRA-202ENST00000424699 CUL7Q14999 1698 aa36.35■■■■□ 3.41
PRKRA-202ENST00000424699 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.31■■■■□ 3.4
PRKRA-202ENST00000424699 CEP170Q5SW79 1584 aa36.31■■■■□ 3.4
PRKRA-202ENST00000424699 NUP160Q12769 1436 aa36.18■■■■□ 3.38
PRKRA-202ENST00000424699 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.17■■■■□ 3.38
PRKRA-202ENST00000424699 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.17■■■■□ 3.38
PRKRA-202ENST00000424699 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.17■■■■□ 3.38
PRKRA-202ENST00000424699 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.16■■■■□ 3.38
PRKRA-202ENST00000424699 ARHGEF11O15085 1522 aa36.12■■■■□ 3.37
PRKRA-202ENST00000424699 SHROOM2Q13796 1616 aa35.98■■■■□ 3.35
PRKRA-202ENST00000424699 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.98■■■■□ 3.35
PRKRA-202ENST00000424699 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
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