RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423170.1

RNF25-202, Transcript of ring finger protein 25, humanhuman

TSL 5

Gene RNF25, Length 624 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF25-202ENST00000423170 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.51■■■□□ 2.8
RNF25-202ENST00000423170 ABCC9O60706 1549 aa29.85■■■□□ 2.37
RNF25-202ENST00000423170 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.54■■■□□ 2.32
RNF25-202ENST00000423170 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.44■■■□□ 2.14
RNF25-202ENST00000423170 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.24■■■□□ 2.11
RNF25-202ENST00000423170 NACADO15069 1562 aa27.92■■■□□ 2.06
RNF25-202ENST00000423170 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.87■■■□□ 2.05
RNF25-202ENST00000423170 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.01
RNF25-202ENST00000423170 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.56■■■□□ 2
RNF25-202ENST00000423170 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.39■■□□□ 1.98
RNF25-202ENST00000423170 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.31■■□□□ 1.96
RNF25-202ENST00000423170 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.04■■□□□ 1.92
RNF25-202ENST00000423170 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.04■■□□□ 1.92
RNF25-202ENST00000423170 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.93■■□□□ 1.9
RNF25-202ENST00000423170 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
RNF25-202ENST00000423170 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.86■■□□□ 1.89
RNF25-202ENST00000423170 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
RNF25-202ENST00000423170 SCRIBQ14160 1630 aa26.79■■□□□ 1.88
RNF25-202ENST00000423170 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.42■■□□□ 1.82
RNF25-202ENST00000423170 CUX2O14529 1486 aa25.97■■□□□ 1.75
RNF25-202ENST00000423170 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
RNF25-202ENST00000423170 NCAPD3P42695 1498 aa25.74■■□□□ 1.71
RNF25-202ENST00000423170 ERCC6Q03468 1493 aa25.74■■□□□ 1.71
RNF25-202ENST00000423170 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.6■■□□□ 1.69
RNF25-202ENST00000423170 HMGXB3Q12766 1538 aa25.59■■□□□ 1.69
RNF25-202ENST00000423170 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.56■■□□□ 1.68
RNF25-202ENST00000423170 NESP48681 1621 aa25.55■■□□□ 1.68
RNF25-202ENST00000423170 SMARCA4P51532 1647 aa25.55■■□□□ 1.68
RNF25-202ENST00000423170 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
RNF25-202ENST00000423170 SMARCA2P51531 1590 aa25.51■■□□□ 1.67
RNF25-202ENST00000423170 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.34■■□□□ 1.65
RNF25-202ENST00000423170 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.32■■□□□ 1.64
RNF25-202ENST00000423170 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
RNF25-202ENST00000423170 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.3■■□□□ 1.64
RNF25-202ENST00000423170 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
RNF25-202ENST00000423170 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.06■■□□□ 1.6
RNF25-202ENST00000423170 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.03■■□□□ 1.6
RNF25-202ENST00000423170 WDR62O43379 1518 aa24.98■■□□□ 1.59
RNF25-202ENST00000423170 TRIM41Q8WV44 630 aa24.96■■□□□ 1.59
RNF25-202ENST00000423170 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.94■■□□□ 1.58
RNF25-202ENST00000423170 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF25-202ENST00000423170 WIZO95785 1651 aa24.79■■□□□ 1.56
RNF25-202ENST00000423170 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.72■■□□□ 1.55
RNF25-202ENST00000423170 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.64■■□□□ 1.54
RNF25-202ENST00000423170 CFTRP13569 1480 aa24.56■■□□□ 1.52
RNF25-202ENST00000423170 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
RNF25-202ENST00000423170 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.52■■□□□ 1.52
RNF25-202ENST00000423170 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.52■■□□□ 1.52
RNF25-202ENST00000423170 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.52■■□□□ 1.52
RNF25-202ENST00000423170 PRDM2Q13029 1718 aa24.52■■□□□ 1.52
RNF25-202ENST00000423170 OSCARQ8IYS5 282 aa24.49■■□□□ 1.51
RNF25-202ENST00000423170 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
RNF25-202ENST00000423170 ARHGEF11O15085 1522 aa24.33■■□□□ 1.49
RNF25-202ENST00000423170 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
RNF25-202ENST00000423170 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
RNF25-202ENST00000423170 IFT140Q96RY7 1462 aa24.23■■□□□ 1.47
RNF25-202ENST00000423170 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
RNF25-202ENST00000423170 CHD1O14646 1710 aa24.21■■□□□ 1.47
RNF25-202ENST00000423170 TOPBP1Q92547 1522 aa24.16■■□□□ 1.46
RNF25-202ENST00000423170 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
RNF25-202ENST00000423170 ARAP1Q96P48 1450 aa24.07■■□□□ 1.44
RNF25-202ENST00000423170 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.06■■□□□ 1.44
RNF25-202ENST00000423170 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.06■■□□□ 1.44
RNF25-202ENST00000423170 ABCC8Q09428 1581 aa23.98■■□□□ 1.43
RNF25-202ENST00000423170 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.96■■□□□ 1.43
RNF25-202ENST00000423170 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.42
RNF25-202ENST00000423170 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
RNF25-202ENST00000423170 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.85■■□□□ 1.41
RNF25-202ENST00000423170 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
RNF25-202ENST00000423170 WDR97A6NE52 1622 aa23.77■■□□□ 1.4
RNF25-202ENST00000423170 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.76■■□□□ 1.39
RNF25-202ENST00000423170 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.74■■□□□ 1.39
RNF25-202ENST00000423170 FBLN2P98095 1184 aa23.7■■□□□ 1.38
RNF25-202ENST00000423170 SYNJ1O43426 1573 aa23.69■■□□□ 1.38
RNF25-202ENST00000423170 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
RNF25-202ENST00000423170 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.65■■□□□ 1.38
RNF25-202ENST00000423170 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
RNF25-202ENST00000423170 SOGA1O94964 1423 aa23.64■■□□□ 1.37
RNF25-202ENST00000423170 PBRM1Q86U86 1689 aa23.64■■□□□ 1.37
RNF25-202ENST00000423170 CUX1P39880 1505 aa23.59■■□□□ 1.37
RNF25-202ENST00000423170 SYNJ2O15056 1496 aa23.56■■□□□ 1.36
RNF25-202ENST00000423170 GRIN2BQ13224 1484 aa23.56■■□□□ 1.36
RNF25-202ENST00000423170 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.5■■□□□ 1.35
RNF25-202ENST00000423170 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.48■■□□□ 1.35
RNF25-202ENST00000423170 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
RNF25-202ENST00000423170 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF25-202ENST00000423170 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.37■■□□□ 1.33
RNF25-202ENST00000423170 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.35■■□□□ 1.33
RNF25-202ENST00000423170 SHROOM2Q13796 1616 aa23.33■■□□□ 1.32
RNF25-202ENST00000423170 CEP170Q5SW79 1584 aa23.32■■□□□ 1.32
RNF25-202ENST00000423170 ADAMTS12P58397 1594 aa23.31■■□□□ 1.32
RNF25-202ENST00000423170 GRIN2AQ12879 1464 aa23.3■■□□□ 1.32
RNF25-202ENST00000423170 NUP160Q12769 1436 aa23.25■■□□□ 1.31
RNF25-202ENST00000423170 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.15■■□□□ 1.3
RNF25-202ENST00000423170 TOP2BQ02880 1626 aa23.08■■□□□ 1.29
RNF25-202ENST00000423170 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.07■■□□□ 1.28
RNF25-202ENST00000423170 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.05■■□□□ 1.28
RNF25-202ENST00000423170 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
RNF25-202ENST00000423170 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.03■■□□□ 1.28
RNF25-202ENST00000423170 DIP2BQ9P265 1576 aa23.01■■□□□ 1.27
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