RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421609.5

CERS2-206, Transcript of ceramide synthase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CERS2, Length 738 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2-206ENST00000421609 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.83■■■■■ 7.81
CERS2-206ENST00000421609 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.21■■■■■ 6.75
CERS2-206ENST00000421609 ABCC9O60706 1549 aa56.62■■■■■ 6.65
CERS2-206ENST00000421609 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.18■■■■■ 6.26
CERS2-206ENST00000421609 NACADO15069 1562 aa53.94■■■■■ 6.23
CERS2-206ENST00000421609 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.45■■■■■ 6.15
CERS2-206ENST00000421609 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.4■■■■■ 6.14
CERS2-206ENST00000421609 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.02■■■■■ 6.08
CERS2-206ENST00000421609 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.01■■■■■ 6.08
CERS2-206ENST00000421609 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.85■■■■■ 6.05
CERS2-206ENST00000421609 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.73■■■■■ 6.03
CERS2-206ENST00000421609 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.71■■■■■ 6.03
CERS2-206ENST00000421609 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.6■■■■■ 6.01
CERS2-206ENST00000421609 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.03■■■■■ 5.92
CERS2-206ENST00000421609 SCRIBQ14160 1630 aa52.01■■■■■ 5.92
CERS2-206ENST00000421609 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.26■■■■■ 5.8
CERS2-206ENST00000421609 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.25■■■■■ 5.79
CERS2-206ENST00000421609 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.01■■■■■ 5.76
CERS2-206ENST00000421609 NCAPD3P42695 1498 aa49.76■■■■■ 5.56
CERS2-206ENST00000421609 SMARCA4P51532 1647 aa49.72■■■■■ 5.55
CERS2-206ENST00000421609 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.64■■■■■ 5.54
CERS2-206ENST00000421609 SMARCA2P51531 1590 aa49.57■■■■■ 5.53
CERS2-206ENST00000421609 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.54■■■■■ 5.52
CERS2-206ENST00000421609 HMGXB3Q12766 1538 aa49.47■■■■■ 5.51
CERS2-206ENST00000421609 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.31■■■■■ 5.48
CERS2-206ENST00000421609 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.17■■■■■ 5.46
CERS2-206ENST00000421609 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.15■■■■■ 5.46
CERS2-206ENST00000421609 ERCC6Q03468 1493 aa48.87■■■■■ 5.41
CERS2-206ENST00000421609 NESP48681 1621 aa48.77■■■■■ 5.4
CERS2-206ENST00000421609 CUX2O14529 1486 aa48.74■■■■■ 5.39
CERS2-206ENST00000421609 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.6■■■■■ 5.37
CERS2-206ENST00000421609 WIZO95785 1651 aa48.59■■■■■ 5.37
CERS2-206ENST00000421609 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.3■■■■■ 5.32
CERS2-206ENST00000421609 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.29■■■■■ 5.32
CERS2-206ENST00000421609 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.25■■■■■ 5.32
CERS2-206ENST00000421609 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.24■■■■■ 5.31
CERS2-206ENST00000421609 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.23■■■■■ 5.31
CERS2-206ENST00000421609 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.18■■■■■ 5.3
CERS2-206ENST00000421609 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.05■■■■■ 5.28
CERS2-206ENST00000421609 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.82■■■■■ 5.25
CERS2-206ENST00000421609 CFTRP13569 1480 aa47.81■■■■■ 5.24
CERS2-206ENST00000421609 WDR62O43379 1518 aa47.74■■■■■ 5.23
CERS2-206ENST00000421609 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.71■■■■■ 5.23
CERS2-206ENST00000421609 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.67■■■■■ 5.22
CERS2-206ENST00000421609 PRDM2Q13029 1718 aa47.46■■■■■ 5.19
CERS2-206ENST00000421609 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.44■■■■■ 5.18
CERS2-206ENST00000421609 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.27■■■■■ 5.16
CERS2-206ENST00000421609 TOPBP1Q92547 1522 aa46.84■■■■■ 5.09
CERS2-206ENST00000421609 ABCC8Q09428 1581 aa46.81■■■■■ 5.08
CERS2-206ENST00000421609 IFT140Q96RY7 1462 aa46.76■■■■■ 5.08
CERS2-206ENST00000421609 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.73■■■■■ 5.07
CERS2-206ENST00000421609 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.59■■■■■ 5.05
CERS2-206ENST00000421609 OSCARQ8IYS5 282 aa46.48■■■■■ 5.03
CERS2-206ENST00000421609 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
CERS2-206ENST00000421609 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
CERS2-206ENST00000421609 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.38■■■■■ 5.02
CERS2-206ENST00000421609 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.27■■■■■ 5
CERS2-206ENST00000421609 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.19■■■■■ 4.988e-9■■■■■ 27
CERS2-206ENST00000421609 CUX1P39880 1505 aa46.18■■■■■ 4.98
CERS2-206ENST00000421609 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.14■■■■■ 4.98
CERS2-206ENST00000421609 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.13■■■■■ 4.98
CERS2-206ENST00000421609 SOGA1O94964 1423 aa46.13■■■■■ 4.98
CERS2-206ENST00000421609 TRIM41Q8WV44 630 aa46.1■■■■■ 4.97
CERS2-206ENST00000421609 WDR97A6NE52 1622 aa46.06■■■■■ 4.96
CERS2-206ENST00000421609 CHD1O14646 1710 aa46■■■■■ 4.95
CERS2-206ENST00000421609 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.96■■■■■ 4.95
CERS2-206ENST00000421609 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.9■■■■■ 4.94
CERS2-206ENST00000421609 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.9■■■■■ 4.94
CERS2-206ENST00000421609 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.9■■■■■ 4.94
CERS2-206ENST00000421609 ARHGEF11O15085 1522 aa45.8■■■■■ 4.92
CERS2-206ENST00000421609 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.77■■■■■ 4.92
CERS2-206ENST00000421609 GRIN2BQ13224 1484 aa45.74■■■■■ 4.91
CERS2-206ENST00000421609 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.73■■■■■ 4.91
CERS2-206ENST00000421609 FBLN2P98095 1184 aa45.71■■■■■ 4.91
CERS2-206ENST00000421609 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.68■■■■■ 4.9
CERS2-206ENST00000421609 PBRM1Q86U86 1689 aa45.63■■■■■ 4.89
CERS2-206ENST00000421609 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.61■■■■■ 4.89
CERS2-206ENST00000421609 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.6■■■■■ 4.89
CERS2-206ENST00000421609 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.59■■■■■ 4.89
CERS2-206ENST00000421609 TOP2BQ02880 1626 aa45.59■■■■■ 4.89
CERS2-206ENST00000421609 SYNJ2O15056 1496 aa45.55■■■■■ 4.88
CERS2-206ENST00000421609 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.53■■■■■ 4.88
CERS2-206ENST00000421609 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.51■■■■■ 4.88
CERS2-206ENST00000421609 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.5■■■■■ 4.87
CERS2-206ENST00000421609 SYNJ1O43426 1573 aa45.5■■■■■ 4.87
CERS2-206ENST00000421609 ARAP1Q96P48 1450 aa45.37■■■■■ 4.85
CERS2-206ENST00000421609 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.32■■■■■ 4.85
CERS2-206ENST00000421609 ADAMTS12P58397 1594 aa45.21■■■■■ 4.83
CERS2-206ENST00000421609 GRIN2AQ12879 1464 aa45.15■■■■■ 4.82
CERS2-206ENST00000421609 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.13■■■■■ 4.82
CERS2-206ENST00000421609 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.06■■■■■ 4.8
CERS2-206ENST00000421609 NUP160Q12769 1436 aa45.01■■■■■ 4.8
CERS2-206ENST00000421609 CEP170Q5SW79 1584 aa44.97■■■■■ 4.79
CERS2-206ENST00000421609 SHROOM2Q13796 1616 aa44.81■■■■■ 4.76
CERS2-206ENST00000421609 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.74■■■■■ 4.75
CERS2-206ENST00000421609 KIF27Q86VH2 1401 aa44.66■■■■■ 4.74
CERS2-206ENST00000421609 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.64■■■■■ 4.74
CERS2-206ENST00000421609 IGF1RP08069 1367 aa44.57■■■■■ 4.73
CERS2-206ENST00000421609 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.57■■■■■ 4.73
CERS2-206ENST00000421609 CUL7Q14999 1698 aa44.57■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms