RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417778.5

ZNF638-205, Transcript of zinc finger protein 638, humanhuman

TSL 3

Gene ZNF638, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF638-205ENST00000417778 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.52■■■□□ 2.64
ZNF638-205ENST00000417778 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.04■■■□□ 2.08
ZNF638-205ENST00000417778 ABCC9O60706 1549 aa27.64■■■□□ 2.02
ZNF638-205ENST00000417778 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.58■■□□□ 1.85
ZNF638-205ENST00000417778 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.56■■□□□ 1.84
ZNF638-205ENST00000417778 NACADO15069 1562 aa26.5■■□□□ 1.83
ZNF638-205ENST00000417778 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.29■■□□□ 1.8
ZNF638-205ENST00000417778 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
ZNF638-205ENST00000417778 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.1■■□□□ 1.77
ZNF638-205ENST00000417778 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
ZNF638-205ENST00000417778 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.67■■□□□ 1.7
ZNF638-205ENST00000417778 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
ZNF638-205ENST00000417778 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.6■■□□□ 1.69
ZNF638-205ENST00000417778 SCRIBQ14160 1630 aa25.56■■□□□ 1.68
ZNF638-205ENST00000417778 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.53■■□□□ 1.68
ZNF638-205ENST00000417778 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.44■■□□□ 1.66
ZNF638-205ENST00000417778 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.12■■□□□ 1.61
ZNF638-205ENST00000417778 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
ZNF638-205ENST00000417778 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.94■■□□□ 1.58
ZNF638-205ENST00000417778 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.89■■□□□ 1.58
ZNF638-205ENST00000417778 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
ZNF638-205ENST00000417778 NCAPD3P42695 1498 aa24.46■■□□□ 1.51
ZNF638-205ENST00000417778 SMARCA4P51532 1647 aa24.44■■□□□ 1.5
ZNF638-205ENST00000417778 SMARCA2P51531 1590 aa24.42■■□□□ 1.5
ZNF638-205ENST00000417778 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.42■■□□□ 1.5
ZNF638-205ENST00000417778 HMGXB3Q12766 1538 aa24.29■■□□□ 1.48
ZNF638-205ENST00000417778 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
ZNF638-205ENST00000417778 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.24■■□□□ 1.47
ZNF638-205ENST00000417778 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.22■■□□□ 1.47
ZNF638-205ENST00000417778 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
ZNF638-205ENST00000417778 ERCC6Q03468 1493 aa23.94■■□□□ 1.42
ZNF638-205ENST00000417778 WIZO95785 1651 aa23.92■■□□□ 1.42
ZNF638-205ENST00000417778 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.82■■□□□ 1.4
ZNF638-205ENST00000417778 NESP48681 1621 aa23.81■■□□□ 1.4
ZNF638-205ENST00000417778 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.78■■□□□ 1.4
ZNF638-205ENST00000417778 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.77■■□□□ 1.4
ZNF638-205ENST00000417778 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
ZNF638-205ENST00000417778 CUX2O14529 1486 aa23.72■■□□□ 1.39
ZNF638-205ENST00000417778 CFTRP13569 1480 aa23.56■■□□□ 1.36
ZNF638-205ENST00000417778 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.48■■□□□ 1.35
ZNF638-205ENST00000417778 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.47■■□□□ 1.35
ZNF638-205ENST00000417778 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.46■■□□□ 1.35
ZNF638-205ENST00000417778 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.45■■□□□ 1.34
ZNF638-205ENST00000417778 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ZNF638-205ENST00000417778 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF638-205ENST00000417778 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ZNF638-205ENST00000417778 WDR62O43379 1518 aa23.32■■□□□ 1.32
ZNF638-205ENST00000417778 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.18■■□□□ 1.3
ZNF638-205ENST00000417778 PRDM2Q13029 1718 aa23.17■■□□□ 1.3
ZNF638-205ENST00000417778 ABCC8Q09428 1581 aa23.15■■□□□ 1.3
ZNF638-205ENST00000417778 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ZNF638-205ENST00000417778 TOPBP1Q92547 1522 aa23.03■■□□□ 1.28
ZNF638-205ENST00000417778 IFT140Q96RY7 1462 aa23■■□□□ 1.27
ZNF638-205ENST00000417778 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.99■■□□□ 1.27
ZNF638-205ENST00000417778 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ZNF638-205ENST00000417778 SOGA1O94964 1423 aa22.82■■□□□ 1.24
ZNF638-205ENST00000417778 OSCARQ8IYS5 282 aa22.8■■□□□ 1.24
ZNF638-205ENST00000417778 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ZNF638-205ENST00000417778 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.75■■□□□ 1.23
ZNF638-205ENST00000417778 CUX1P39880 1505 aa22.75■■□□□ 1.23
ZNF638-205ENST00000417778 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.71■■□□□ 1.23
ZNF638-205ENST00000417778 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ZNF638-205ENST00000417778 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.221e-12■■■■■ 26.8
ZNF638-205ENST00000417778 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ZNF638-205ENST00000417778 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
ZNF638-205ENST00000417778 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ZNF638-205ENST00000417778 WDR97A6NE52 1622 aa22.65■■□□□ 1.22
ZNF638-205ENST00000417778 FBLN2P98095 1184 aa22.6■■□□□ 1.21
ZNF638-205ENST00000417778 GRIN2BQ13224 1484 aa22.56■■□□□ 1.2
ZNF638-205ENST00000417778 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.55■■□□□ 1.2
ZNF638-205ENST00000417778 TOP2BQ02880 1626 aa22.53■■□□□ 1.2
ZNF638-205ENST00000417778 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ZNF638-205ENST00000417778 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.53■■□□□ 1.2
ZNF638-205ENST00000417778 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ZNF638-205ENST00000417778 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.49■■□□□ 1.19
ZNF638-205ENST00000417778 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.49■■□□□ 1.19
ZNF638-205ENST00000417778 SYNJ1O43426 1573 aa22.46■■□□□ 1.19
ZNF638-205ENST00000417778 SYNJ2O15056 1496 aa22.41■■□□□ 1.18
ZNF638-205ENST00000417778 TRIM41Q8WV44 630 aa22.39■■□□□ 1.17
ZNF638-205ENST00000417778 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.37■■□□□ 1.17
ZNF638-205ENST00000417778 CHD1O14646 1710 aa22.35■■□□□ 1.17
ZNF638-205ENST00000417778 PBRM1Q86U86 1689 aa22.32■■□□□ 1.16
ZNF638-205ENST00000417778 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.29■■□□□ 1.16
ZNF638-205ENST00000417778 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.29■■□□□ 1.16
ZNF638-205ENST00000417778 ARHGEF11O15085 1522 aa22.26■■□□□ 1.15
ZNF638-205ENST00000417778 KIF27Q86VH2 1401 aa22.25■■□□□ 1.15
ZNF638-205ENST00000417778 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.23■■□□□ 1.15
ZNF638-205ENST00000417778 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.23■■□□□ 1.15
ZNF638-205ENST00000417778 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.23■■□□□ 1.15
ZNF638-205ENST00000417778 GRIN2AQ12879 1464 aa22.22■■□□□ 1.15
ZNF638-205ENST00000417778 ADAMTS12P58397 1594 aa22.2■■□□□ 1.14
ZNF638-205ENST00000417778 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.18■■□□□ 1.14
ZNF638-205ENST00000417778 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.18■■□□□ 1.14
ZNF638-205ENST00000417778 NUP160Q12769 1436 aa22.13■■□□□ 1.13
ZNF638-205ENST00000417778 IGF1RP08069 1367 aa22.12■■□□□ 1.13
ZNF638-205ENST00000417778 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ZNF638-205ENST00000417778 ARAP1Q96P48 1450 aa22.05■■□□□ 1.12
ZNF638-205ENST00000417778 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.03■■□□□ 1.12
ZNF638-205ENST00000417778 CEP170Q5SW79 1584 aa22.02■■□□□ 1.12
ZNF638-205ENST00000417778 CUL7Q14999 1698 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms