RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417157.2

SLC13A3-205, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC13A3, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-205ENST00000417157 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.6■■■■□ 3.13
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SLC13A3-205ENST00000417157 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.1■■■□□ 2.25
SLC13A3-205ENST00000417157 NACADO15069 1562 aa29.04■■■□□ 2.24
SLC13A3-205ENST00000417157 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.91■■■□□ 2.22
SLC13A3-205ENST00000417157 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.86■■■□□ 2.21
SLC13A3-205ENST00000417157 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
SLC13A3-205ENST00000417157 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.68■■■□□ 2.18
SLC13A3-205ENST00000417157 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.29■■■□□ 2.12
SLC13A3-205ENST00000417157 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
SLC13A3-205ENST00000417157 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.12■■■□□ 2.09
SLC13A3-205ENST00000417157 SCRIBQ14160 1630 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC13A3-205ENST00000417157 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.01■■■□□ 2.07
SLC13A3-205ENST00000417157 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.72■■■□□ 2.03
SLC13A3-205ENST00000417157 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
SLC13A3-205ENST00000417157 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.34■■□□□ 1.97
SLC13A3-205ENST00000417157 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.2■■□□□ 1.95
SLC13A3-205ENST00000417157 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SLC13A3-205ENST00000417157 SMARCA4P51532 1647 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC13A3-205ENST00000417157 SMARCA2P51531 1590 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC13A3-205ENST00000417157 NCAPD3P42695 1498 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC13A3-205ENST00000417157 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC13A3-205ENST00000417157 HMGXB3Q12766 1538 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC13A3-205ENST00000417157 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC13A3-205ENST00000417157 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC13A3-205ENST00000417157 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SLC13A3-205ENST00000417157 WIZO95785 1651 aa26.31■■□□□ 1.8
SLC13A3-205ENST00000417157 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
SLC13A3-205ENST00000417157 ERCC6Q03468 1493 aa26.13■■□□□ 1.77
SLC13A3-205ENST00000417157 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SLC13A3-205ENST00000417157 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.11■■□□□ 1.77
SLC13A3-205ENST00000417157 NESP48681 1621 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC13A3-205ENST00000417157 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.98■■□□□ 1.75
SLC13A3-205ENST00000417157 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.95■■□□□ 1.74
SLC13A3-205ENST00000417157 CUX2O14529 1486 aa25.91■■□□□ 1.74
SLC13A3-205ENST00000417157 CFTRP13569 1480 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC13A3-205ENST00000417157 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.79■■□□□ 1.72
SLC13A3-205ENST00000417157 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SLC13A3-205ENST00000417157 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.75■■□□□ 1.71
SLC13A3-205ENST00000417157 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.69■■□□□ 1.7
SLC13A3-205ENST00000417157 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.68■■□□□ 1.7
SLC13A3-205ENST00000417157 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.67■■□□□ 1.7
SLC13A3-205ENST00000417157 WDR62O43379 1518 aa25.58■■□□□ 1.69
SLC13A3-205ENST00000417157 PRDM2Q13029 1718 aa25.58■■□□□ 1.69
SLC13A3-205ENST00000417157 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SLC13A3-205ENST00000417157 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SLC13A3-205ENST00000417157 ABCC8Q09428 1581 aa25.32■■□□□ 1.64
SLC13A3-205ENST00000417157 TOPBP1Q92547 1522 aa25.25■■□□□ 1.63
SLC13A3-205ENST00000417157 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.24■■□□□ 1.63
SLC13A3-205ENST00000417157 IFT140Q96RY7 1462 aa25.17■■□□□ 1.62
SLC13A3-205ENST00000417157 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC13A3-205ENST00000417157 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SLC13A3-205ENST00000417157 CUX1P39880 1505 aa24.99■■□□□ 1.59
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SLC13A3-205ENST00000417157 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.96■■□□□ 1.59
SLC13A3-205ENST00000417157 SOGA1O94964 1423 aa24.92■■□□□ 1.58
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SLC13A3-205ENST00000417157 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.88■■□□□ 1.57
SLC13A3-205ENST00000417157 WDR97A6NE52 1622 aa24.87■■□□□ 1.57
SLC13A3-205ENST00000417157 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
SLC13A3-205ENST00000417157 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.56
SLC13A3-205ENST00000417157 TOP2BQ02880 1626 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC13A3-205ENST00000417157 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.78■■□□□ 1.56
SLC13A3-205ENST00000417157 OSCARQ8IYS5 282 aa24.77■■□□□ 1.56
SLC13A3-205ENST00000417157 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SLC13A3-205ENST00000417157 SYNJ1O43426 1573 aa24.73■■□□□ 1.55
SLC13A3-205ENST00000417157 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.73■■□□□ 1.55
SLC13A3-205ENST00000417157 GRIN2BQ13224 1484 aa24.68■■□□□ 1.54
SLC13A3-205ENST00000417157 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.65■■□□□ 1.54
SLC13A3-205ENST00000417157 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
SLC13A3-205ENST00000417157 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.64■■□□□ 1.53
SLC13A3-205ENST00000417157 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.62■■□□□ 1.53
SLC13A3-205ENST00000417157 FBLN2P98095 1184 aa24.58■■□□□ 1.53
SLC13A3-205ENST00000417157 PBRM1Q86U86 1689 aa24.58■■□□□ 1.53
SLC13A3-205ENST00000417157 CHD1O14646 1710 aa24.58■■□□□ 1.52
SLC13A3-205ENST00000417157 SYNJ2O15056 1496 aa24.54■■□□□ 1.52
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SLC13A3-205ENST00000417157 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.45■■□□□ 1.5
SLC13A3-205ENST00000417157 ADAMTS12P58397 1594 aa24.42■■□□□ 1.5
SLC13A3-205ENST00000417157 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.38■■□□□ 1.49
SLC13A3-205ENST00000417157 KIF27Q86VH2 1401 aa24.36■■□□□ 1.49
SLC13A3-205ENST00000417157 ARHGEF11O15085 1522 aa24.36■■□□□ 1.49
SLC13A3-205ENST00000417157 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.35■■□□□ 1.49
SLC13A3-205ENST00000417157 GRIN2AQ12879 1464 aa24.35■■□□□ 1.49
SLC13A3-205ENST00000417157 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.35■■□□□ 1.49
SLC13A3-205ENST00000417157 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.35■■□□□ 1.49
SLC13A3-205ENST00000417157 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.35■■□□□ 1.49
SLC13A3-205ENST00000417157 TRIM41Q8WV44 630 aa24.28■■□□□ 1.48
SLC13A3-205ENST00000417157 NUP160Q12769 1436 aa24.25■■□□□ 1.47
SLC13A3-205ENST00000417157 CUL7Q14999 1698 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC13A3-205ENST00000417157 CEP170Q5SW79 1584 aa24.2■■□□□ 1.46
SLC13A3-205ENST00000417157 IGF1RP08069 1367 aa24.19■■□□□ 1.46
SLC13A3-205ENST00000417157 ARAP1Q96P48 1450 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC13A3-205ENST00000417157 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC13A3-205ENST00000417157 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.09■■□□□ 1.45
SLC13A3-205ENST00000417157 SHROOM2Q13796 1616 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC13A3-205ENST00000417157 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.05■■□□□ 1.44
SLC13A3-205ENST00000417157 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24■■□□□ 1.43
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