RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416106.1

RAB17-207, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 3

Gene RAB17, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17-207ENST00000416106 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.67■■■■□ 3.46
RAB17-207ENST00000416106 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.88■■■□□ 2.85
RAB17-207ENST00000416106 ABCC9O60706 1549 aa32.7■■■□□ 2.83
RAB17-207ENST00000416106 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.17■■■□□ 2.58
RAB17-207ENST00000416106 NACADO15069 1562 aa30.96■■■□□ 2.55
RAB17-207ENST00000416106 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.84■■■□□ 2.53
RAB17-207ENST00000416106 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.57■■■□□ 2.48
RAB17-207ENST00000416106 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.52■■■□□ 2.48
RAB17-207ENST00000416106 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
RAB17-207ENST00000416106 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.4■■■□□ 2.46
RAB17-207ENST00000416106 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.35■■■□□ 2.45
RAB17-207ENST00000416106 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.28■■■□□ 2.44
RAB17-207ENST00000416106 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.24■■■□□ 2.43
RAB17-207ENST00000416106 SCRIBQ14160 1630 aa30.07■■■□□ 2.4
RAB17-207ENST00000416106 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.79■■■□□ 2.36
RAB17-207ENST00000416106 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.53■■■□□ 2.32
RAB17-207ENST00000416106 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
RAB17-207ENST00000416106 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.38■■■□□ 2.29
RAB17-207ENST00000416106 SMARCA4P51532 1647 aa28.63■■■□□ 2.17
RAB17-207ENST00000416106 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.53■■■□□ 2.16
RAB17-207ENST00000416106 NCAPD3P42695 1498 aa28.52■■■□□ 2.16
RAB17-207ENST00000416106 SMARCA2P51531 1590 aa28.48■■■□□ 2.15
RAB17-207ENST00000416106 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
RAB17-207ENST00000416106 HMGXB3Q12766 1538 aa28.43■■■□□ 2.14
RAB17-207ENST00000416106 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
RAB17-207ENST00000416106 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.31■■■□□ 2.12
RAB17-207ENST00000416106 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.27■■■□□ 2.12
RAB17-207ENST00000416106 ERCC6Q03468 1493 aa28.21■■■□□ 2.11
RAB17-207ENST00000416106 NESP48681 1621 aa28.15■■■□□ 2.1
RAB17-207ENST00000416106 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.15■■■□□ 2.1
RAB17-207ENST00000416106 WIZO95785 1651 aa28.03■■■□□ 2.08
RAB17-207ENST00000416106 CUX2O14529 1486 aa28.01■■■□□ 2.07
RAB17-207ENST00000416106 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.93■■■□□ 2.06
RAB17-207ENST00000416106 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.87■■■□□ 2.05
RAB17-207ENST00000416106 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
RAB17-207ENST00000416106 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
RAB17-207ENST00000416106 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.7■■■□□ 2.03
RAB17-207ENST00000416106 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.67■■■□□ 2.02
RAB17-207ENST00000416106 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
RAB17-207ENST00000416106 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.53■■■□□ 2
RAB17-207ENST00000416106 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.48■■□□□ 1.99
RAB17-207ENST00000416106 WDR62O43379 1518 aa27.46■■□□□ 1.99
RAB17-207ENST00000416106 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.44■■□□□ 1.98
RAB17-207ENST00000416106 CFTRP13569 1480 aa27.43■■□□□ 1.98
RAB17-207ENST00000416106 PRDM2Q13029 1718 aa27.34■■□□□ 1.97
RAB17-207ENST00000416106 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.27■■□□□ 1.96
RAB17-207ENST00000416106 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
RAB17-207ENST00000416106 TOPBP1Q92547 1522 aa26.96■■□□□ 1.91
RAB17-207ENST00000416106 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.9■■□□□ 1.9
RAB17-207ENST00000416106 IFT140Q96RY7 1462 aa26.87■■□□□ 1.89
RAB17-207ENST00000416106 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
RAB17-207ENST00000416106 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
RAB17-207ENST00000416106 ABCC8Q09428 1581 aa26.8■■□□□ 1.88
RAB17-207ENST00000416106 TRIM41Q8WV44 630 aa26.77■■□□□ 1.88
RAB17-207ENST00000416106 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
RAB17-207ENST00000416106 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
RAB17-207ENST00000416106 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
RAB17-207ENST00000416106 OSCARQ8IYS5 282 aa26.66■■□□□ 1.86
RAB17-207ENST00000416106 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.61■■□□□ 1.85
RAB17-207ENST00000416106 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.852e-7■■■■□ 20.1
RAB17-207ENST00000416106 CUX1P39880 1505 aa26.6■■□□□ 1.85
RAB17-207ENST00000416106 CHD1O14646 1710 aa26.59■■□□□ 1.85
RAB17-207ENST00000416106 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.58■■□□□ 1.85
RAB17-207ENST00000416106 SOGA1O94964 1423 aa26.51■■□□□ 1.83
RAB17-207ENST00000416106 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.5■■□□□ 1.83
RAB17-207ENST00000416106 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.5■■□□□ 1.83
RAB17-207ENST00000416106 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.5■■□□□ 1.83
RAB17-207ENST00000416106 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
RAB17-207ENST00000416106 WDR97A6NE52 1622 aa26.45■■□□□ 1.82
RAB17-207ENST00000416106 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.41■■□□□ 1.82
RAB17-207ENST00000416106 ARHGEF11O15085 1522 aa26.4■■□□□ 1.82
RAB17-207ENST00000416106 FBLN2P98095 1184 aa26.38■■□□□ 1.81
RAB17-207ENST00000416106 PBRM1Q86U86 1689 aa26.35■■□□□ 1.81
RAB17-207ENST00000416106 GRIN2BQ13224 1484 aa26.3■■□□□ 1.8
RAB17-207ENST00000416106 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
RAB17-207ENST00000416106 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.27■■□□□ 1.8
RAB17-207ENST00000416106 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.25■■□□□ 1.79
RAB17-207ENST00000416106 SYNJ1O43426 1573 aa26.24■■□□□ 1.79
RAB17-207ENST00000416106 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.24■■□□□ 1.79
RAB17-207ENST00000416106 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.23■■□□□ 1.79
RAB17-207ENST00000416106 TOP2BQ02880 1626 aa26.21■■□□□ 1.79
RAB17-207ENST00000416106 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.19■■□□□ 1.78
RAB17-207ENST00000416106 SYNJ2O15056 1496 aa26.19■■□□□ 1.78
RAB17-207ENST00000416106 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
RAB17-207ENST00000416106 ARAP1Q96P48 1450 aa26.17■■□□□ 1.78
RAB17-207ENST00000416106 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
RAB17-207ENST00000416106 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.1■■□□□ 1.77
RAB17-207ENST00000416106 ADAMTS12P58397 1594 aa26.07■■□□□ 1.76
RAB17-207ENST00000416106 GRIN2AQ12879 1464 aa25.98■■□□□ 1.75
RAB17-207ENST00000416106 CEP170Q5SW79 1584 aa25.95■■□□□ 1.74
RAB17-207ENST00000416106 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.91■■□□□ 1.74
RAB17-207ENST00000416106 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.88■■□□□ 1.73
RAB17-207ENST00000416106 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.86■■□□□ 1.73
RAB17-207ENST00000416106 NUP160Q12769 1436 aa25.85■■□□□ 1.73
RAB17-207ENST00000416106 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
RAB17-207ENST00000416106 SHROOM2Q13796 1616 aa25.77■■□□□ 1.72
RAB17-207ENST00000416106 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.72■■□□□ 1.71
RAB17-207ENST00000416106 CUL7Q14999 1698 aa25.65■■□□□ 1.7
RAB17-207ENST00000416106 KIF27Q86VH2 1401 aa25.64■■□□□ 1.7
RAB17-207ENST00000416106 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms