RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413069.5

PCBP1-AS1-203, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCBP1-AS1, Length 563 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 NISCHQ9Y2I1 1504 aa11.86□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa10.45□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 ABCC9O60706 1549 aa10.14□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 DCAF8L2P0C7V8 631 aa9.9□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 NACADO15069 1562 aa9.83□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 MYO15BQ96JP2 1530 aa9.82□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa9.82□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa9.8□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 SCRIBQ14160 1630 aa9.55□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 UNC13AQ9UPW8 1703 aa9.5□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 BICRAQ9NZM4 1560 aa9.48□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa9.45□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 CECR2Q9BXF3 1484 aa9.21□□□□□ -0.93
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.2□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa9.16□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 SMARCA4P51532 1647 aa9.15□□□□□ -0.94
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 MROH2BQ7Z745 1585 aa9.13□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa9.1□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 SMARCA2P51531 1590 aa9.08□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 NCAPD3P42695 1498 aa9.08□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 PEG3Q9GZU2 1588 aa9.07□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 HMGXB3Q12766 1538 aa9.03□□□□□ -0.96
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 WIZO95785 1651 aa9.01□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 CCDC88BA6NC98 1476 aa8.85□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.84□□□□□ -0.99
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.81□□□□□ -1
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 NESP48681 1621 aa8.8□□□□□ -1
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 CFTRP13569 1480 aa8.79□□□□□ -1
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.78□□□□□ -1
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 ERCC6Q03468 1493 aa8.74□□□□□ -1.01
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.72□□□□□ -1.01
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 SLC24A1O60721 1099 aa8.66□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 PRDM2Q13029 1718 aa8.66□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.65□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.65□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 ABCC8Q09428 1581 aa8.61□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 WDR62O43379 1518 aa8.6□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 CUX2O14529 1486 aa8.6□□□□□ -1.03
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 CHIC1Q5VXU3 224 aa8.58□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 TOPBP1Q92547 1522 aa8.58□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.57□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 CUX1P39880 1505 aa8.56□□□□□ -1.04
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.51□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 IFT140Q96RY7 1462 aa8.51□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 TOP2BQ02880 1626 aa8.51□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 SOGA1O94964 1423 aa8.51□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 SYNJ1O43426 1573 aa8.51□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.49□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 TRIM41Q8WV44 630 aa8.48□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.48□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.44□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 WDR97A6NE52 1622 aa8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.4□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 KIF27Q86VH2 1401 aa8.39□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 GRIN2BQ13224 1484 aa8.38□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.35□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 ERICH3Q5RHP9 1530 aa8.34□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 IGF1RP08069 1367 aa8.34□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 FBLN2P98095 1184 aa8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 MYT1Q01538 1121 aa8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 EEA1Q15075 1411 aa8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 SYNJ2O15056 1496 aa8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 PBRM1Q86U86 1689 aa8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 OSCARQ8IYS5 282 aa8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 CSRNP3Q8WYN3 585 aa8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 ADAMTS12P58397 1594 aa8.28□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 CUL7Q14999 1698 aa8.27□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 GRIN2AQ12879 1464 aa8.27□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.26□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 PRXQ9BXM0 1461 aa8.25□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 CHD1O14646 1710 aa8.24□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 NUP160Q12769 1436 aa8.23□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-203ENST00000413069 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.3 ms