RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412065.1

AC006994.2-201, humanhuman

TSL 4

Gene AC006994.2, Length 506 nt, Biotype bidirectional promoter lncRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC006994.2-201ENST00000412065 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.02■■■□□ 2.56
AC006994.2-201ENST00000412065 ABCC9O60706 1549 aa28.52■■■□□ 2.16
AC006994.2-201ENST00000412065 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.03■■■□□ 2.08
AC006994.2-201ENST00000412065 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.07■■□□□ 1.92
AC006994.2-201ENST00000412065 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.91■■□□□ 1.9
AC006994.2-201ENST00000412065 NACADO15069 1562 aa26.58■■□□□ 1.85
AC006994.2-201ENST00000412065 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.55■■□□□ 1.84
AC006994.2-201ENST00000412065 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
AC006994.2-201ENST00000412065 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.36■■□□□ 1.81
AC006994.2-201ENST00000412065 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.12■■□□□ 1.77
AC006994.2-201ENST00000412065 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.98■■□□□ 1.75
AC006994.2-201ENST00000412065 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.71■■□□□ 1.71
AC006994.2-201ENST00000412065 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.7■■□□□ 1.7
AC006994.2-201ENST00000412065 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.63■■□□□ 1.69
AC006994.2-201ENST00000412065 SCRIBQ14160 1630 aa25.61■■□□□ 1.69
AC006994.2-201ENST00000412065 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
AC006994.2-201ENST00000412065 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
AC006994.2-201ENST00000412065 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.53■■□□□ 1.68
AC006994.2-201ENST00000412065 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.14■■□□□ 1.62
AC006994.2-201ENST00000412065 CUX2O14529 1486 aa24.67■■□□□ 1.54
AC006994.2-201ENST00000412065 ERCC6Q03468 1493 aa24.67■■□□□ 1.54
AC006994.2-201ENST00000412065 NCAPD3P42695 1498 aa24.51■■□□□ 1.51
AC006994.2-201ENST00000412065 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.42■■□□□ 1.5
AC006994.2-201ENST00000412065 NESP48681 1621 aa24.37■■□□□ 1.49
AC006994.2-201ENST00000412065 SMARCA2P51531 1590 aa24.33■■□□□ 1.49
AC006994.2-201ENST00000412065 SMARCA4P51532 1647 aa24.32■■□□□ 1.48
AC006994.2-201ENST00000412065 HMGXB3Q12766 1538 aa24.31■■□□□ 1.48
AC006994.2-201ENST00000412065 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
AC006994.2-201ENST00000412065 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
AC006994.2-201ENST00000412065 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
AC006994.2-201ENST00000412065 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.08■■□□□ 1.45
AC006994.2-201ENST00000412065 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.08■■□□□ 1.44
AC006994.2-201ENST00000412065 TRIM41Q8WV44 630 aa24.02■■□□□ 1.44
AC006994.2-201ENST00000412065 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.01■■□□□ 1.43
AC006994.2-201ENST00000412065 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.96■■□□□ 1.43
AC006994.2-201ENST00000412065 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.93■■□□□ 1.42
AC006994.2-201ENST00000412065 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.78■■□□□ 1.4
AC006994.2-201ENST00000412065 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.78■■□□□ 1.4
AC006994.2-201ENST00000412065 WDR62O43379 1518 aa23.72■■□□□ 1.39
AC006994.2-201ENST00000412065 WIZO95785 1651 aa23.67■■□□□ 1.38
AC006994.2-201ENST00000412065 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.62■■□□□ 1.37
AC006994.2-201ENST00000412065 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.56■■□□□ 1.36
AC006994.2-201ENST00000412065 OSCARQ8IYS5 282 aa23.52■■□□□ 1.36
AC006994.2-201ENST00000412065 CFTRP13569 1480 aa23.41■■□□□ 1.34
AC006994.2-201ENST00000412065 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
AC006994.2-201ENST00000412065 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.29■■□□□ 1.32
AC006994.2-201ENST00000412065 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.29■■□□□ 1.32
AC006994.2-201ENST00000412065 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.29■■□□□ 1.32
AC006994.2-201ENST00000412065 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
AC006994.2-201ENST00000412065 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
AC006994.2-201ENST00000412065 PRDM2Q13029 1718 aa23.23■■□□□ 1.31
AC006994.2-201ENST00000412065 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
AC006994.2-201ENST00000412065 ARHGEF11O15085 1522 aa23.14■■□□□ 1.3
AC006994.2-201ENST00000412065 IFT140Q96RY7 1462 aa23.14■■□□□ 1.29
AC006994.2-201ENST00000412065 TOPBP1Q92547 1522 aa23.05■■□□□ 1.28
AC006994.2-201ENST00000412065 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.05■■□□□ 1.28
AC006994.2-201ENST00000412065 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
AC006994.2-201ENST00000412065 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.04■■□□□ 1.28
AC006994.2-201ENST00000412065 CHD1O14646 1710 aa23■■□□□ 1.27
AC006994.2-201ENST00000412065 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
AC006994.2-201ENST00000412065 FBLN2P98095 1184 aa22.95■■□□□ 1.26
AC006994.2-201ENST00000412065 ABCC8Q09428 1581 aa22.93■■□□□ 1.26
AC006994.2-201ENST00000412065 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.93■■□□□ 1.26
AC006994.2-201ENST00000412065 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
AC006994.2-201ENST00000412065 ARAP1Q96P48 1450 aa22.88■■□□□ 1.25
AC006994.2-201ENST00000412065 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
AC006994.2-201ENST00000412065 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
AC006994.2-201ENST00000412065 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.75■■□□□ 1.23
AC006994.2-201ENST00000412065 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
AC006994.2-201ENST00000412065 SOGA1O94964 1423 aa22.69■■□□□ 1.22
AC006994.2-201ENST00000412065 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.68■■□□□ 1.22
AC006994.2-201ENST00000412065 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
AC006994.2-201ENST00000412065 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
AC006994.2-201ENST00000412065 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.62■■□□□ 1.21
AC006994.2-201ENST00000412065 SYNJ1O43426 1573 aa22.62■■□□□ 1.21
AC006994.2-201ENST00000412065 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.6■■□□□ 1.21
AC006994.2-201ENST00000412065 WDR97A6NE52 1622 aa22.57■■□□□ 1.2
AC006994.2-201ENST00000412065 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
AC006994.2-201ENST00000412065 GRIN2BQ13224 1484 aa22.53■■□□□ 1.2
AC006994.2-201ENST00000412065 CUX1P39880 1505 aa22.51■■□□□ 1.19
AC006994.2-201ENST00000412065 SYNJ2O15056 1496 aa22.49■■□□□ 1.19
AC006994.2-201ENST00000412065 PBRM1Q86U86 1689 aa22.49■■□□□ 1.19
AC006994.2-201ENST00000412065 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.45■■□□□ 1.18
AC006994.2-201ENST00000412065 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.31■■□□□ 1.16
AC006994.2-201ENST00000412065 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.3■■□□□ 1.16
AC006994.2-201ENST00000412065 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.27■■□□□ 1.16
AC006994.2-201ENST00000412065 GRIN2AQ12879 1464 aa22.24■■□□□ 1.15
AC006994.2-201ENST00000412065 CEP170Q5SW79 1584 aa22.21■■□□□ 1.15
AC006994.2-201ENST00000412065 ADAMTS12P58397 1594 aa22.19■■□□□ 1.14
AC006994.2-201ENST00000412065 NUP160Q12769 1436 aa22.14■■□□□ 1.13
AC006994.2-201ENST00000412065 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.13■■□□□ 1.13
AC006994.2-201ENST00000412065 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
AC006994.2-201ENST00000412065 SHROOM2Q13796 1616 aa22.11■■□□□ 1.13
AC006994.2-201ENST00000412065 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.08■■□□□ 1.13
AC006994.2-201ENST00000412065 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
AC006994.2-201ENST00000412065 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.04■■□□□ 1.12
AC006994.2-201ENST00000412065 TOP2BQ02880 1626 aa22.02■■□□□ 1.12
AC006994.2-201ENST00000412065 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
AC006994.2-201ENST00000412065 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22■■□□□ 1.11
AC006994.2-201ENST00000412065 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms