RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411670.5

CCDC18-AS1-201, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 675 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ABCC9O60706 1549 aa18.84■□□□□ 0.61
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.52■□□□□ 0.55
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.96■□□□□ 0.47
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.74■□□□□ 0.43
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NACADO15069 1562 aa17.57■□□□□ 0.4
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.5■□□□□ 0.39
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.4■□□□□ 0.38
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.39■□□□□ 0.37
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.34■□□□□ 0.37
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.24■□□□□ 0.35
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.99■□□□□ 0.31
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.98■□□□□ 0.31
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.98■□□□□ 0.31
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.94■□□□□ 0.3
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SCRIBQ14160 1630 aa16.92■□□□□ 0.3
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.3
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.6■□□□□ 0.25
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CUX2O14529 1486 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NCAPD3P42695 1498 aa16.25■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ERCC6Q03468 1493 aa16.22■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.19■□□□□ 0.18
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NESP48681 1621 aa16.14■□□□□ 0.17
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 HMGXB3Q12766 1538 aa16.1■□□□□ 0.17
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SMARCA4P51532 1647 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SMARCA2P51531 1590 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.93■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.87■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.8■□□□□ 0.12
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TRIM41Q8WV44 630 aa15.76■□□□□ 0.11
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.74■□□□□ 0.11
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.72■□□□□ 0.11
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 WDR62O43379 1518 aa15.71■□□□□ 0.11
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 WIZO95785 1651 aa15.65■□□□□ 0.1
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.59■□□□□ 0.09
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.57■□□□□ 0.08
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CFTRP13569 1480 aa15.52■□□□□ 0.08
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 OSCARQ8IYS5 282 aa15.47■□□□□ 0.07
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.37■□□□□ 0.05
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.37■□□□□ 0.05
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.37■□□□□ 0.05
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ARHGEF11O15085 1522 aa15.3■□□□□ 0.04
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 IFT140Q96RY7 1462 aa15.29■□□□□ 0.04
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PRDM2Q13029 1718 aa15.29■□□□□ 0.04
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TOPBP1Q92547 1522 aa15.26■□□□□ 0.03
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.26■□□□□ 0.03
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.16■□□□□ 0.02
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.16■□□□□ 0.02
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ARAP1Q96P48 1450 aa15.15■□□□□ 0.02
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CHD1O14646 1710 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ABCC8Q09428 1581 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.07■□□□□ 0
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 FBLN2P98095 1184 aa15.05■□□□□ -0
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CLASP1Q7Z460 1538 aa15□□□□□ -0.01
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15□□□□□ -0.01
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SOGA1O94964 1423 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.96□□□□□ -0.01
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CUX1P39880 1505 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 WDR97A6NE52 1622 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SYNJ1O43426 1573 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GRIN2BQ13224 1484 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SYNJ2O15056 1496 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PBRM1Q86U86 1689 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GRIN2AQ12879 1464 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CEP170Q5SW79 1584 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ADAMTS12P58397 1594 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NUP160Q12769 1436 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SHROOM2Q13796 1616 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TOP2BQ02880 1626 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 189 ms