RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399687.3

ABCD1P4-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene ABCD1P4, Length 604 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P4-201ENST00000399687 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.92■■■□□ 2.86
ABCD1P4-201ENST00000399687 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.36■■■□□ 2.29
ABCD1P4-201ENST00000399687 ABCC9O60706 1549 aa28.38■■■□□ 2.13
ABCD1P4-201ENST00000399687 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.53■■■□□ 2
ABCD1P4-201ENST00000399687 NACADO15069 1562 aa27.52■■■□□ 2
ABCD1P4-201ENST00000399687 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
ABCD1P4-201ENST00000399687 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.41■■□□□ 1.98
ABCD1P4-201ENST00000399687 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.37■■□□□ 1.97
ABCD1P4-201ENST00000399687 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.33■■□□□ 1.97
ABCD1P4-201ENST00000399687 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.82■■□□□ 1.88
ABCD1P4-201ENST00000399687 SCRIBQ14160 1630 aa26.68■■□□□ 1.86
ABCD1P4-201ENST00000399687 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.52■■□□□ 1.84
ABCD1P4-201ENST00000399687 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.51■■□□□ 1.83
ABCD1P4-201ENST00000399687 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
ABCD1P4-201ENST00000399687 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
ABCD1P4-201ENST00000399687 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.74■■□□□ 1.71
ABCD1P4-201ENST00000399687 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.69■■□□□ 1.7
ABCD1P4-201ENST00000399687 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
ABCD1P4-201ENST00000399687 SMARCA4P51532 1647 aa25.55■■□□□ 1.68
ABCD1P4-201ENST00000399687 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.54■■□□□ 1.68
ABCD1P4-201ENST00000399687 SMARCA2P51531 1590 aa25.43■■□□□ 1.66
ABCD1P4-201ENST00000399687 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.31■■□□□ 1.64
ABCD1P4-201ENST00000399687 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.31■■□□□ 1.64
ABCD1P4-201ENST00000399687 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.31■■□□□ 1.64
ABCD1P4-201ENST00000399687 NCAPD3P42695 1498 aa25.3■■□□□ 1.64
ABCD1P4-201ENST00000399687 HMGXB3Q12766 1538 aa25.28■■□□□ 1.64
ABCD1P4-201ENST00000399687 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ABCD1P4-201ENST00000399687 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
ABCD1P4-201ENST00000399687 WIZO95785 1651 aa25.07■■□□□ 1.6
ABCD1P4-201ENST00000399687 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ABCD1P4-201ENST00000399687 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.71■■□□□ 1.55
ABCD1P4-201ENST00000399687 ERCC6Q03468 1493 aa24.59■■□□□ 1.53
ABCD1P4-201ENST00000399687 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.56■■□□□ 1.52
ABCD1P4-201ENST00000399687 NESP48681 1621 aa24.55■■□□□ 1.52
ABCD1P4-201ENST00000399687 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
ABCD1P4-201ENST00000399687 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.52■■□□□ 1.52
ABCD1P4-201ENST00000399687 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.5■■□□□ 1.51
ABCD1P4-201ENST00000399687 CFTRP13569 1480 aa24.46■■□□□ 1.51
ABCD1P4-201ENST00000399687 PRDM2Q13029 1718 aa24.45■■□□□ 1.5
ABCD1P4-201ENST00000399687 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.39■■□□□ 1.49
ABCD1P4-201ENST00000399687 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.32■■□□□ 1.48
ABCD1P4-201ENST00000399687 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.31■■□□□ 1.48
ABCD1P4-201ENST00000399687 CUX2O14529 1486 aa24.27■■□□□ 1.48
ABCD1P4-201ENST00000399687 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ABCD1P4-201ENST00000399687 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.24■■□□□ 1.47
ABCD1P4-201ENST00000399687 WDR62O43379 1518 aa24.15■■□□□ 1.46
ABCD1P4-201ENST00000399687 ABCC8Q09428 1581 aa24.06■■□□□ 1.44
ABCD1P4-201ENST00000399687 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
ABCD1P4-201ENST00000399687 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.98■■□□□ 1.43
ABCD1P4-201ENST00000399687 TOPBP1Q92547 1522 aa23.92■■□□□ 1.42
ABCD1P4-201ENST00000399687 IFT140Q96RY7 1462 aa23.79■■□□□ 1.4
ABCD1P4-201ENST00000399687 CUX1P39880 1505 aa23.76■■□□□ 1.39
ABCD1P4-201ENST00000399687 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
ABCD1P4-201ENST00000399687 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P4-201ENST00000399687 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.69■■□□□ 1.38
ABCD1P4-201ENST00000399687 TOP2BQ02880 1626 aa23.69■■□□□ 1.38
ABCD1P4-201ENST00000399687 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.69■■□□□ 1.38
ABCD1P4-201ENST00000399687 WDR97A6NE52 1622 aa23.65■■□□□ 1.38
ABCD1P4-201ENST00000399687 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
ABCD1P4-201ENST00000399687 SOGA1O94964 1423 aa23.62■■□□□ 1.37
ABCD1P4-201ENST00000399687 SYNJ1O43426 1573 aa23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P4-201ENST00000399687 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ABCD1P4-201ENST00000399687 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.54■■□□□ 1.36
ABCD1P4-201ENST00000399687 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ABCD1P4-201ENST00000399687 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P4-201ENST00000399687 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
ABCD1P4-201ENST00000399687 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ABCD1P4-201ENST00000399687 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.41■■□□□ 1.34
ABCD1P4-201ENST00000399687 PBRM1Q86U86 1689 aa23.4■■□□□ 1.34
ABCD1P4-201ENST00000399687 GRIN2BQ13224 1484 aa23.39■■□□□ 1.34
ABCD1P4-201ENST00000399687 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.39■■□□□ 1.34
ABCD1P4-201ENST00000399687 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P4-201ENST00000399687 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.3■■□□□ 1.32
ABCD1P4-201ENST00000399687 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P4-201ENST00000399687 KIF27Q86VH2 1401 aa23.26■■□□□ 1.31
ABCD1P4-201ENST00000399687 CHD1O14646 1710 aa23.26■■□□□ 1.31
ABCD1P4-201ENST00000399687 TRIM41Q8WV44 630 aa23.24■■□□□ 1.31
ABCD1P4-201ENST00000399687 SYNJ2O15056 1496 aa23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P4-201ENST00000399687 OSCARQ8IYS5 282 aa23.21■■□□□ 1.31
ABCD1P4-201ENST00000399687 ADAMTS12P58397 1594 aa23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P4-201ENST00000399687 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.19■■□□□ 1.3
ABCD1P4-201ENST00000399687 FBLN2P98095 1184 aa23.17■■□□□ 1.3
ABCD1P4-201ENST00000399687 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
ABCD1P4-201ENST00000399687 CUL7Q14999 1698 aa23.15■■□□□ 1.3
ABCD1P4-201ENST00000399687 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.14■■□□□ 1.29
ABCD1P4-201ENST00000399687 GRIN2AQ12879 1464 aa23.08■■□□□ 1.29
ABCD1P4-201ENST00000399687 IGF1RP08069 1367 aa23■■□□□ 1.27
ABCD1P4-201ENST00000399687 EEA1Q15075 1411 aa22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P4-201ENST00000399687 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.97■■□□□ 1.27
ABCD1P4-201ENST00000399687 NUP160Q12769 1436 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD1P4-201ENST00000399687 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCD1P4-201ENST00000399687 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCD1P4-201ENST00000399687 CEP170Q5SW79 1584 aa22.91■■□□□ 1.26
ABCD1P4-201ENST00000399687 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.87■■□□□ 1.25
ABCD1P4-201ENST00000399687 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.86■■□□□ 1.25
ABCD1P4-201ENST00000399687 ARHGEF11O15085 1522 aa22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P4-201ENST00000399687 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P4-201ENST00000399687 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P4-201ENST00000399687 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P4-201ENST00000399687 SHROOM2Q13796 1616 aa22.79■■□□□ 1.24
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