RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396779.7

TIMM17B-202, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TIMM17B, Length 1,099 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-202ENST00000396779 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.38■■■■■ 4.21
TIMM17B-202ENST00000396779 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.75■■■■□ 3.47
TIMM17B-202ENST00000396779 ABCC9O60706 1549 aa36.09■■■■□ 3.37
TIMM17B-202ENST00000396779 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.59■■■■□ 3.13
TIMM17B-202ENST00000396779 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.53■■■■□ 3.12
TIMM17B-202ENST00000396779 NACADO15069 1562 aa34.53■■■■□ 3.12
TIMM17B-202ENST00000396779 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
TIMM17B-202ENST00000396779 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.38■■■■□ 3.09
TIMM17B-202ENST00000396779 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.27■■■■□ 3.08
TIMM17B-202ENST00000396779 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.85■■■■□ 3.01
TIMM17B-202ENST00000396779 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.66■■■□□ 2.98
TIMM17B-202ENST00000396779 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.59■■■□□ 2.97
TIMM17B-202ENST00000396779 SCRIBQ14160 1630 aa33.5■■■□□ 2.95
TIMM17B-202ENST00000396779 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.43■■■□□ 2.94
TIMM17B-202ENST00000396779 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.18■■■□□ 2.9
TIMM17B-202ENST00000396779 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
TIMM17B-202ENST00000396779 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.66■■■□□ 2.82
TIMM17B-202ENST00000396779 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.47■■■□□ 2.79
TIMM17B-202ENST00000396779 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
TIMM17B-202ENST00000396779 SMARCA4P51532 1647 aa32.08■■■□□ 2.73
TIMM17B-202ENST00000396779 SMARCA2P51531 1590 aa31.87■■■□□ 2.69
TIMM17B-202ENST00000396779 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.87■■■□□ 2.69
TIMM17B-202ENST00000396779 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.86■■■□□ 2.69
TIMM17B-202ENST00000396779 NCAPD3P42695 1498 aa31.84■■■□□ 2.69
TIMM17B-202ENST00000396779 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.77■■■□□ 2.68
TIMM17B-202ENST00000396779 HMGXB3Q12766 1538 aa31.7■■■□□ 2.67
TIMM17B-202ENST00000396779 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
TIMM17B-202ENST00000396779 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
TIMM17B-202ENST00000396779 WIZO95785 1651 aa31.54■■■□□ 2.64
TIMM17B-202ENST00000396779 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
TIMM17B-202ENST00000396779 NESP48681 1621 aa31.15■■■□□ 2.58
TIMM17B-202ENST00000396779 ERCC6Q03468 1493 aa31.11■■■□□ 2.57
TIMM17B-202ENST00000396779 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.03■■■□□ 2.56
TIMM17B-202ENST00000396779 CUX2O14529 1486 aa30.93■■■□□ 2.54
TIMM17B-202ENST00000396779 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.92■■■□□ 2.54
TIMM17B-202ENST00000396779 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
TIMM17B-202ENST00000396779 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.86■■■□□ 2.53
TIMM17B-202ENST00000396779 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.81■■■□□ 2.52
TIMM17B-202ENST00000396779 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.8■■■□□ 2.52
TIMM17B-202ENST00000396779 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
TIMM17B-202ENST00000396779 CFTRP13569 1480 aa30.76■■■□□ 2.52
TIMM17B-202ENST00000396779 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.57■■■□□ 2.48
TIMM17B-202ENST00000396779 PRDM2Q13029 1718 aa30.56■■■□□ 2.48
TIMM17B-202ENST00000396779 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.53■■■□□ 2.48
TIMM17B-202ENST00000396779 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.51■■■□□ 2.48
TIMM17B-202ENST00000396779 WDR62O43379 1518 aa30.47■■■□□ 2.47
TIMM17B-202ENST00000396779 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.34■■■□□ 2.45
TIMM17B-202ENST00000396779 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
TIMM17B-202ENST00000396779 ABCC8Q09428 1581 aa30.15■■■□□ 2.42
TIMM17B-202ENST00000396779 TOPBP1Q92547 1522 aa30.08■■■□□ 2.41
TIMM17B-202ENST00000396779 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.07■■■□□ 2.4
TIMM17B-202ENST00000396779 CUX1P39880 1505 aa29.89■■■□□ 2.38
TIMM17B-202ENST00000396779 IFT140Q96RY7 1462 aa29.87■■■□□ 2.37
TIMM17B-202ENST00000396779 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
TIMM17B-202ENST00000396779 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.79■■■□□ 2.36
TIMM17B-202ENST00000396779 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
TIMM17B-202ENST00000396779 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.78■■■□□ 2.36
TIMM17B-202ENST00000396779 SOGA1O94964 1423 aa29.74■■■□□ 2.35
TIMM17B-202ENST00000396779 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
TIMM17B-202ENST00000396779 TOP2BQ02880 1626 aa29.7■■■□□ 2.34
TIMM17B-202ENST00000396779 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.69■■■□□ 2.34
TIMM17B-202ENST00000396779 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.68■■■□□ 2.34
TIMM17B-202ENST00000396779 SYNJ1O43426 1573 aa29.66■■■□□ 2.34
TIMM17B-202ENST00000396779 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
TIMM17B-202ENST00000396779 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.324e-6■■■■■ 31
TIMM17B-202ENST00000396779 OSCARQ8IYS5 282 aa29.56■■■□□ 2.32
TIMM17B-202ENST00000396779 WDR97A6NE52 1622 aa29.56■■■□□ 2.32
TIMM17B-202ENST00000396779 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
TIMM17B-202ENST00000396779 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.51■■■□□ 2.32
TIMM17B-202ENST00000396779 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.39■■■□□ 2.3
TIMM17B-202ENST00000396779 GRIN2BQ13224 1484 aa29.37■■■□□ 2.29
TIMM17B-202ENST00000396779 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.37■■■□□ 2.29
TIMM17B-202ENST00000396779 CHD1O14646 1710 aa29.35■■■□□ 2.29
TIMM17B-202ENST00000396779 PBRM1Q86U86 1689 aa29.31■■■□□ 2.28
TIMM17B-202ENST00000396779 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.29■■■□□ 2.28
TIMM17B-202ENST00000396779 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
TIMM17B-202ENST00000396779 FBLN2P98095 1184 aa29.22■■■□□ 2.27
TIMM17B-202ENST00000396779 TRIM41Q8WV44 630 aa29.2■■■□□ 2.26
TIMM17B-202ENST00000396779 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.18■■■□□ 2.26
TIMM17B-202ENST00000396779 KIF27Q86VH2 1401 aa29.17■■■□□ 2.26
TIMM17B-202ENST00000396779 SYNJ2O15056 1496 aa29.17■■■□□ 2.26
TIMM17B-202ENST00000396779 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
TIMM17B-202ENST00000396779 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.16■■■□□ 2.26
TIMM17B-202ENST00000396779 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.16■■■□□ 2.26
TIMM17B-202ENST00000396779 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.16■■■□□ 2.26
TIMM17B-202ENST00000396779 ARHGEF11O15085 1522 aa29.11■■■□□ 2.25
TIMM17B-202ENST00000396779 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.07■■■□□ 2.24
TIMM17B-202ENST00000396779 ADAMTS12P58397 1594 aa29.07■■■□□ 2.24
TIMM17B-202ENST00000396779 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.03■■■□□ 2.24
TIMM17B-202ENST00000396779 IGF1RP08069 1367 aa29.01■■■□□ 2.23
TIMM17B-202ENST00000396779 GRIN2AQ12879 1464 aa28.98■■■□□ 2.23
TIMM17B-202ENST00000396779 CUL7Q14999 1698 aa28.95■■■□□ 2.22
TIMM17B-202ENST00000396779 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.91■■■□□ 2.22
TIMM17B-202ENST00000396779 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.88■■■□□ 2.21
TIMM17B-202ENST00000396779 ARAP1Q96P48 1450 aa28.86■■■□□ 2.21
TIMM17B-202ENST00000396779 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.86■■■□□ 2.21
TIMM17B-202ENST00000396779 NUP160Q12769 1436 aa28.85■■■□□ 2.21
TIMM17B-202ENST00000396779 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.83■■■□□ 2.21
TIMM17B-202ENST00000396779 CEP170Q5SW79 1584 aa28.81■■■□□ 2.2
TIMM17B-202ENST00000396779 EEA1Q15075 1411 aa28.72■■■□□ 2.19
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