RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393038.2

PTRH2-201, Transcript of peptidyl-tRNA hydrolase 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTRH2, Length 901 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRH2-201ENST00000393038 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.94■■■□□ 2.22
PTRH2-201ENST00000393038 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.7■■□□□ 1.71
PTRH2-201ENST00000393038 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PTRH2-201ENST00000393038 ABCC9O60706 1549 aa25.09■■□□□ 1.61
PTRH2-201ENST00000393038 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.45■■□□□ 1.5
PTRH2-201ENST00000393038 NACADO15069 1562 aa24.18■■□□□ 1.46
PTRH2-201ENST00000393038 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.18■■□□□ 1.46
PTRH2-201ENST00000393038 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.12■■□□□ 1.45
PTRH2-201ENST00000393038 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PTRH2-201ENST00000393038 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.09■■□□□ 1.45
PTRH2-201ENST00000393038 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.98■■□□□ 1.43
PTRH2-201ENST00000393038 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.59■■□□□ 1.37
PTRH2-201ENST00000393038 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
PTRH2-201ENST00000393038 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.44■■□□□ 1.34
PTRH2-201ENST00000393038 SCRIBQ14160 1630 aa23.41■■□□□ 1.34
PTRH2-201ENST00000393038 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.25■■□□□ 1.31
PTRH2-201ENST00000393038 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.04■■□□□ 1.28
PTRH2-201ENST00000393038 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTRH2-201ENST00000393038 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.71■■□□□ 1.23
PTRH2-201ENST00000393038 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.57■■□□□ 1.2
PTRH2-201ENST00000393038 SMARCA4P51532 1647 aa22.42■■□□□ 1.18
PTRH2-201ENST00000393038 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTRH2-201ENST00000393038 NCAPD3P42695 1498 aa22.33■■□□□ 1.16
PTRH2-201ENST00000393038 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.32■■□□□ 1.16
PTRH2-201ENST00000393038 SMARCA2P51531 1590 aa22.29■■□□□ 1.16
PTRH2-201ENST00000393038 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.28■■□□□ 1.16
PTRH2-201ENST00000393038 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.25■■□□□ 1.15
PTRH2-201ENST00000393038 HMGXB3Q12766 1538 aa22.2■■□□□ 1.14
PTRH2-201ENST00000393038 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTRH2-201ENST00000393038 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTRH2-201ENST00000393038 WIZO95785 1651 aa22.01■■□□□ 1.11
PTRH2-201ENST00000393038 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PTRH2-201ENST00000393038 NESP48681 1621 aa21.72■■□□□ 1.07
PTRH2-201ENST00000393038 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.7■■□□□ 1.06
PTRH2-201ENST00000393038 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.67■■□□□ 1.06
PTRH2-201ENST00000393038 ERCC6Q03468 1493 aa21.64■■□□□ 1.05
PTRH2-201ENST00000393038 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.57■■□□□ 1.04
PTRH2-201ENST00000393038 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.57■■□□□ 1.04
PTRH2-201ENST00000393038 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTRH2-201ENST00000393038 CFTRP13569 1480 aa21.55■■□□□ 1.04
PTRH2-201ENST00000393038 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTRH2-201ENST00000393038 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTRH2-201ENST00000393038 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.45■■□□□ 1.02
PTRH2-201ENST00000393038 CUX2O14529 1486 aa21.44■■□□□ 1.02
PTRH2-201ENST00000393038 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTRH2-201ENST00000393038 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.39■■□□□ 1.02
PTRH2-201ENST00000393038 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.36■■□□□ 1.01
PTRH2-201ENST00000393038 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.33■■□□□ 1.01
PTRH2-201ENST00000393038 PRDM2Q13029 1718 aa21.33■■□□□ 1.01
PTRH2-201ENST00000393038 WDR62O43379 1518 aa21.26■□□□□ 0.99
PTRH2-201ENST00000393038 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
PTRH2-201ENST00000393038 ABCC8Q09428 1581 aa21.09■□□□□ 0.97
PTRH2-201ENST00000393038 TOPBP1Q92547 1522 aa21.06■□□□□ 0.96
PTRH2-201ENST00000393038 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.03■□□□□ 0.96
PTRH2-201ENST00000393038 IFT140Q96RY7 1462 aa20.94■□□□□ 0.94
PTRH2-201ENST00000393038 CUX1P39880 1505 aa20.89■□□□□ 0.94
PTRH2-201ENST00000393038 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PTRH2-201ENST00000393038 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.82■□□□□ 0.92
PTRH2-201ENST00000393038 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PTRH2-201ENST00000393038 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PTRH2-201ENST00000393038 SOGA1O94964 1423 aa20.8■□□□□ 0.92
PTRH2-201ENST00000393038 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.92
PTRH2-201ENST00000393038 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.77■□□□□ 0.92
PTRH2-201ENST00000393038 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.76■□□□□ 0.91
PTRH2-201ENST00000393038 TOP2BQ02880 1626 aa20.73■□□□□ 0.91
PTRH2-201ENST00000393038 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.72■□□□□ 0.91
PTRH2-201ENST00000393038 SYNJ1O43426 1573 aa20.71■□□□□ 0.91
PTRH2-201ENST00000393038 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PTRH2-201ENST00000393038 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.94e-6■□□□□ 10.8
PTRH2-201ENST00000393038 WDR97A6NE52 1622 aa20.69■□□□□ 0.9
PTRH2-201ENST00000393038 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
PTRH2-201ENST00000393038 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.65■□□□□ 0.9
PTRH2-201ENST00000393038 OSCARQ8IYS5 282 aa20.56■□□□□ 0.88
PTRH2-201ENST00000393038 GRIN2BQ13224 1484 aa20.56■□□□□ 0.88
PTRH2-201ENST00000393038 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.56■□□□□ 0.88
PTRH2-201ENST00000393038 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.53■□□□□ 0.88
PTRH2-201ENST00000393038 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTRH2-201ENST00000393038 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.5■□□□□ 0.87
PTRH2-201ENST00000393038 PBRM1Q86U86 1689 aa20.47■□□□□ 0.87
PTRH2-201ENST00000393038 FBLN2P98095 1184 aa20.43■□□□□ 0.86
PTRH2-201ENST00000393038 CHD1O14646 1710 aa20.43■□□□□ 0.86
PTRH2-201ENST00000393038 SYNJ2O15056 1496 aa20.43■□□□□ 0.86
PTRH2-201ENST00000393038 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PTRH2-201ENST00000393038 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.41■□□□□ 0.86
PTRH2-201ENST00000393038 KIF27Q86VH2 1401 aa20.36■□□□□ 0.85
PTRH2-201ENST00000393038 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.34■□□□□ 0.85
PTRH2-201ENST00000393038 ADAMTS12P58397 1594 aa20.34■□□□□ 0.85
PTRH2-201ENST00000393038 TRIM41Q8WV44 630 aa20.31■□□□□ 0.84
PTRH2-201ENST00000393038 IGF1RP08069 1367 aa20.29■□□□□ 0.84
PTRH2-201ENST00000393038 GRIN2AQ12879 1464 aa20.29■□□□□ 0.84
PTRH2-201ENST00000393038 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.25■□□□□ 0.83
PTRH2-201ENST00000393038 NUP160Q12769 1436 aa20.22■□□□□ 0.83
PTRH2-201ENST00000393038 CUL7Q14999 1698 aa20.19■□□□□ 0.82
PTRH2-201ENST00000393038 ARHGEF11O15085 1522 aa20.19■□□□□ 0.82
PTRH2-201ENST00000393038 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.17■□□□□ 0.82
PTRH2-201ENST00000393038 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.17■□□□□ 0.82
PTRH2-201ENST00000393038 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.17■□□□□ 0.82
PTRH2-201ENST00000393038 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.16■□□□□ 0.82
PTRH2-201ENST00000393038 CEP170Q5SW79 1584 aa20.16■□□□□ 0.82
PTRH2-201ENST00000393038 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.15■□□□□ 0.82
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