RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 NISCHQ9Y2I1 1504 aa14.23□□□□□ -0.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABCC9O60706 1549 aa13.15□□□□□ -0.3
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa12.91□□□□□ -0.34
RNU6-171P-201ENST00000384354 DNAJC5BQ9UF47 199 aa12.59□□□□□ -0.39
RNU6-171P-201ENST00000384354 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa12.34□□□□□ -0.43
RNU6-171P-201ENST00000384354 UNC13AQ9UPW8 1703 aa12.33□□□□□ -0.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP12.18□□□□□ -0.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 NACADO15069 1562 aa12.18□□□□□ -0.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 BICRAQ9NZM4 1560 aa12.14□□□□□ -0.47
RNU6-171P-201ENST00000384354 DCAF8L2P0C7V8 631 aa12.01□□□□□ -0.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.89□□□□□ -0.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYO15BQ96JP2 1530 aa11.89□□□□□ -0.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 CECR2Q9BXF3 1484 aa11.82□□□□□ -0.52
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCRIBQ14160 1630 aa11.82□□□□□ -0.52
RNU6-171P-201ENST00000384354 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RNU6-171P-201ENST00000384354 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa11.72□□□□□ -0.53
RNU6-171P-201ENST00000384354 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa11.68□□□□□ -0.54
RNU6-171P-201ENST00000384354 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa11.59□□□□□ -0.55
RNU6-171P-201ENST00000384354 CUX2O14529 1486 aa11.33□□□□□ -0.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 NESP48681 1621 aa11.29□□□□□ -0.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERCC6Q03468 1493 aa11.28□□□□□ -0.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 NCAPD3P42695 1498 aa11.24□□□□□ -0.61
RNU6-171P-201ENST00000384354 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa11.22□□□□□ -0.61
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMARCA4P51532 1647 aa11.21□□□□□ -0.61
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.2□□□□□ -0.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 HMGXB3Q12766 1538 aa11.18□□□□□ -0.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMARCA2P51531 1590 aa11.14□□□□□ -0.63
RNU6-171P-201ENST00000384354 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
RNU6-171P-201ENST00000384354 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.06□□□□□ -0.64
RNU6-171P-201ENST00000384354 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa11.06□□□□□ -0.64
RNU6-171P-201ENST00000384354 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.03□□□□□ -0.64
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM41Q8WV44 630 aa11.03□□□□□ -0.64
RNU6-171P-201ENST00000384354 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
RNU6-171P-201ENST00000384354 WDR62O43379 1518 aa10.94□□□□□ -0.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 WIZO95785 1651 aa10.94□□□□□ -0.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.93□□□□□ -0.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDS5BQ9NTI5 1447 aa10.91□□□□□ -0.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 CADPSQ9ULU8 1353 aa10.87□□□□□ -0.67
RNU6-171P-201ENST00000384354 CEP164Q9UPV0 1460 aa10.82□□□□□ -0.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa10.81□□□□□ -0.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa10.81□□□□□ -0.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa10.81□□□□□ -0.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.8□□□□□ -0.68
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRDM2Q13029 1718 aa10.77□□□□□ -0.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 CFTRP13569 1480 aa10.73□□□□□ -0.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 OSCARQ8IYS5 282 aa10.7□□□□□ -0.7
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHD1O14646 1710 aa10.7□□□□□ -0.7
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARHGEF11O15085 1522 aa10.68□□□□□ -0.7
RNU6-171P-201ENST00000384354 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
RNU6-171P-201ENST00000384354 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
RNU6-171P-201ENST00000384354 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
RNU6-171P-201ENST00000384354 TOPBP1Q92547 1522 aa10.6□□□□□ -0.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARAP1Q96P48 1450 aa10.6□□□□□ -0.71
RNU6-171P-201ENST00000384354 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
RNU6-171P-201ENST00000384354 IFT140Q96RY7 1462 aa10.58□□□□□ -0.72
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC88BA6NC98 1476 aa10.55□□□□□ -0.72
RNU6-171P-201ENST00000384354 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.54□□□□□ -0.72
RNU6-171P-201ENST00000384354 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.53□□□□□ -0.72
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYB5RLQ6IPT4 315 aa10.53□□□□□ -0.72
RNU6-171P-201ENST00000384354 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.48□□□□□ -0.73
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLASP1Q7Z460 1538 aa10.48□□□□□ -0.73
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
RNU6-171P-201ENST00000384354 WDR97A6NE52 1622 aa10.44□□□□□ -0.74
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.43□□□□□ -0.74
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABCC8Q09428 1581 aa10.41□□□□□ -0.74
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBLN2P98095 1184 aa10.41□□□□□ -0.74
RNU6-171P-201ENST00000384354 PBRM1Q86U86 1689 aa10.41□□□□□ -0.74
RNU6-171P-201ENST00000384354 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
RNU6-171P-201ENST00000384354 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.38□□□□□ -0.75
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERCC6L2Q5T890 1561 aa10.38□□□□□ -0.75
RNU6-171P-201ENST00000384354 CUX1P39880 1505 aa10.38□□□□□ -0.75
RNU6-171P-201ENST00000384354 SYNJ1O43426 1573 aa10.36□□□□□ -0.75
RNU6-171P-201ENST00000384354 SOGA1O94964 1423 aa10.34□□□□□ -0.75
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIF13AQ9H1H9 1805 aa10.33□□□□□ -0.76
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RNU6-171P-201ENST00000384354 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.3□□□□□ -0.76
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.3□□□□□ -0.76
RNU6-171P-201ENST00000384354 SYNJ2O15056 1496 aa10.3□□□□□ -0.76
RNU6-171P-201ENST00000384354 GRIN2BQ13224 1484 aa10.29□□□□□ -0.76
RNU6-171P-201ENST00000384354 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
RNU6-171P-201ENST00000384354 CEP170Q5SW79 1584 aa10.26□□□□□ -0.77
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADAMTS12P58397 1594 aa10.24□□□□□ -0.77
RNU6-171P-201ENST00000384354 SHROOM2Q13796 1616 aa10.23□□□□□ -0.77
RNU6-171P-201ENST00000384354 GRIN2AQ12879 1464 aa10.21□□□□□ -0.78
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.21□□□□□ -0.78
RNU6-171P-201ENST00000384354 NUP160Q12769 1436 aa10.17□□□□□ -0.78
RNU6-171P-201ENST00000384354 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa10.15□□□□□ -0.78
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSPOAP1O95153 1857 aa10.15□□□□□ -0.78
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADCY10Q96PN6 1610 aa10.11□□□□□ -0.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 DIP2BQ9P265 1576 aa10.11□□□□□ -0.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa10.11□□□□□ -0.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 TOP2BQ02880 1626 aa10.11□□□□□ -0.79
RNU6-171P-201ENST00000384354 FHAD1B1AJZ9 1412 aa10.07□□□□□ -0.8
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms